陆文渊
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：复旦大学化学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 色谱-质谱联用中的保留时间校正和蛋白质组定量
- 蛋白质组的绝对定量在许多场合特别是高通量分析方面有重要的意义。遗憾的是,以色谱-质谱联用技术为主的高通量蛋白质组分析受到来自色谱保留时间漂移和质谱离子化干扰两方面问题的限制,致使蛋白的绝对定量几乎不太可能。我们利用了Pr...
- 陆文渊张扬殷薛飞刘晓慧沈诚频杨芃原
- 关键词：离子化电喷雾
- 文献传递
- 利用谱图校正提高色谱-质谱联用的分析效率
- 2014年
- 在使用对二甲基亚砜(DMSO)和NEDD8激活酶抑制剂(MLN4924,MLN)刺激的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)内的蛋白质进行分析的过程中,利用Progenesis LC-M S软件对色谱图进行了保留时间的校正,并比较了同组分多次重复实验中的谱图相似率及两种刺激下细胞内蛋白质色谱图的相似度。样品经双酶切处理后,加入QconC AT标准蛋白质混合物作为参照,经高效液相色谱-串级质谱分离,后续又对谱图进行了校正与分析。经过谱图校正,将蛋白质鉴定结果从7 000个左右提高到8 000个以上,提高了蛋白质的鉴定效率。在利用谱图计数进行相对定量时,还分析了DMSO和MLN分别刺激HUVEC后细胞内的蛋白质差异在1 000个左右,并给出了校正后的色谱总离子流图的相似度比较。相比其他方法更为简单快捷和流程化,具有高通量高灵敏度的优点。
- 陆文渊张扬沈诚频殷薛飞刘晓慧杨芃原
- 关键词：蛋白质分析
