郭永博 作品数:16 被引量:19 H指数:3 供职机构: 甘肃农业大学动物科学技术学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 公益性行业(农业)科研专项 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 更多>>
不同海拔猪种EPO基因核苷酸多态性研究 被引量:4 2017年 青藏高原低氧胁迫响应下,藏猪在长期进化过程中形成了独特的高原低氧适应性。本研究对藏猪(合作猪,甘孜藏猪,迪庆猪,西藏藏猪)、八眉猪、烟台黑猪及长白猪、杜洛克猪、大白猪促红细胞生成素(erythropoietin,EPO)基因全序进行了测定分析。所得数据表明:9个猪群体的37个核苷酸序列共得到14个单倍型,25个变异位点包括8个转换,3个颠换和一个连续14 bp的缺失,其中有义突变3个;引入猪种仅分布在两个单倍型H1和H2中,我国地方猪种则分布在13个单倍型中;分析发现藏猪"TTGGGAAGTCTCAT"的一个序列片段缺失,这一特征在低海拔群体中不存在。EPO基因编码的194个氨基酸中发现3个突变位点,变异后的单倍型及氨基酸序列在藏猪中占优势。因此,在适应高寒低氧环境的生理学和分子学机制方面,藏猪EPO基因在长期进化过程中可能起着关键性遗传作用。 赵生国 贺希文 郭永博 蔡原关键词:EPO 多态性 一种改进的动物组织基因组DNA提取方法 本发明公开了一种改进的动物组织基因组DNA提取方法,改进之处是在苯酚提取前,先用蛋白酶K对细胞提取物进行处理,将肽段降解成更小的单元以便于进行苯酚提取。提纯过程中的DNA酶活性经低温操作并用SDS解聚或柠檬酸三钠和EDT... 焦婷 赵生国 车拢杰 权金强 郭永博 汪文强 郑王山文献传递 禾本科8种牧草DNA条形码通用序列筛选 被引量:3 2016年 DNA条形码技术是利用DNA保守片段对物种进行快速准确鉴定的新兴技术。本研究根据GenBank中禾本科牧草matK和rbcL基因的核苷酸序列,设计4对通用引物,建立并优化了针对禾本科7个主要牧草属8种牧草11个样品[高丹草(Sorghum bicolor×S.sudanense)、玉米(Zea mays)、针茅(Stipa capillata)、"贝克"多年生黑麦草(Lolium perenne‘Plxie)、"凯帝莎"多年生黑麦草(L.perenne‘Caddieshack’)、甘肃羊茅(Festuca kansuensis)、"百琪"紫羊茅(F.rubra‘Bargena’)、"梦神"紫羊茅(F.rubra‘Maxima’)、"百胜"草地早熟禾(Poa pratensis‘Barvictor’)、"钻石"草地早熟禾(P.pratensis‘Diamond’)和芨芨草(Achnatherum splendens)]的目的片段的扩增条件。对扩增产物进行测序和分析,经分别比对,筛选出8种牧草的4个标记位点5’端和3’端保守序列。对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性(SNPs)的单倍型分析。结果表明,matK1、matK2、matK3分别有6个单倍型(H1^A、H1^B、H1^C、H1^D、H1^E和H1^F)、7个单倍型(H2^A、H2^B、H2^C、H2^D、H2^E、H2^F和H2^G)和3个单倍型(H3^A、H3^B和H3^C),rbcL基因有5个单倍型(H4^A、H4^B、H4^C、H4^D和H4^E)。根据matK(matK1、matK2、matK3)和rbcL基因筛选的4个标记位点为8种牧草建立了相对应的特异DNA识别码。本研究可为混合禾本科牧草饲料中的高粱属、玉蜀黍属、芨芨草属、针茅属、黑麦草属、羊茅属和早熟禾属的8种牧草准确识别提供分子水平上的科学依据。 李永青 焦婷 吴建平 权金强 汪文强 郑王山 郭永博 姚喜喜 赵生国关键词:MATK基因 RBCL基因 DNA条形码 基于DNA Barcoding的鲶鱼及其生肉制品的鉴别方法及鉴别试剂盒 本发明公开了一种基于DNA?Barcoding的鲶鱼及其生肉制品的鉴别方法,包括下述步骤;1)根据已知鱼类的DNA条形码数据库,设计和合成多组引物;2)从从包含鲶鱼的多种鱼类中提取DNA,利用引物对每个待测对象的DNA进... 