樊博 作品数:9 被引量:23 H指数:3 供职机构: 解放军309医院 更多>> 发文基金: 首都医学发展科研基金 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 机械工程 更多>>
应用PBT-X2型识别仪进行结核蛋白生物芯片检测 被引量:4 2007年 应用PBT-X2型生物芯片识别仪快速检测结核分支杆菌抗体。采用CCD原理结合视频采集技术,将生物芯片标本信息输入计算机,并通过专用分析软件对结核LAM、16-kDa、38-kDa蛋白芯片检测信号的定量分析和定性结果判定。分析了1 884人的3项指标检出率分别为45.6%、17.9%、22.0%,若蛋白芯片临界值控制好,对结核病的诊治具有参考价值。 李洪敏 王巍 陈红兵 樊博 刘亚军 梁建琴 王台虎 陈武雄 刘京关键词:分支杆菌 结核 蛋白芯片 应用rpoB基因PCR反向斑点杂交快速鉴定分枝杆菌菌种的研究 被引量:6 2006年 目的根据分枝杆菌rpoB基因序列建立一种准确、快速的分枝杆菌菌种鉴定方法。方法以分枝杆菌rpoB基因编码序列为靶基因,用聚合酶链反应(PCR)反向斑点杂交技术检测24种分枝杆菌标准株、8种非分枝杆菌标准株、37株分枝杆菌临床分离株。结果分枝杆菌与非分枝杆菌标准株经PCR扩增后,分枝杆菌标准株均扩增出360 bpDNA片段,非分枝杆菌除甲型溶血性链球菌和假白喉棒状杆菌出现同样片段外,其它菌种均未见扩增。敏感性试验可检测出1 pg结核分枝杆菌DNA。探针特异性试验表明,21种寡核苷酸探针除海分枝杆菌与偶然分枝杆菌的探针有交叉杂交,其余均为特异性杂交。应用该方法对37株分枝杆菌临床分离株进行鉴定,结果与常规方法鉴定结果相符。结论应用rpoB基因序列和PCR反向斑点杂交技术鉴定分枝杆菌菌种快速、准确,具有较高的应有价值。 樊博 王巍 李国利 李洪敏关键词:分枝杆菌 聚合酶链反应 寡核苷酸探针 核酸杂交 结核分枝杆菌PE和PPE家族蛋白抗原性的生物信息学分析 被引量:3 2010年 目的应用生物信息学工具预测结核分枝杆菌PE和PPE家族的分泌性蛋白及分析其抗原性,减少抗原选择的盲目性,增加可靠性。方法应用多种生物信息学工具SignalP、SecretomeP、DAS、NetMHC等分析结核分枝杆菌标准株H37Rv基因组中PE和PPE家族成员的蛋白序列,找出可能的分泌性蛋白以及其抗原决定簇序列。结果在共168个PE和PPE家族成员中预测出23个可能的分泌性蛋白(PE家族20个,PPE家族3个),其中19个包含有与MHCⅠ和Ⅱ类分子高亲和力的肽段。结论结核分枝杆菌PE、PPE家族蛋白可以通过生物信息学工具分析预测其抗原性,辅助指导实验。 樊博 王巍 程小星关键词:分枝杆菌 结核 计算生物学 抗原变异 利用rpoB基因芯片技术进行快速分枝杆菌菌种鉴定 被引量:6 2008年 利用rpoB基因芯片技术快速进行分枝杆菌菌种鉴定。以分枝杆菌rpoB基因编码序列为靶基因,用基因芯片技术检测21种分枝杆菌标准株;8种其它细菌标准株;126株临床分离株。分枝杆菌与其它细菌标准株经PCR扩增后,分枝杆菌标准株均扩增出360 bp DNA片段,在其它细菌中,除甲型溶血性链球菌和假白喉棒状杆菌出现同样片段外,其它细菌均未见扩增。21种寡核苷酸探针除海分枝杆菌与偶然分枝杆菌的探针有交叉杂交外,其余均为特异性杂交。对126株临床分离株进行鉴定,89株为结核分枝杆菌,占70.6%(89/126),非结核分枝杆菌(NTM)占9.2%(9/98)。应用rpoB基因芯片技术鉴定分枝杆菌菌种,是一种快速、准确的方法,具有较高的临床应用价值。 李洪敏 樊博 王巍 李国利 苗青关键词:分枝杆菌 寡核苷酸探针 核酸杂交 聚合酶链反应-反向斑点杂交法直接从BACTEC-960阳性培养物鉴定分枝杆菌菌种 被引量:2 2010年 李国利 张灵霞 樊博 王巍 董亚俊关键词:分枝杆菌 菌种鉴定 反向斑点杂交法 聚合酶链反应 培养物 硝酸盐还原试验 应用左旋氧氟沙星介入凝胶进行药效及安全性分析 2007年 目的分析左旋氧氟沙星凝胶联合体的体外抗结核作用和介入治疗的安全性分析。方法利用最小抑菌(MIC)和最小杀菌浓度(MBC)法测定左旋氧氟沙星单体与左旋氧氟沙星药物凝胶的抗结核效果,同时,用家兔经支气管介入注药的试验。结果左旋氧氟沙星凝胶对H37,Rv标准株、牛型结核分枝杆菌、草分枝杆菌MIC值分别为0.5、0.5和1.0mg/L,MBC值分别为1.0、1.0和1.5mg/L;左旋氧佛沙星凝胶与左旋氧氟沙星单体MIC、MBC值无显著差异;家兔动物实验表明该药无任何副作用。结论左旋氧氟沙星凝胶具有与左旋氧氟沙星单体相同的抗结核菌药效,介入用药以1.0-1.5mg/L为宜。 李洪敏 王巍 冯端浩 陈宏兵 张涛 樊博关键词:左旋氧氟沙星 抗结核药 最小抑菌浓度 结核分枝杆菌PE和PPE家族研究进展 2011年 结核分枝杆菌的PE和PPE家族成员在结核分枝杆菌基因组中约占8%。且PE和PPE多基凶家族为分枝杆菌属所独有,在其他细菌基因组并未发现类似的如此庞大的多基因家族。对其序列结构、表达和调控的初步研究表明其成员可能表达于细胞表面,参与病原体与宿主间的相互作用,并且可能和结核分枝杆菌等致病分枝杆菌的抗原变异相关。一些家族成员蛋白或多肽可以诱导机体对结核分枝杆菌保护性的细胞免疫反应,是候选疫苗的成份。对其家族成员的各种研究在各个实验室里已广泛展开,本文就其研究现状作一综述。 樊博 王巍 程小星关键词:结核分枝杆菌 基因组学 rpoB基因-PCR-反向斑点杂交快速鉴定分枝杆菌菌种的研究 分枝杆菌的rpoB基因是分枝杆菌依赖DNA的RNA聚合酶的β亚单位的编码基因序列,rpo(RNApolymerase,RNA聚合酶)是由αββ‘σ四个亚单位形成的寡聚体,其核心酶是α2ββ‘的聚合体,全酶为α2ββ‘σ聚... 樊博关键词:分枝杆菌 聚合酶链反应 寡核苷酸探针 核酸杂交 文献传递