陈少康
- 作品数:4 被引量:13H指数:3
- 供职机构:中国农业大学动物科技学院更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- CD4+性状全基因组关联研究
- 本试验构建了大白猪×民猪F2设计资源群体共369头,成功获得F2代个体294头,F2代个体于240±7d采集血样.采用全基因组关联研究(GWAS)的方法,在猪的全基因组中检测与白细胞功能性状CD4+显...
- 宋欣陈少康罗维真颜华赵克斌王立贤张龙超程笃学王立刚李勇刘欣马小军梁晶周春香
- 关键词:GWASSNPCD4+
- 影响猪免疫性状的单倍型关联分析被引量:3
- 2013年
- 旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因。应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因。分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著;8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因。结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究。
- 罗维真陈少康陈少康程笃学程笃学颜华李勇王立刚宋欣马小军刘欣李稳梁晶赵克斌
- 关键词:免疫性状单倍型
- 猪红细胞生成素受体基因突变与血常规性状关联分析被引量:7
- 2012年
- 本研究旨在探索红细胞生成素受体基因(EPOR)影响红细胞相关性状的分子机理。对EPOR基因第1内含子和第4内含子突变位点g.705G>T和g.2373C>T,以飞行时间质谱进行个体基因型分型,在构建的大白猪×民猪F2代资源群体内开展其与6种血常规性状(红细胞压积、血红蛋白、平均红细胞血红蛋白量、平均红细胞体积、红细胞计数及红细胞分布宽度)的关联分析。结果表明,第1内含子突变位点g.705G>T未发现与血常规性状显著关联;第4内含子突变位点g.2373C>T群体内只发现2种基因型,其中CT基因型个体的红细胞压积显著高于CC基因型个体(P<0.05),但并未发现与其他性状显著关联。结果显示,EPOR基因突变可显著影响红细胞压积,说明该基因可作为影响红细胞压积的主效候选基因开展深入研究。
- 宋欣曹随忠张龙超程笃学王立刚李勇刘欣马小军梁晶陈少康罗维真颜华赵克斌王立贤
- 关键词:免疫性状SNP