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田志新
作品数:
48
被引量:4
H指数:1
供职机构:
同济大学
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国家自然科学基金
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王悦
同济大学
沈赟
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王浩
同济大学
李莎莎
同济大学
刘琰
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基于同位素轮廓指纹比对与近同重二甲基标记的top-down定量蛋白质组学
差异表达蛋白的精确定量是基于质谱的蛋白质组学的终极目标。稳定同位素标记结合质谱或串级质谱分析已经成为多肽和蛋白质相对或绝对定量的首选方法。基于甲醛和氰基硼氢化钠的还原反应可以对多肽N端和赖氨酸残基上的氨基进行二甲基标记;...
肖开捷
田志新
一种生物质谱数据库快速建立与搜索的方法
本发明涉及一种生物质谱数据库快速建立与搜索的方法,本搜索方法基于所述质谱的原始一级质谱和候选生物大分子,靶向在线计算与动态存储二级质谱数据库。与现有技术相比,本发明的方法对高通量的质谱解析效率有着显著的提升,可以避免大量...
肖开捷
田志新
基于串级质谱和同位素轮廓指纹比对的翻译后修饰组学
随着软电离技术(尤其是电喷雾电离)以及高质量分辨、高质量测量精度和串级质谱功能强大的质谱仪的发展和普及,蛋白质翻译后修饰的全面解析(包括种类、位点以及结构)已经成为人类蛋白质草图绘制完成后基于质谱的蛋白质组学的研究重点。
田志新
肖开捷
薛冰冰
王浩
沈赟
连浩志
吴昊
王悦
韩雨吟
一种蛋白质翻译后修饰定位的方法
本发明涉及一种蛋白质翻译后修饰定位的方法,基于所述质谱的原始一级和二级质谱的数据库搜索,通过特征匹配离子,来确定蛋白质翻译后修饰的位点,对质谱数据进行数据库搜索和蛋白质鉴定过程中,利用特征离子,实现对不同蛋白质翻译后修饰...
肖开捷
沈赟
王悦
田志新
完整蛋白质数据库搜索引擎ProteinGoggle
Top-down蛋白质组学直接以完整蛋白质为研究对象,获得完整蛋白质分子全面的一级结构信息(氨基酸变化、组合式翻译后修饰),从而为其结构和功能的研究提供完备的支撑。相对于无机小分子、有机小分子、代谢产物及多肽等生物小分子...
肖开捷
田志新
文献传递
基于P-bracket的磷酸化修饰位点精确定位
磷酸化修饰是蛋白质上广泛发生,也是被研究最多的翻译后修饰之一。基于高能碰撞诱导解离的串级质谱是磷酸化大规模和高通量定性鉴定和位点定位的最新发展水平的分析平台。目前,数以万计的磷酸化多肽可以在单次的鸟枪法蛋白质组学分析中被...
田志新
肖开捷
沈赟
李莎莎
关键词:
磷酸化
文献传递
乳腺癌潜在N-糖蛋白质标志物的位点和结构特异性分析
乳腺癌是女性健康的头号杀手;目前临床上用Her-2/neu和CA 15.3用于其早期诊断,但二者的灵敏度都不到60%;灵敏度更高标志物的发现是当前研究的一个重点,差异表达N-糖蛋白的发现是其中的重要研究内容.作者课题组前...
田志新
关键词:
乳腺癌
基于串级质谱和同位素轮廓指纹比对的翻译后修饰组学
随着软电离技术(尤其是电喷雾电离)以及高质量分辨、高质量测量精度和串级质谱功能强大的质谱仪的发展和普及,蛋白质翻译后修饰的全面解析(包括种类、位点以及结构)已经成为人类蛋白质草图绘制完成后基于质谱的蛋白质组学的研究重点。...
田志新
肖开捷
薛冰冰
王浩
沈赟
连浩志
吴昊
王悦
韩雨吟
文献传递
一种多糖同时富集与近同重标记的定量分析方法
本发明涉及一种多糖同时富集与近同重标记的定量分析方法。将两组不同生理或病理条件的多糖分别作为控制组与疾病组,分别进行N‑乙酰葡糖胺醛基的全部氨基化同重标记,分别标记为‑CH<Sub>2</Sub><Sup>15</Sup...
方后琴
朱仲良
田志新
文献传递
N-多糖HCD解离通道的研究
糖基化作为蛋白质中最普遍的一种翻译后修饰,在许多生物过程及疾病(如阿尔兹海默症、癌症)的发生发展中扮演着重要的角色。因为糖链结构的复杂性和不均一性,N-多糖的分析一直是一个难题。随着高精度质谱及自带的各种高效解离方法的发...
沈赟
田志新
关键词:
解离通道
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