杨坤
- 作品数:8 被引量:16H指数:2
- 供职机构:江西农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划江西省教育厅科技计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学轻工技术与工程一般工业技术更多>>
- 紫鸭跖草CpBURP的克隆、表达及生物信息学分析
- 2021年
- BURP蛋白在植物生长发育、抵抗非生物胁迫中具有重要的作用。克隆CpBURP,并分析其在紫鸭跖草中的作用,为后期紫鸭跖草的BURP基因的深入研究奠定基础。根据紫鸭跖草转录组数据库进行筛选,并克隆CpBURP,通过对其进行生物信息学分析及表达分析。结果表明,1383 bp的CpBURP编码含460个氨基酸的蛋白质,CpBURP蛋白属于亲水蛋白,含有一个BURP保守结构域和50个磷酸化位点,不含跨膜结构和信号肽区域。预测CpBURP蛋白作用于细胞质和过氧化物酶体。系统进化树显示,CpBURP蛋白与13种植物的BURP蛋白被分为6个亚类,CpBURP蛋白与甘蓝型油菜的BURP蛋白亲缘性最近。qRT-PCR结果显示,CpBURP在根中的表达量高于茎和叶,在Cu^(2+)胁迫条件下,根中CpBURP的表达量明显高于对照组。CpBURP可能在紫鸭跖草的Cu2+胁迫应答反应中具有重要作用。
- 彭国颖卢山黄超杨坤万玮黄长干
- 关键词:紫鸭跖草基因克隆生物信息学
- 江西龙虎山10种铁皮石斛的品质测定及分析被引量:4
- 2021年
- 为了分析龙虎山铁皮石斛资源的品质,对DNA条形码技术鉴定的10种铁皮石斛茎叶的4种营养成分(多糖、甘露糖、生物碱和蛋白质)和2种重金属元素(砷和镉)的含量进行测定,并采用主成分分析对铁皮石斛品质进行综合评价,运用聚类分析对铁皮石斛进行分类。结果显示:成熟的铁皮石斛中,茎和叶的多糖含量范围分别为35.09%~49.59%和6.88%~14.05%,甘露糖含量范围分别为16.19%~25.12%和11.10%~16.88%,生物碱含量范围分别为0.158‰~0.251‰和0.022‰~0.053‰,蛋白质含量范围分别为2.72%~4.38%和12.73%~18.38%;铁皮石斛(包括茎和叶)砷和镉含量最高值分别为1.892 mg/kg和0.234 mg/kg;人工种植铁皮石斛的营养成分总体高于野生铁皮石斛,铁皮石斛的叶具有一定的利用价值;野生与人工种植铁皮石斛砷、镉均未超标;铁皮石斛的6种测定成分可以用2种主成分(累积方差贡献率为98.443%)来表示,主成分分析综合得分最高的为米斛。本研究为龙虎山铁皮石斛的利用与开发提供了理论依据。
- 彭国颖卢山黄超杨坤胡亮黄长干
- 关键词:铁皮石斛茎叶聚类分析主成分分析
- 构树纤维增强/ABS基复合材料的制备及其性能的研究
- 材料是人类进行生产活动和提高生活水平的物质基础,每诞生一种新材料都标志着时代的重大进步。随着近代科学技术的需求,材料需要向着按照预定性能去设计的方式发展,复合材料的出现很好的解决了这一问题。复合材料在性能上更具有良好的可...
- 杨坤
- 关键词:构树纤维ABS树脂响应曲面法
- 文献传递
- 一种抑制灌浆期高温诱导稻米垩白形成的方法及其应用
- 本发明公开了水稻苗期高温锻炼有效抑制灌浆期高温诱导稻米垩白形成的方法及其应用,所述苗期高温锻炼能够显著降低水稻灌浆结实期高温生长条件下的稻米垩白粒率和垩白度,有利于稻米品质的提升,该技术方法可以应用于水稻灌浆结实期高温气...
