田擎
- 作品数：12 被引量：19H指数：3
- 供职机构：南京农业大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划公益性行业(农业)科研专项国家质检总局科技计划项目更多>>
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- 平头炭疸菌、黑白轮枝菌、大丽轮枝菌及大豆根部病原菌的LAMP检测
- 田擎
- 文献传递
- 基于环介导等温扩增技术快速诊断由黄色镰孢菌引起的大豆镰孢根腐病
- 大豆镰孢根腐病是由多种镰孢菌引起的以导致根部和茎基部腐烂为主要症状的病害的通称。本研究基于环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术,以CYP51C为靶标...
- 曾丹丹田擎郑小波
- 文献传递
- 利用环介导等温扩增技术检测黑白轮枝菌被引量：4
- 2016年
- [目的]黑白轮枝菌(Verticillium albo-atrum)能够危害苜蓿等多种作物,是我国重要的检疫性病原真菌。我们基于环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),建立基于颜色判定的简单、快速和灵敏的黑白轮枝菌检测方法。[方法]基于LAMP技术,通过比对分析黑白轮枝菌与其相似种不同靶标序列间的差异,选取Tub(β-tublin,编码β-微管蛋白)基因作为靶标基因,设计并筛选了4条特异性强、灵敏度高的LAMP引物和1条环引物,在此基础上建立了检测黑白轮枝菌的LAMP体系,并进行特异性、灵敏度试验及田间发病组织的检测。该方法在62℃等温条件下进行核酸扩增反应70 min,扩增前加入染料HNB(羟基萘酚蓝),反应后根据染料颜色变化判定扩增结果。[结果]特异性试验中,仅黑白轮枝菌菌株DNA扩增后呈天蓝色的阳性反应,而在其他真菌的供试菌株中均呈紫色的阴性反应。该方法的最低检测限为1 pg·μL^(-1)。Tub-LAMP技术能够检测出发病苜蓿植物组织中的目标菌,在采自新疆的7份疑似样本中检测到3份阳性。在土壤中人工添加孢子的试验中,Tub-LAMP技术能够从每0.25 g土壤含有10个孢子和每10 g苜蓿种子含有50个孢子中检测出该病菌。[结论]该方法的建立为黑白轮枝菌的检疫及其所致病害的诊断提供了新的技术。
- 田擎曾丹丹李彬张海峰王源超郑小波
- 关键词：环介导等温扩增
- 一种检测胶孢炭疽菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用
- 本发明公开了一种检测胶孢炭疽菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用。以谷氨酰胺合成酶基因为靶标基因，设计并筛选出可用于LAMP检测胶孢炭疽菌的特异性强、灵敏度高的引物，由SEQ ID NO.2所示的正向外引物GS-F3，S...
- 郑小波王帅帅陆辰晨田擎张海峰王源超
- 文献传递
- 基于环介导等温扩增技术检测黄淮地区大豆主栽品种种子携带的病原菌被引量：11
- 2016年
- [目的]通过对黄淮地区大豆种子带菌的快速检测,了解该地区大豆种子携带病原菌的情况。[方法]采用环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测黄淮地区29个大豆主栽品种种子上平头炭疽菌、胶孢炭疽菌、尖镰孢菌、木贼镰孢菌、层出镰孢菌、黄色镰孢菌、禾谷镰孢菌、茄腐镰孢菌、大豆拟茎点种腐病菌、立枯丝核菌、大豆炭腐病菌、冬青丽赤壳菌、大豆疫霉病菌等大豆主要病原菌的携带情况。[结果]供试的29个品种中有20个品种的种子样本检出携带上述病原菌,分别携带所检测的13种病原菌中的7种,检出率由高到低依次为平头炭疽菌、大豆拟茎点种腐病菌、木贼镰孢菌、黄色镰孢菌、尖镰孢菌、胶孢炭疽菌和层出镰孢菌,但不同大豆品种种子携带病原菌的种类及数量有较大差异,其中品种‘漯39001’检出的病原菌多达6种。[结论]本研究为大豆种子带菌检测提供了新的方法,并揭示了黄淮地区大豆种子携带病原菌的状况,在生产上有较大的应用价值。
- 曾丹丹张海峰田擎许苗王源超郑小波
- 关键词：大豆种子带菌环介导等温扩增技术
- 环介导等温扩增技术检测大丽轮枝菌被引量：4
- 2016年
- 本研究基于环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),通过比对分析大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)与其相近种不同靶标序列间的差异,选取G pd(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,甘油醛-3-磷酸脱氢酶)基因作为靶标基因,设计并筛选了四条特异性强、灵敏度高的LAMP引物和两条环引物,建立了一种基于颜色判定的简单、快速和灵敏的大丽轮枝菌的检测方法,并进行了特异性、灵敏度实验及田间发病组织的检测。该方法在62℃等温条件下进行核酸扩增反应70 min,扩增前加入染料HNB(羟基萘酚蓝),反应后根据染料颜色变化判定扩增结果。特异性试验中,仅含有大丽轮枝菌菌株DNA的反应管扩增后呈天蓝色的阳性反应,而其他供试菌株均呈紫色的阴性反应。该方法的最低检测限为100 pg·μL^(-1),在土壤中检测的灵敏度为10个孢子/0.25g土壤。该技术能够检测出棉花发病组织中的目标菌,对采自江苏和山东的24份疑似病害样本进行检测,11份为阳性。该方法的建立为大丽轮枝菌的检测及其所致病害的诊断提供了新的技术。
- 田擎张海峰曾丹丹姚艳任林荣王源超郑小波
- 关键词：大丽轮枝菌环介导等温扩增
- 平头炭疽菌、黑白轮枝菌、大丽轮枝菌及大豆根部病原菌的LAMP检测
- 平头炭疽菌（Colletotrichum truncatum）引起的大豆炭疽病是影响大豆生长的重要病害，每年对我国的大豆生产造成严重损失。黑白轮枝菌（Verticillium albo-atrum）和大丽轮枝菌（V.da...
- 田擎
- 关键词：大丽轮枝菌
- 文献传递
- 一种检测黄色镰孢菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用
- 本发明公开了一种检测黄色镰孢菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用。所述的引物组合物由SEQIDNO.2所示的正向外引物CYP51C-F3，SEQIDNO.3所示的反向外引物CYP51C-B3，SEQIDNO.4所示的正向...
- 郑小波曾丹丹田擎张海峰王源超
- 文献传递
- 一种检测平头炭疽菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用
- 本发明公开了一种检测平头炭疽菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用。所述的引物组合物由SEQ ID NO.2所示的正向外引物Rpb1‑F3，SEQ ID NO.3所示的反向外引物Rpb1‑B3，SEQ ID NO.4所示的...
- 郑小波田擎陆辰晨王帅帅张海峰王源超
- 文献传递
- 一种检测平头炭疽菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用
- 本发明公开了一种检测平头炭疽菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用。所述的引物组合物由SEQ ID NO.2所示的正向外引物Rpb1-F3，SEQ ID NO.3所示的反向外引物Rpb1-B3，SEQ ID NO.4所示的...
- 郑小波田擎陆辰晨王帅帅张海峰王源超
