刘芳
- 作品数：10 被引量：22H指数：3
- 供职机构：首都儿科研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金首都卫生发展科研专项北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 纤毛通路基因罕见危害性基因变异对人腰骶部神经管畸形的致病性
- 2022年
- 目的探索纤毛通路基因的罕见危害性基因变异对人腰骶部神经管畸形(NTDs)的致病性。方法AmpliSeq技术扩增49个纤毛通路基因的编码区序列,PGM测序平台筛查罕见危害性变异,以无NTD表型父母为对照筛选NTD相关致病性变异。结果1例患者存在GLI3基因的罕见新生突变(c.C580T,p.H194Y);1例患者存在CRB2基因的罕见复杂杂合突变(c.G1392C,p.R464S;c.T3448C,p.C1150R)。结论纤毛通路基因的罕见危害性变异可能与人类NTDs发生相关。
- 汪静刘芳谢华蔡春泉姜宏陈晓丽
- 探索全外显子测序在儿童神经发育障碍中的诊断价值被引量：8
- 2017年
- 目的 评估全外显子测序在儿童神经发育障碍中的诊断价值.方法 方法学评价.对2015年12月至2016年12月间首都儿科研究所附属儿童医院门诊和病房收治的35例不明原因神经发育障碍患儿,收集患儿临床资料,运用全外显子测序技术进行检测,完成遗传病因诊断.利用多种生物信息学软件分析测序数据,结合患儿的表型寻找潜在致病基因/基因组变异,根据美国医学遗传学与基因组学学会的基因变异解读指南完成变异致病性评估,同时利用Sanger测序、Real-time PCR、MLPA方法完成患者验证及家系成员的分离分析.结果 35例不明原因的神经发育障碍患儿中,检测出致病性单核苷酸变异（SNVs）14个、致病性基因组拷贝数变异（CNVs）3个,检出率为48.6%.14例致病性SNVs中,11例是OMIM中有明确致病基因的综合征（如CHARGE 综合征、Wiedemann-Steiner综合征、Cockayne综合征等）,其中新生变异共6个,占54.6%（6/11）.利用全外显子测序数据筛选出了3个致病性CNVs,包括2个微重复和1个微缺失.同时,还发现一例携带MECP2移码变异的女性患儿,其父亲精子DNA携带该位点的低频细胞嵌合体变异,变异频率为8.4%.结论 全外显子测序对儿童神经发育障碍的病因诊断率可达48.6%,全外显子测序数据除了检测出致病性/可能致病性的SNVs,还可以筛选出致病性CNVs,从而有效提高疾病诊断率.
- 谢华吕凌云高志杰彭继苹刘芳姬辛娜陈晓波李辉冯硕张建昭张裕吴南陈倩陈晓丽
- 关键词：发育障碍
- 一种诱导性多能干细胞、制备方法及应用
- 本发明公开了一种诱导性多能干细胞、制备方法及应用。该iPSCs包括两个细胞株，分别为保藏编号为CCTCC NO：C2021248的遗传性非孤独症的iPS细胞株16p11.2‑681M(Homo sapiens)，和保藏编...
- 陈晓丽梁晨刘芳
- 体细胞变异对神经系统常见肿瘤和发育异常类疾病的致病性被引量：2
- 2016年
- 在生物体发育过程中各种内源性及外源性因素均可造成DNA损伤,引起体细胞变异。研究表明体细胞变异对肿瘤具有致病性作用,而体细胞变异对神经系统发育异常类疾病的致病性鲜有报道。新一代测序技术的发展,尤其是全外显子测序、靶向深度测序的应用大大提高了低频体细胞变异检出的敏感性,使科研人员重新认识了体细胞变异在神经系统肿瘤和发育异常类疾病发生中的致病性。本文综述了体细胞变异在神经系统肿瘤和发育异常类疾病致病性方面的研究进展,旨在为今后研究该类疾病的遗传病因提供新的思路,同时也为新药开发提供理论依据。
- 刘芳宋小珍谢华陈晓丽
- 关键词：体细胞变异神经系统肿瘤
- X染色体变异对男性精神发育迟滞致病性的研究进展被引量：5
- 2017年
- 精神发育迟滞(旧称智力低下)作为儿科神经科常见的一组疾患,具有高度的遗传和表型异质性,大约25%~50%的精神发育迟滞是由遗传因素引起的,其中X染色体基因/基因组变异占25%~30%,导致X连锁的精神发育迟滞。X连锁的精神发育迟滞患者占所有精神发育迟滞患者的10%~15%以上,约20%~25%的男性精神发育迟滞归因于X连锁的精神发育迟滞。精神发育迟滞男女患病比例为1.3:1,这与男性只有一条X染色体的遗传背景有关。随着新一代基因组检测技术的快速发展和临床应用,尤其是全外显子测序、高深度测序、X染色体深度测序和全基因组芯片杂交,这些大大改善了精神发育迟滞患者的X染色体基因/基因组变异检出。本文综述了致精神发育迟滞的X染色体基因组/基因变异特点、其对男性精神发育迟滞的致病性,以及如何采用新测序技术提高检出率,旨在促进科研人员认识X染色体变异在男性精神发育迟滞的致病性,拓宽精神发育迟滞遗传病因的认识,同时也为遗传咨询和产前诊断提供理论依据。
- 彭继苹刘芳谢华陈晓丽
- 关键词：拷贝数变异
- 一种适用于预冲注射器的外置刻度装置
- 本实用新型实施例公开了一种适用于预冲注射器的外置刻度装置，属于医疗器械技术领域，包括手持柄、限位杆和标尺套，手持柄卡设在注射器针筒上，且手持柄位于注射器针筒的顶端，手持柄向下延伸设有标尺套，且标尺套半包裹于注射器针筒上，...
