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2013年云南省H9N2亚型禽流感病毒两个进化分支毒株抗原性变异分析被引量：1: 2016年; 为明确2013年云南省H9N2亚型禽流感病毒Ⅲ-1和Ⅲ-2小分支间是否存在抗原性差异,以及这种抗原性差异是否与氨基酸位点变异有关,从2个小分支中选取7个毒株与疫苗株进行系统发育分析和血清学交叉比对试验。结果表明,2个小分支HA基因核苷酸序列同源性为86.6%~98.4%,与2000年前疫苗株亲缘关系较远,Ⅲ-1分支与2000年后疫苗株（ACKLGQ113和ACKDL2010）亲缘关系较近。血清学交叉比对试验结果经统计学分析显示,Ⅲ-1和Ⅲ-2小分支间抗原性存在差别。氨基酸比对结果表明,不同进化亚分支毒株与疫苗株相比氨基酸存在变异;与已报道的抗原表位关键性位点相比,Ⅲ-1分支中部分毒株抗原表位关键性位点存在变异,Ⅲ-2分支毒株无变异,但在其他8个氨基酸位点存在特有变异,是否存在未知抗原表位关键性位点,以及其他氨基酸位点变异是否会辅助性影响抗原变异,还有待进一步研究。; 石凤海胡媛媛张文东孔强张应国范泉水赵焕云张富强; 关键词：禽流感病毒 H9N2亚型

2009年-2014年云南边境禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶基因进化分析被引量：2: 2015年; 为了解云南边境禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶(NA)基因变异及进化特征,2009年-2014年期间在云南边境采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品1 500份,经禽流感H5/N1亚型病毒特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品进行病毒NA基因扩增、纯化、克隆和测序,并与已知毒株和参考毒株进行序列比对及系统进化分析。结果从1 500份样品中检出禽流感病毒H5N1亚型阳性样品60份;60阳性样品病毒HA基因测序获得21种NA序列,可划分为4个不同进化分支。NA基因与HA基因呈现不同进化关系;云南边境毒株NA aa275位点未发生变异,因此变异毒株对神经氨酸酶抑制剂Oseltamivir(达菲)类抗病毒药物可能无抗性或耐药性;2009年-2014年期间云南边境H5N1亚型病毒NA间具有遗传差异,NA基因进化分支4已成为当地流行的优势毒株。; 曾伟刘庆亮孔强张文东胡媛媛胡挺松赵焕云段博芳邱薇范泉水张应国宋建领张富强; 关键词：禽流感病毒 H5N1亚型神经氨酸酶基因

某规模场产蛋量下降鸡群新城疫病毒分离与鉴定被引量：4: 2016年; 对某规模场鸡群采集的23份鸡咽喉或泄殖腔棉拭子进行病原分离,通过血凝、血凝抑制试验和RT-PCR检测,证实分离出17株新城疫病毒（NDV）。对F、HN基因经RT-PCR扩增、克隆并对其进行测序,选取具有代表性的4个毒株进行序列比对及遗传演化分析。系统发育分析结果表明,4株病毒均属于基因Ⅶe型,F基因裂解位点的氨基酸序列为^112R-R-Q-K-R-F^117,具备NDV强毒株裂解位点氨基酸排列特征。其F基因与XZ-12-08-Ch株核苷酸和氨基酸的同源性分别介于96.1%-96.7%、97.3%-98.0%;与P1株核苷酸和氨基酸的同源性分别介于95.0%-95.4%、96.2%-96.7%,其HN基因与XZ-12-08-Ch株核苷酸和氨基酸的同源性介于96.2%-96.5%、95.3%-95.9%;与SN-5-08-Ch株核苷酸和氨基酸的同源性介于94.9%-95.3%、96.4%-96.8%。血清学交叉试验显示,NDV分离毒株为抗原测得的同批血清样品抗体效价存在显著差异。近年流行的新城疫疫情主要由基因Ⅶ型NDV引起的,该规模场产蛋量下降可能与F和HN基因的变异有关。; 孔强曾伟赵焕云段博芳胡挺松范泉水张应国胡媛媛宋建领张文东张富强; 关键词：新城疫病毒进化分析

2014年云南省禽流感H5N1亚型病毒进化分析: 2014年1-3月云南省发生H5N1亚型禽流感疫情。为了解病毒全基因变异特征及遗传进化关系,在云南通海、安宁采集死亡家禽喉气管20份,经禽流感H5N1亚型病毒特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品进行病毒全基因扩增、克隆...; 孔强曾伟赵焕云段博芳胡挺松范泉水张应国宋建领张文东张富强; 关键词：禽流感病毒 H5N1亚型全基因分子特征; 文献传递

2014-2015年云南省边境H5N6禽流感病毒血凝素与神经氨酸酶基因序列分析被引量：4: 2016年; 禽流感是由A型流感病毒引起的一种急性传染病。病毒基因组由8个分节段的单股负链RNA组成，其中血凝素和神经氨酸酶均为糖蛋白，是作为A型流感病毒亚型划分的依据。禽流感病毒根据血凝素和神经氨酸酶的抗原性差异分为H1～H16、N1～N9不同亚型；根据其致病性和传播能力强弱可分为高致病性、低致病性和非致病性三大类，高致病性主要是由H5和H7亚型流感病毒引起的。近年来H5N6成为全球高致病性禽流感分布流行的主要亚型，开展云南省禽流感病毒H5N6病原监测、血凝素和神经氨酸酶基因变异和进化分析，对禽流感研究及防范新基因型入侵具有重要意义。; 孔强赵焕云田康段博芳胡媛媛胡挺松张应国张文东张富强; 关键词：禽流感血凝素类神经氨酸酶

2014年云南地区禽流感H5N1亚型病毒全基因进化及分子结构特征分析被引量：1: 2016年; 2014年3月云南地区发生H5N1亚型禽流感疫情。为了解引起该疫情的病毒全基因变异特征及遗传进化关系，我们在云南通海、安宁、大理采集死亡鸡喉气管40份，经H5N1亚型禽流感病毒（AIV）特异性多重RT-PCR检测。从检测结果呈阳性的26份样品中每个地区挑选2份病毒阳性样品进行全基因测序分析，结果显示6株AIVs均属于2．3．4．4进化小分支。同一病毒株不同基因节段呈现不同进化关系。蛋白序列的变化主要为：HA的受体结合位点和表位关键性氨基酸位点存在变异，新增加2个糖基化位点；NA缺失4个糖基化位点；PB2的aa627为谷氨酸（E）；NS在aa80-aa84发生缺失；PB1、PA、NP、M关键性氨基酸位点均存在部分替代或突变。本研究测序的6个H5N1亚型AIVs与之前的AIVs间具有遗传差异，这种进化小分支2．3．4．4的AIVs已成为当地流行的优势病毒株。; 孔强曾伟赵焕云段博芳胡挺松范泉水张应国胡媛媛张文东张富强; 关键词：禽流感病毒 H5N1亚型全基因进化分析

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孔强