王丹丹
- 作品数：6 被引量：43H指数：4
- 供职机构：内蒙古农业大学农学院更多>>
- 发文基金：内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金内蒙古自治区科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学轻工技术与工程生物学更多>>
- 谷子waxy基因exon2-exon4区间序列比对分析被引量：4
- 2015年
- 为了明确中国春谷子waxy基因序列的变异,本研究以引进的53份谷子品种(系)为材料,采用PCR产物测序,对waxy基因exon2-exon4序列进行比对分析。研究结果显示:非糯、低直链淀粉含量和糯质类型频率分别为22.6%、54.7%和9.4%;在非糯类型中,11、12、22、23号材料检测到碱基缺失和置换,1、13、18和27号仅存在碱基缺失;在低直链淀粉类型中,9、17和24号同时存在碱基插入、缺失和置换,14和15号品种为碱基缺失和置换,大红谷(00009836)为碱基插入和缺失,20号和43号仅分别出现置换和缺失;在糯质类型中,红粘谷(00000537)同时检测到碱基插入、缺失和置换,杏黄粘存在缺失和置换。根据exon2-exon4区间序列变异,以阈值为78将53份材料聚为十大类,其中第一类品种数量较多,第五类群SNP多态性较丰富。
- 陈晓敏李书田杨自力孙宇燕刘斌张立媛王四清王丹丹郭世华
- 关键词：谷子WAXY
- 50份谷子营养与食味品质的聚类和相关性分析被引量：10
- 2017年
- 基于7个品质性状对50份谷子品种利用SAS9.3软件进行了聚类和相关系分析,结果表明,V_(B1)含量和胶稠度的均值较高分别为0.48 mg/100 g和112.41 mm,蛋白质含量、V_(B2)含量和硒含量分别为7.69%、0.07 mg/100 g和11.69μg/kg。16份品种的胶稠度大于120 mm,糯质、低直链淀粉和非糯类型频率分别为6%、76%和8%。品种间品质性状变异程度依次为V_(B2)含量>硒>糊化温度>直链淀粉含量>胶稠度>V_(B1)含量>蛋白质含量。采用最小距离法以阈值为10,将供试材料聚为9大类,其中第一、二、三类群分别包括7份、4份、33份品种,第四至第九类群各为1份品种;第一类群V_(B2)含量和胶稠度较大,第二类蛋白质含量、硒含量和胶稠度较大,第五类(公谷68)V_(B1)含量和胶稠度较大;第九类(大同34)蛋白质含量、V_(B1)含量、V_(B2)含量、硒含量和胶稠度最低,糊化温度和直链淀粉含量最高,品质较差。相关性分析表明,V_(B1)含量与V_(B2)含量和胶稠度分别呈极显著和显著正相关,相关系数分别为0.496**和0.283*;直链淀粉含量与糊化温度和蛋白质含量分别呈显著正相关和极显著负相关,相关系数依次分别为0.313*和-0.443**。
- 王丹丹徐文俊王卓任芹勇李涛赵攀衡郭世华
- 关键词：谷子营养品质食味品质聚类分析
- 春谷子农艺和品质性状的变异分析被引量：9
- 2015年
- 为有效利用糯谷子种质材料，以引进的53份谷子为材料，采用 SAS9．0软件对其农艺和品质性状的变异进行分析。主要结果如下：农艺性状的变异幅度为5．7％～36．08％，其中穗粒重的变异幅度最大（C ．V 为36．08％），生育日数的变异幅度最小（5．7％）。株高与穗长、节数呈极显著正相关，与叶片数、穗下节间长呈显著正相关，但与穗粒重呈显著负相关。穗越紧，穗下节间和穗毛越短。采用类平均法，在欧式距离4．1148，将供试材料聚为八大类，其中第二、第三和第八类群共25份材料为高产潜力组合类型。非糯、低直链淀粉和糯质类型频率分别为24．5％、60．4％和0。丰谷12、利谷21等16份材料的糊化温度为70℃～74℃（碱消值在4～5），频率为30．2％。赤谷10号、利谷21等29份材料（频率54．7％）的胶稠度大于115 cm 。
