肖华
- 作品数：10 被引量：15H指数：2
- 供职机构：上海交通大学生命科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学环境科学与工程轻工技术与工程更多>>
- 基于甲酸和氢氧化钠的衍生移动反应界面的数值计算与实验验证(英文)
- 2016年
- 在甲酸(α相)和氢氧化钠(γ相)缓冲液形成的移动反应界面的基础上,提出了一种衍生移动反应界面模型。模型表明在α相和γ相之间会形成一个新的β相,β相和α相形成衍生移动反应界面,β相和γ相形成移动界面。为了验证该模型的有效性,该文给出了相关理论及数值推导过程。此外,基于毛细管电泳和自制装置进行了相关实验。结果表明,若使用以前的移动反应界面,实验结果与理论计算存在较大误差,而采用该文提出的衍生移动反应界面,实验数据与理论计算结果高度一致。该文提出的衍生移动反应界面理论及模型对于电泳,特别是毛细管电泳中样品的分离与富集具有重要的意义。
- 吴雪静金杰颜炜肖华樊柳荫曹成喜
- 关键词：电迁移电泳
- 基于电解质电导的电泳淌度高精确经验方程（英文）被引量：1
- 2016年
- 电解质电导率的测定具有操作简单和精确度高等优点,若用于离子淌度的研究将会是准确、简便且廉价的手段。该研究基于电解质电导率提出了新理论方法。以单价离子为研究对象,在不高于0.05 mol/L离子强度下,根据19种单价电解质的电导率数据,将最大偏差接近10%的经验方程修正为最大偏差为5%的精确等式。校正公式的预测值也与移动界面法测定的盐离子淌度和露西方程得到的32种有机离子淌度有很高的一致性。研究还表明19种无机离子与32种有机离子的电解电导率与电泳淌度高度一致。本文还给出了小于0.02 mol/L离子强度下更加准确的方程(最大偏差2%),暗示改进后的经验公式具有极高的精确度。不仅如此,文献中的大量电解质电导率数据均可用于离子淌度的研究,且测定电解质电导率的简便性使得相关研究的深入更加容易。
- 和雨晨吴雪静孔凡志曹成喜樊柳荫肖华
- 关键词：离子淌度离子强度毛细管电泳
- 基于亲和色谱的肺癌细胞磷酸化蛋白质组研究及其应用被引量：3
- 2021年
- 磷酸化是蛋白质翻译后修饰的重要形式之一,其异常往往会导致细胞内信号通路的紊乱和疾病的发生。固定化金属离子亲和色谱(IMAC)是磷酸化肽段的高效富集技术,在磷酸化蛋白质组研究方面应用广泛。该研究以金属钛离子(Ti^4+)螯合IMAC材料(Ti^4+-IMAC)为载体,进行磷酸化肽段富集。比较了10μm Ti^4+-IMAC通过振荡法和固相萃取法(SPE)富集磷酸肽的效果,发现振荡法可以富集到更多的磷酸肽;对比了两种尺寸(10μm和30μm)Ti^4+-IMAC在磷酸化肽段富集中的差异,发现小尺寸材料富集效果更佳。进一步采用优化的策略比较了不同转移能力肺癌细胞的磷酸化蛋白质组,免标记定量蛋白质组学结果表明,优化的Ti^4+-IMAC方法可以从正常的肺成纤维细胞MRC5、低转移肺癌细胞95C和高转移肺癌细胞95D中分别鉴定到510、863和1108种磷酸化蛋白质,其中317种为3组所共有。该研究共鉴定到1268种磷酸化蛋白质上的7560个磷酸化位点,其中1130个为差异磷酸化位点,文献报道显示部分异常表达的激酶与癌症转移密切相关。通过生信对比分析发现,异常表达的磷酸化蛋白质主要与细胞侵袭、迁移和死亡等细胞迁移方面的功能有关。通过优化磷酸化肽富集策略,初步阐明了磷酸化蛋白质网络的异常与肺癌转移之间的相关性,该方法有望用于肺癌进展相关的磷酸化位点、磷酸化蛋白质及其信号通路研究。
- 张宝会王晨桐郭淼肖华
- 关键词：磷酸化蛋白质组癌症转移肺癌细胞
- 循环式自由流等电聚焦电泳与线粒体分离纯化
- 线粒体是重要的细胞器,其分离纯化极具挑战性。常用的密度梯度离心技术不能区分与线粒体类似的其它细胞器,因此有必要发展新装置来实现线粒体的富集。在前期自由流电泳工作的基础上,我们构建了循环式自由流等电聚焦(FFIEF)装置,...
