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王海龙
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
供职机构:
北京生物制品研究所
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
张卿
北京生物制品研究所
张靖
北京生物制品研究所
于洁
北京生物制品研究所
靳玉琴
北京生物制品研究所
陈实
北京生物制品研究所
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2008
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麻疹疫苗株S-191全基因序列测定及与流行株进化关系的初步研究
被引量:4
2008年
目的对国内现在使用的Shanghai-191(S-191)疫苗株进行全基因组测序,针对国内已经分离出的毒株,分析它们与疫苗株的核酸序列差异以及流行特征。方法利用RT-PCR的方法分段扩增S-191疫苗株的全基因并测序,从GenBank中获得全球24条麻疹全基因序列和211株中国各省分离到的麻疹流行株以及WHO各基因型参考株的N基因C端456个核苷酸序列,计算麻疹序列13个编码区和非编码区的突变率,分析病毒株和疫苗株基因型和遗传距离,构建基因亲缘性关系树。结果获得S-191疫苗株的全基因序列并递交GenBank收录,进化树分析表明大部分流行株为H1基因型。各省流行株与S-191相比遗传距离为6.7%~8.2%。突变率分析显示非编码区的突变率明显高于编码区,编码区中N基因的突变率最大。结论本研究表明,中国大陆的麻疹病毒流行株以H1基因型为主,不存在明显的地域流行差异,在时间上也没有明显的突变积累特征。S-191疫苗株与近年来的麻疹流行株在遗传距离上差异较大,其保护作用需做进一步追踪探讨。
于洁
王海龙
陈实
张靖
张卿
靳玉琴
李启明
关键词:
麻疹病毒
RT-PCR
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