- 王彦华刘芳房萍
- 孤独症的早期诊断和遗传研究进展被引量：6
- 2019年
- 孤独症谱系障碍(ADS)也称自闭症,是一种儿童时期多发的精神异常疾病,主要表现为社会性沟通障碍、兴趣狭窄和重复刻板行为。孤独症是世界范围内影响儿童健康的最严重公共问题之一。目前根据现有诊断标准,患儿3岁时才能确诊其是否患病,诊断周期较长也因此导致延误了最佳的干预治疗时间。本文对近年来在ASD早期症状评估和遗传学方面的研究进展进行综述,以期为开展ASD早期诊断和干预治疗提供证据支持。
- 梁晨刘芳陈晓丽
- 关键词：孤独症谱系障碍早期症状
- 经典进行性骨化性纤维发育不良症临床及ACVR1基因突变分析被引量：1
- 2018年
- 目的报道3例具有经典临床特征的骨化性纤维发育不良的患儿,对其致病基因ACVR1变异和变异来源进行分析。方法整理3例病例的临床、影像学和随访资料。采用Sanger测序的方法对致病性热点变异位点ACVR1基因R206H位点进行检测,设计长片段PCR避免同源序列非特异扩增,利用实时定量PCR技术分析是否存在拷贝数变异,通过高通量测序检测变异来源。结果3例患儿明确有先天性大拇趾缩短畸形、进行性异位骨化的临床特征,影像学显示双足拇指短缩畸形,多发不规则骨化影。均无家族史。3例患儿存在相同的ACVR1基因杂合错义变异(c.617G>A;R206H)。实时定量PCR显示3例患儿及其父母不存在拷贝数变异。同时高通量测序显示其父母不存在嵌合变异,且患儿的变异频率在50%左右。结论3例患儿具有典型骨化性纤维发育不良的临床及影像学表现,利用Sanger测序确诊。通过高通量测序的新方法、实时定量PCR技术证实患儿有新生杂合变异。
- 李宏智孙海林谢华刘芳彭继苹陈晓丽
- 关键词：进行性骨化性纤维发育不良实时定量PCR高通量测序
- Y染色体AZFc区域部分缺失与精神发育迟滞伴小阴茎关联性分析
- 2015年
- 目的采用基因芯片技术筛查精神发育迟滞伴小阴茎男童的基因组微失衡,探讨Y染色体无精子症因子C区(AZFc)部分缺失对其的致病性。方法提取1例精神发育迟滞伴小阴茎男童(先证者)及其父亲外周血DNA,利用Cyto One Array染色体芯片行全基因组微失衡初筛,之后采用定制4×180K SNP+CNV精神发育相关芯片行全基因组微失衡筛查。选择特异性STS标签s Y1191,s Y1291作为引物,利用PCR特异性扩增11例正常男童,9/20例4×180K SNP+CNV芯片检测异常的精神发育迟滞未伴小阴茎男童,先证者及其父亲的Y染色体AZFc区域。进一步对170例精神发育迟滞未伴小阴茎男童行PCR扩增,分析AZFc区域缺失频率。结果 1Cyto One Array染色体芯片检测发现先证者存在AZFc区域全缺失(chr Y:24646690-28103711),定制4×180K SNP+CNV精神发育相关芯片排除其他精神发育相关基因组微失衡,发现AZFc区域部分缺失(chr Y:24873066-25203027;chr Y:25850255-26245019),结果不同于Cyto One Array染色体芯片。220例精神发育迟滞伴小阴茎男童行4×180K CNV+SNP芯片检测,5例存在Y染色体AZFc区域部分缺失,但缺失起止点不同;4例为已知的致精神发育异常的基因组微失衡。3PCR验证表明先证者及其父亲为AZFc区域b2/b3缺失,此片段缺失同时存在于1/11例正常男童、4/9例精神发育迟滞未伴小阴茎男童。4精神发育迟滞未伴小阴茎男童AZFc区域b2/b3缺失频率为15.1%(27/179)。结论 AZFc区域b2/b3缺失可能不是精神发育迟滞伴小阴茎男童的致病病因,此AZFc区域部分缺失在中国人群中为多态性位点。
- 王珺刘芳谢华吴欣洁金春华陈晓丽
- 关键词：精神发育迟滞多态性位点基因芯片技术
- 一种16p11.2微缺失综合征相关孤独症诱导性多能干细胞、制备方法及应用
- 本发明公开了一种16p11.2微缺失综合征相关孤独症诱导性多能干细胞、制备方法及应用。该iPSCs包括两个细胞株，分别为保藏编号为CCTCC NO：C2021248的遗传性非孤独症的iPS细胞株16p11.2‑681M(...
- 陈晓丽梁晨刘芳