- 肖华和雨晨孔凡志樊柳荫曹成喜
- 关键词：等电聚焦线粒体蛋白质组学
- 文献传递
- 多通道非接触电导检测装置用于自由流电泳分离在线检测被引量：1
- 2022年
- 现有自由流电泳(FFE)装置因不具备在线检测功能,其实用性仍然存在明显不足。针对这一问题,该工作发展了一种多通道电容耦合式非接触电导检测(MC-C^(4)D)装置并开发了自动测量软件。MC-C^(4)D装置采用了并行分时的非接触电导检测技术,即由多个同样的非接触电导检测模块并行排列,而单个电导检测模块又由多个非接触电导检测池组成,采用模拟开关切换这些检测池,能够分时检测流经相应检测池溶液的电导率。多个电导检测模块的检测池总数等于FFE的组分数,它们分别串行接入到FFE各流路中,这样MC-C^(4)D装置就可在线并行分时在线测量各组分溶液的电导率。为验证所设计MC-C^(4)D装置的检测性能,采用配制的氯化钾标准溶液作为检测对象对MC-C^(4)D装置进行了标定和测试。实验数据表明,MC-C^(4)D装置电导率检测范围为0.015~2.5 mS/cm,检出限(LOD)为0.002 mS/cm,日内相对标准偏差(RSD,n=3)为2.31%,测量相对误差(RE)为3.03%和通道间测量相对偏差为1.60%,这些参数表明该装置检测范围较大,LOD低,重复性好,准确性高,通道间测量相对偏差小。另外,将MC-C^(4)D装置应用于往复式自由流等电聚焦电泳(RFFIEF)在蛋白质聚焦过程中对各组分溶液电导率进行实时在线检测,结果表明,所开发的MC-C^(4)D装置不仅可实现对FFE各组分溶液电导率的实时在线检测,而且还可在RFFIEF实验中辅助掌握分离的实验进度,提高FFE装置的实用性。
- 梁子其张强姜晓腾刘小平曹成喜肖华刘伟文
- 关键词：在线检测多通道蛋白质分离
- 新型电泳介质和技术的发展与蛋白质组学研究
- 凝胶电泳是蛋白质与核酸等大分子分离的重要工具,广泛应用于生物医药领域。虽然凝胶制备技术已经非常成熟,但在复杂蛋白样品的分离方面仍然面临许多挑战,往往存在分辨率低、柔韧性差等缺点。针对传统聚丙烯酰胺凝胶,我们将丙烯酸既作为...
- 肖华刘臻孙妍尚志樊柳荫曹成喜
- 关键词：凝胶电泳等电聚焦电泳蛋白质组学
- 文献传递
- 电泳滴定芯片及其POCT技术
- ＜正＞20年来我们实验室提出了系统的移动反应界面（movingreactionboundary,MRB）的概念、理论与方法,包括中和界面、沉淀界面、络合界面、氧化还原界面和超分子界面等。基于MRB概念,我们提出了MRB电...
- 曹成喜肖华王宇兴刘伟文樊柳荫
- 血清外泌体的蛋白质组分析及其在骨质疏松中的应用被引量：10
- 2019年
- 外泌体是细胞分泌的微小具膜囊泡,作为重要媒介参与细胞间的信号传递,已在疾病的诊断和治疗中发挥独特作用。骨质疏松症是全身性骨代谢疾病,容易引起骨密度减少并导致骨折,在老年人群中发病率很高,目前急需发展特异性体液诊断技术。本论文采用超速离心的方法,对血清中的外泌体进行了分离富集和表征,并采用液相色谱-质谱进行了外泌体蛋白质组学分析,共鉴定到了179个外泌体蛋白质,主要参与防御响应和免疫应答等生物过程。针对来自正常对照组、骨量减少组和骨质疏松组的血清样本,分离富集其中的外泌体,通过免标记定量蛋白质组学分析,分别鉴定到188、224和185个蛋白质。定量分析显示17个蛋白质的表达量在骨质疏松组和骨量减少组有显著改变(p<0.05),包括Integrin β3、Integrin α2β1、Talin 1和Gelsolin等,说明人体骨质在衰变过程中发生了系统性变化,并体现在血清外泌体中。该研究可为骨质疏松研究提供潜在的分子标志物,有助于阐明其病变机制。
- 霍春晖李英华乔智尚志曹成喜洪洋肖华
- 关键词：蛋白质组学生物标志物外泌体骨质疏松症骨量减少
- 基于MRB的电泳滴定新概念、新技术与新装置
- 最近20多年,我们实验室提出了系统的移动反应界面(moving reaction boundary,MRB)的概念、理论与方法,包括中和界面、沉淀界面、络合界面、氧化还原界面和超分子界面等。MRB已用于等电聚焦电泳动力学...
- 王后禹张柳霞曹毅仁樊柳荫肖华曹成喜
- 关键词：蛋白质
- 文献传递
- 蛋白质和酶移动反应界面电泳滴定芯片
- 20年来我们实验室提出了系统的移动反应界面(moving reaction boundary,MRB)的概念、理论与方法,包括中和界面、沉淀界面、络合界面、氧化还原界面和超分子界面等[1]。基于MRB概念,我们提出了MR...
- 鈡冉樊柳荫肖华曹成喜
- 关键词：芯片电泳蛋白质