- 孙宇燕李书田陈晓敏刘斌张立媛王丹丹郭世华
- 关键词：谷子农艺性状品质性状
- 春谷子Waxy基因序列变异及其SNP分析被引量：5
- 2015年
- 为了明确春谷子Waxy基因序列变异和为品质育种提供实验依据,本研究以引进的15份春谷子为材料,利用特异PCR标记和序列比对,研究了Waxy基因序列单核苷酸多态性。结果表明:引物ex1/TSI2R、M5/M9和ex2int2/ex4在供试15份材料中分别扩增出约380 bp、1 800 bp和1 000 bp的谱带;引物ex1/ex2在利谷21、赤谷4号、A2不育度低和A2-1不育系等4份材料中均未扩增出谱带,在其余11份材料中均扩增出约1 200 bp的谱带;M2/R4在丰田501和金丰谷中未扩增出条带,在其余13份材料中均扩增出约1 500 bp的谱带。与Gen Bank粳谷KF372879的Waxy基因序列比对,共检测到419个SNPs位点和2 082个氨基酸变异。不同材料之间,总SNPs最多的为赤谷16、赤谷6号和公矮5号,分别为38、37和37,SNPs较少的有赤谷4号和利谷21,均为16;SNP多态性最多的引物为ex1/TSI2R,为159个,最少的为M5/M9,为40个;外显子共检测到47个SNPs,大白毛、A2-1不育系、丰田501、公矮5号和赤谷5号较多,分别为6、5、5、5和5个。非糯、低直链淀粉含量和糯质类型在外显子上的SNP分别为17、22和8个。
- 孙宇燕陈晓敏王丹丹郭世华
- 关键词：WAXY基因SNP
- 谷子农艺性状相关性与食味品质分析被引量：24
- 2015年
- 为了明确谷子的农艺性状和食味品质,以不同谷区的53份谷子为材料,利用SAS9.0软件对农艺性状与产量之间的相关性及其食味品质的变异进行分析。主要结果如下,农艺性状变异系数为0.07-0.28。穗长、节数(叶片数)、穗粗、穗重、千粒重与产量呈极显著正相关;株高与产量呈显著正相关。胶稠度大于115mm的材料有34份,占64.15%;中等糊化温度的谷子所占频率为71.7%;糯质、低直链淀粉和非糯类型的材料比例分别为15.1%、34%和24.5%。
- 王丹丹希日格乐孙宇燕金砾郭世华
- 关键词：谷子农艺性状食味品质
- 糯质与非糯谷子Waxy基因exon4～exon9区间RT-PCR分析被引量：3
- 2017年
- 为了明确糯质和非糯谷子Waxy基因c DNA序列变异,为品质育种提供实验依据,以2份糯质和2份非糯谷子为材料,利用特异RT-PCR和序列比对,研究了Waxy基因exon4~exon9区间c DNA序列SNPs及其氨基酸多态性,结果表明,糯质红粘谷(00000537)与白米粘谷的同源性为99.12%,在第163、第192、第245和第358位点检测到4个SNPs;非糯类型丰田501与赤谷4号的同源性为98.9%,在第139、第189、第282、第445和第451位点有5个SNPs。糯质红粘谷(00000537)与非糯品种赤谷4号相似性为98.23%,红粘谷(00000537)在第139、163、189、192、245、358、445和451位点碱基分别为T、G、T、G、G、A、C和A,赤谷4号在上述位点依次分别为C、A、G、A、A、C、T和G。糯质红粘谷(00000537)与非糯品种丰田501的相似性为98.9%,红粘谷(00000537)在163、192、245、282和358位点分别为G、G、G、A和A,丰田501依次分别为A、A、A、G和C。红粘谷(00000537)和赤谷4号exon4~exon9区间的c DNA序列编码的氨基酸序列中,检测出6个氨基酸变异,和丰田501出现3个氨基酸的变异。
- 郭世华王丹丹孙宇燕樊巧利李涛任芹勇
- 关键词：WAXY基因RT-PCRSNP
