杨恩 作品数:11 被引量:34 H指数:4 供职机构: 杭州致远医学检验所有限公司 更多>> 发文基金: 杭州市科技发展计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 轻工技术与工程 更多>>
下呼吸道人博卡病毒感染患儿的荧光定量PCR检测 被引量:2 2007年 引起小儿下呼吸道感染的病原微生物有相当部分是存在于自然界的病毒,其中包括呼吸道合胞病毒、流感病毒、腺病毒及冠状病毒等。迄今为止,约10%~39%的小儿下呼吸道感染的病因未知。人博卡病毒(human bocavirus)是最近从患儿下呼吸道感染分泌物中发现的一种新人细小病毒(parvovlrus),据报道由瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡学院的Tobias Allander儿童医院的医生在对540例下呼吸道感染患儿进行治疗时发现的,将之命名为“人博卡病毒”。新发现的人博卡病毒被认为在引起患儿下呼吸道感染的病因中至少占5%。 曾爱平 林峰 郑敏巧 林海燕 郑昌华 李桦 陈弘 吴锋 杨宁敏 杨恩 金大智 文思远关键词:小儿下呼吸道感染 荧光定量PCR检测 患儿 人细小病毒 浙江省幽门螺杆菌cagA、vacA基因型的流行病学研究 被引量:4 2008年 目的调查浙江地区幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)基因型的分布及其与临床疾病的关系。方法采用特异引物聚合酶链反应(PCR)分析262株幽门螺杆菌的vacA基因多态性分布特点,并对其进行初步统计分析。结果浙江8个地区分离培养的Hp菌株262株,VacA m1b基因型占27.10%(71/262);VacA m2基因型占64.89%(170/262);VacA m1b-m2基因型占4.20%(11/262);不同地区间VacA s区基因型和VacA m区基因型分布差异无统计学意义(P>0.05)。慢性胃炎分离株中VacA m1b基因型占26.47%(27/102);VacA m2基因型占66.67%(68/102);VacA m1bm2基因型占2.94%(3/102)。消化性溃疡分离株中VacA m1b基因型占29.41%(40/136);VacA m2基因型占61.76%(84/136);VacA m1bm2基因型占3.68%(5/136)。胃癌分离株中VacA m1b基因型占16.67%(4/24);VacA m2基因型占75.00%(18/24);VacA m1bm2基因型占4.17%(1/24)。不同临床疾病间VacA m区基因型分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论浙江8个地区Hp菌株的优势基因型为cagA+、va-cAs1/m2,vacA的s区和m区的分布与分布个体的临床类型无关。 林朗 杨恩 张红河 杨宁敏关键词:幽门螺杆菌 VACA基因型 流行病学 舟山海岛地区幽门螺杆菌耐药性流行病学研究 被引量:7 2009年 目的探讨舟山海岛地区幽门螺杆菌(Hp)耐药性流行病学状况,指导临床合理用药。方法收集2007年9月-2008年7月706例行胃镜检查患者,男457例,年龄13~85岁,平均43.8岁;女249例,年龄16~91岁,平均47.7岁。活检取胃黏膜进行Hp分离培养,用UreA基因PCR进行扩增鉴定。对Hp分离菌株进行药敏试验,并进行统计学分析。结果706例标本中,281例Hp培养阳性,分离的281株Hp基因组均取得基因组DNA。281株Hp临床分离株对左氧氟沙星、甲硝唑、克拉霉素、氨卞青霉素、庆大霉素、呋喃唑酮的药敏耐药率分别为12.10%、100.00%、21.71%、0%、0%。结论舟山海岛地区根除Hp药物,宜将阿莫西林、庆大霉素、呋喃唑酮作为首选,甲硝唑已不能作为根治药物。 邵伟 方富昌 王伟 周燕 黄海东 杨恩关键词:幽门螺杆菌 耐药性 流行病学 WLL-1株博卡病毒(Bocavirus)全基因组序列分析 被引量:12 2007年 Human bocavirus,which was firstly discovered in 2005,is a new human parvovirus associated with lower respiratory tract infection in children.In this study,a human bocavirus,named WLL-1 isolate,was identified in Wenlin County, Zhejiang Province.The genome of bocavirus WLL-1 has been sequenced and analyzed.Phylogenetic analyses showed that WLL-1 shares 99% homology with other bocaviruses recently reported,but also has some special variations. 