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孙虹
作品数:
1
被引量:2
H指数:1
供职机构:
河北北方学院
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发文基金:
河北省教育厅科研基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
王国强
河北北方学院
高建朝
河北北方学院附属第一医院
李曙光
河北北方学院附属第一医院
赵轶峰
河北北方学院附属第一医院
杨永江
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2015
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应用DNA甲基化芯片对胃癌组织基因组甲基化的分析
被引量:2
2015年
目的应用DNA甲基化芯片检测胃癌组织基因组甲基化情况。方法采用甲基化DNA免疫沉淀方法(MeDIP)结合DNA甲基化芯片对6例胃癌及其癌旁组织进行甲基化情况分析,寻找启动子区域和CpG岛中胃癌组织与癌旁组织的甲基化差异基因,并通过GeneOntology分析和Pathway分析了解这些甲基化差异基因的功能。结果在基因启动子区,存在于胃癌组织中的甲基化差异基因有113个(如SHP1、FGF8和CSF2RA等),存在于癌旁组织中的甲基化差异基因有161个(如TNF、IGF2和BMP7等)。在CpG岛,存在于胃癌组织中的甲基化差异基因有123个(如WNT2B、JAK2和T阿1等),存在于癌旁组织中的甲基化差异基因有139个(如TNFRSF4、HOXC8和NFYA等)。这些基因位于不同的染色体上,胃癌组织中以1号和4号染色体最多(11个),18号和20号染色体最少(1个);癌旁组织中以11号染色体最多(17个),而Y染色体未见甲基化差异基因。这些基因涉及的功能包括蛋白磷酸化、调节细胞分解代谢、离子转运、酶活性调节、转录调控、细胞分裂、细胞周期调节和信号转导等。结论胃癌组织与癌旁组织存在许多甲基化差异基因.这些甲基化差异基因位于不同染色体上,其个数和分布差异很大,与多条肿瘤相关通路有关。
彭涛
杨永江
赵轶峰
高建朝
Muhammad Abbas
王国强
孙虹
李曙光
关键词:
胃肿瘤
DNA甲基化
基因芯片
表观遗传学
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