金城
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
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- 细菌ncRNA基因预测工具的评估
- 2014年
- 细菌非编码RNA(ncRNA)在RNA的转录调节、染色体复制、RNA加工与修饰、m RNA翻译与稳定性、蛋白质降解与转运以及细菌感染等许多过程中都发挥着重要作用[1]。目前,基于实验鉴定的细菌ncRNA,已开发出不同的生物信息学预测方法[3-6],其中比较基因组学和转录单元预测方法是目前最常用的方法。比较基因组学和转录单元预测方法的结合使用,具有较高的特异性,但大多数方法的普适性较低。
- 金城
- 关键词：G+C含量
- 5-甲基胞嘧啶修饰对沉默抗生素基因的激活被引量：1
- 2014年
- 对真核生物的表观遗传学研究表明,5-甲基胞嘧啶修饰参与了多种重要生理功能。虽然在原核生物中也存在5-甲基胞嘧啶修饰,但其具体功能尚未确定。大肠杆菌编码的Dcm甲基转移酶负责DNA的5-甲基胞嘧啶修饰[1],有研究报道显示,Dcm与细菌的限制修饰系统相关[2];也有研究报道dcm基因能影响大肠杆菌中核糖体基因的表达,从而影响初级代谢和次级代谢[3]。本期介绍了高婕、贺新义等发表的论文"大肠杆菌甲基转移酶dcm基因的表达对变铅青链霉菌的多效性影响"[4],作者巧妙地利用变铅青链霉菌的DNA无甲基化修饰这一特点,将大肠杆菌dcm基因导入变铅青链霉菌,研究了5-甲基胞嘧啶修饰在变铅青链霉菌中的功能。结果发现,DNA的5-甲基胞嘧啶修饰不仅可影响变铅青链霉菌的形态和生理分化,而且还能激活放线紫红素沉默基因的表达。论文作者以变铅青链霉菌为材料,拓展了对原核生物DNA5-甲基胞嘧啶修饰的生理功能的认识。以此为基础的深入研究,不仅有助于揭示5-甲基胞嘧啶修饰在原核生物中的功能,而且有可能为沉默抗生素基因的表达或抗生素产量的提高提供一个新的途径。
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- 关键词：修饰抗生素表观遗传学真核生物生理功能