赵生国 边琳鹤 权金强 汪文强 李永青 郭永博 郑王山文献传递 藏族人群中GCH1基因的适应性选择及其对高原低氧适应的贡献 藏族群体是高海拔低氧极端环境成功适应和遗传机制研究的很好的范例。与移居到高海拔低氧环境条件下的低海拔人群相比较,藏族群体经过长期的低氧环境适应,进化出了许多重要的适应性性状,较高的肺容量和较好的肺功能,较好的肺扩散能力和... 郭永博关键词:藏族 低氧适应 血红蛋白 血氧饱和度 肺动脉压 文献传递 青海藏猪与八眉猪遗传多样性研究 被引量:1 2015年 为调查青海藏猪与八眉猪遗传资源,本研究测定了青海藏猪与八眉猪线粒体DNA D环(mt DNA)高变区核苷酸序列。结果表明:青海藏猪与八眉猪mt DNA D-loop高变区存在14个多态位点,其中有5个单一多态位点和9简约信息位点,根据多态位点界定了14个单倍型,其中6个是青海藏猪和八眉猪所共享,且各自有4个特有单倍型。由于自然条件下产生的突变类型积累的缘故,青海藏猪保持了相对较高的遗传多样性,而可能由于瓶颈效应与人工选择影响,八眉猪的遗传多样性较低。系统发育揭示八眉猪和藏猪是两次不同的驯化事件的结果。 赵生国 汪文强 郑王山 郭永博 权金强 车陇杰 李永青关键词:八眉猪 MTDNA D-LOOP 基于DNA Barcoding的9种常见鱼类鉴别试剂盒 本发明公开了一种基于DNA Barcoding的9种常见鱼类(多宝鱼、青鱼、中华鲟、金鲳、带鱼、生鱼、黄河鲶、武昌鱼、鳕鱼)及其生肉制品的一种鉴别方法。通过对编辑好的碱基序列长度进行比较来鉴别9种常见鱼类及其生肉制品,该... 赵生国 边琳鹤 李永青 郭永博 郑王山 权金强 汪文强 车拢杰文献传递 西藏藏猪遗传多样性研究 被引量:8 2015年 采用mt DNA D-loop作为分子标记,对西藏的4个藏猪群体(林芝、山南、昌都和日喀则)遗传多样性进行了研究。结果表明,西藏藏猪mt DNA D-loop高变区A+T含量(62.90%)明显高于G+C含量(37.1%),富含A和T,存在碱基偏倚性。在长度为435 bp的序列中,共检测到20个变异位点,界定了26个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.705±0.021,平均核苷酸差异数(k)为1.231,核苷酸多样度(Pi)为0.002 83。其中,Hd、k和Pi在昌都藏猪群体中最高,日喀则藏猪最低。此外,Hap1和Hap3单倍型是4个群体的共享单倍型,表明4个藏猪群体存在两个共同的母系祖先单倍型。 郭永博 蔡原关键词:藏猪 MTDNA D-LOOP 单倍型 早胜牛及其杂交群体SCD1基因外显子5多态性研究 被引量:1 2015年 以5个早胜牛类群(庆阳类群、平凉类群、南德温与庆阳类群杂种、西门塔尔与平凉类群杂种、秦川牛与平凉类群杂种)为研究对象,采用PCR-SSCP及DNA测序方法检测SCD1基因外显子5的多态性。结果表明,早胜牛及其杂交群体SCD1基因外显子5c.878C>T位点发生了C/T的突变,检测到2种基因型(CC和CT)和2个等位基因(C和T),且5个类群均处于中度多态水平。相关性分析表明,早胜牛平凉类群及其余西门塔尔的杂交类群胴体品质和肉质性状在该基因c.878C>T位点的CT和CC基因型之间差异不显著(P>0.05)。因此,SCD1基因外显子5突变位点可作为早胜牛及其杂交群体选育、加强胴体和肉质性状遗传效应的分子标记。 蔡原 赵生国 唐红杰 郭永博关键词:早胜牛 SNP 胴体品质 肉质性状 基于DNABarcoding 的黄颡鱼、云斑鮰和鲈鱼及其生物制品鉴别试剂盒 本发明公开了一种基于DNABarcoding的黄颡鱼、云斑鮰和鲈鱼及其生肉制品的一种鉴别方法。通过对编辑好的碱基序列长度进行比较来鉴别这3种鱼类及其生肉制品,该方法是基于DNABarcoding建立的,不受被鉴定材料的形... 赵生国 边琳鹤 汪文强 李永青 郭永博 郑王山 权金强 车拢杰文献传递