- 曾勇军潘霞刘栋杨坤吴媛
- 紫鸭跖草热激转录因子基因家族鉴定及在Cu^(2+)胁迫下表达模式分析被引量:2
- 2022年
- 热激转录因子(Hsf)是植物中最重要的转录因子家族之一,在植物遭遇热、干旱和重金属等多种非生物胁迫中具有重要的作用。为明确紫鸭跖草Hsf基因家族的结构及功能,从紫鸭跖草全长转录组数据库筛选鉴定出20个SpbHsf基因,并运用生物信息学工具和qRT-PCR进行分析。结果显示:SpbHsf蛋白均为亲水性蛋白,定位于细胞核的SpbHsf蛋白有12个,所有SpbHsf蛋白二级结构的α螺旋和无规卷曲的含量较高。SpbHsf基因分为3个亚族,各亚族都包含独特的保守基序。全部SpbHsf蛋白含有DBD和HR-A/B结构域。系统进化分析显示,与SpbHsf蛋白同源性最高的是水稻OsHsf蛋白。20个SpbHsf基因在紫鸭跖草根组织中均有表达。相比于对照组,根组织在Cu^(2+)胁迫下,8个SpbHsf基因的表达量显著上调,8个SpbHsf基因的表达量显著下调。研究结果为紫鸭跖草Hsf基因家族的功能验证及表达模式提供了一定的理论参考。
- 彭国颖卢山杨坤万玮黄长干
- 关键词:紫鸭跖草热激转录因子生物信息学
- 基于转录组测序的紫鸭跖草根组织内参基因筛选及HSF基因家族初步分析
- 紫鸭跖草(Setcreaseapurpurea Boom)是超累积铜植物,前人在研究了铜盐胁迫下紫鸭跖草对营养元素的吸收和紫鸭跖草的生理生化特性等之后,发现紫鸭跖草在高铜溶液中培养会表达特异蛋白。此外,对在不同铜浓度胁迫...
- 杨坤
- 关键词:紫鸭跖草转录组测序内参基因热激转录因子
- 中草药复配液在脐橙保鲜中的应用研究被引量:7
- 2020年
- 以赣南脐橙为试材,研究了肉桂、丁香、丹皮、细辛、五倍子五种中草药提取液(浓度为1 g/mL)中的任意三种以1∶1∶1比例形成的10种复配液对意大利青霉和指状青霉的抑制效果以及效果最佳的复配液对脐橙的保鲜效果。结果表明,复配液CM-7(丁香、细辛、丹皮)对指状青霉和意大利青霉的抑菌圈直径分别为40.97 mm和39.03 mm,抑菌效果最好。对脐橙保鲜效果表明,与对照组相比,在贮藏中后期(40~90 d),CM-7处理降低了果实的腐烂率和失重率,延缓了VC和总糖含量的降解,保持了果实良好的营养品质。
- 卢山杨坤黄超占晨黄长干
- 关键词:中草药提取液复配抑菌保鲜
- 紫鸭跖草根组织应答铜胁迫的转录组分析被引量:2
- 2022年
- 紫鸭跖草是一种高耐铜的超积累植物,本研究首次应用RNA-Seq技术对其转录组进行分析。通过全长转录组分析组装了紫鸭跖草耐铜相关候选基因,通过转录组分析,共获得82 471条N50长度为2 299 bp的高质量unigene,为紫鸭跖草的进一步研究提供了丰富的数据。对照组(CK)、300 μmol/L胁迫组(CT1)和1 000 μmol/L胁迫组(CT2)的测序数据已保存在NCBI的SRA数据库中,登录号为SAMN11265427。CT1相比于CK,共有5 028条unigene在根组织中有显著性差异表达,约占全部unigene的6.10%,其中富集上调和下调的基因分别为3 138和1 890条;CT2相比于CT1,根中共有6 813个unigene富集差异表达,占所有unigene的8.26%。其中富集上调和下调的基因分别为2 555和4 258。随机选取10个基因进行qRT-PCR荧光定量分析,结果与Illumina测序数据一致,验证了基因数据差异表达的有效性。上述实验从分子水平上为研究铜胁迫下铜耐受的分子机制提供了理论依据。
- 彭国颖胡亮黄超杨坤万玮黄长干
- 关键词:紫鸭跖草铜胁迫转录组