林峰 曾爱平 杨恩 林海燕 郑昌华 陈弘 李桦 李旭阳 郁明素 杨宁敏 金大智 余光创 伯晓晨 文思远 王升启关键词:人博卡病毒 基因组测序 WLL株博卡病毒(Bocavirus)基因组测序及生物信息学分析(包含小儿博卡病毒(Bocavirus)感染的临床与实验研究) 人博卡病毒是一种2005年新发现的微小病毒,可以引起小儿下呼吸道感染。本文对在中国浙江温岭市第一人民医院发现的WLL株人博卡病毒进行全基因组测序和生物信息学分析。分析表明 WLL病毒株与其它微小病毒不存在亲缘关系,但与目... 林峰 曾爱平 杨恩 林海燕 郑昌华 陈弘 李桦 李旭阳 郁明素 杨宁敏 金大智 余光创 伯晓晨 文思远 王升启文献传递 微生物检测质量控制标样不确定度的评定 被引量:5 2009年 目的:对微生物检测质量控制标样的不确定度进行评定,确定标准值的细菌菌落数置信区间范围。方法:随机抽取同一批次的微生物检测质量控制标样10份,在同一环境中,由同一检测人员,使用同一批次的培养基,检测每份标样的细菌菌落数,对检测结果进行分析,计算平均值、标准差,评定不确定度,从而确定给定概率P的置信区间半宽。同一批次的10份微生物检测质量控制标样的细菌菌落数范围为:38462cfu/0.01g~5811lcfu/0.01g,平均值为48703.5,标准差为5430.45,不确定度5581.09,从而确定该标样的置信区间范围为4.31×10^4cfu/0.01g~5.43×10^4cfu/0.01g。结论:通过对微生物检测质量控制标样中的不确定度评定,说明该标样细菌菌落数离散度较小,实现了均匀分布,并确定了标准值的置信区间范围,实现了标准物质的定值。 黎昊雁 杨更发 扬宁敏 杨恩关键词:不确定度 乙型肝炎病毒对拉米夫啶耐药基因突变的研究 2007年 林峰 曾爱平 杨宁敏 颜鸣鹤 杨恩关键词:乙型肝炎病毒 耐药基因突变 拉米夫啶 细胞毒性淋巴细胞 HBV特异性 免疫调节疗法 压力蒸汽灭菌效果检测专用培养基的研究 2011年 目的研究压力蒸汽灭菌效果检测专用培养基,并进行质量观察。方法应用热力灭菌专用生物指示剂直接培养法,对所研制的培养基质量进行了观察和分析。结果 1号批次的培养基的质量分值为18.58≥17.995,为合格培养基。而2号和3号批次的培养基的质量分值分别为16.94和17.89,均<17.995,为不合格培养基。结论第1批次压力蒸汽灭菌效果检测专用培养基用于嗜热脂肪杆菌芽孢生物指示剂灭菌后恢复培养质量较好,不同批次培养基培养质量存在差异,可通过计算分值方法进行质量鉴定后再使用。 张守钗 徐书华 杨恩 杨宁敏 杨更发关键词:压力蒸汽灭菌 生物指示剂 WLL株博卡病毒(Bocavirus)基因组测序及生物信息学分析 人博卡病毒是一种2005年新发现的微小病毒,可以引起小儿下呼吸道感染。本文对在中国浙江温岭市第一人民医院发现的 WLL 株人博卡病毒进行全基因组测序和生物信息学分析。分析表明 WLL 病毒株与其它微小病毒不存在亲缘关系,... 林峰 曾爱平 杨恩 林海燕 郑昌华 陈弘 李桦 李旭阳 郁明素 杨宁敏 金大智 余光创 伯晓晨 文思远 王升启关键词:人博卡病毒 基因组测序 生物信息学分析 文献传递 WLL-1株博卡病毒(Bocavirus)基因组测序及生物信息学分析 被引量:3 2007年 目的对分离的人博卡病毒WLL-1株进行全基因组测序和生物信息学分析。方法运用NCBI提供的blastp分析各编码蛋白质的同源性;用SIB提供的ProtParam和ScanProsite推测计算蛋白质的各种物理特性参数。蛋白进行结构域分析采用SIB提供的ScanProsite。对具有同源序列和无同源序列的蛋白分别采用SwissProt和Scratch Protein Predictor预测其三级结构。蛋白质功能分析采用CBS Prediction Servers提供的ProtFun软件。结果WLL-1病毒株与其它微小病毒不存在亲缘关系,与目前报道的其他几株人博卡病毒有高度同源的基因组序列。WLL-1病毒株与其它已报道的病毒株有一定的进化距离,具有一些独特的突变位点。在NS1蛋白中发现调节DNA复制的超家族3结构域,在衣壳蛋白VP1、VP2中发现了在病毒的自组装中起重要作用的"β桶"拓扑基序。发现NP1蛋白具有多个N-糖基化及磷酸化修饰位点。结论经基因顺序分离病毒为人博卡病毒,这些位点参与病毒基因的翻译调控。 林峰 曾爱平 杨恩 林海燕 郑昌华 陈弘 李桦 李旭阳 郁明素 杨宁敏 金大智 余光创 伯晓晨 文思远 王升启关键词:人博卡病毒 基因组测序 生物信息学分析