赵一雷
- 作品数:47 被引量:16H指数:3
- 供职机构:上海交通大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划上海市浦江人才计划项目更多>>
- 相关领域:理学生物学化学工程医药卫生更多>>
- 关于建立环境污染等突发事件社会赔偿机制研究(节选)
- 一、绪言中共中央总书记习近平4月25日主持召开中央政治局常委会,会议强调,要把环境保护放到更加突出的位置,抓紧研究大气污染防治行动计划,强化重点流域和地下水污染防治。5月24日,习近平在主持政治局学习时强调,在生态环境保...
- 范秀凤仲汇惠黄敏陈迪严志强吴东袁晓忠赵一雷徐勇江
- 文献传递
- 喹啉加氧酶中氧气扩散的通道分析被引量:1
- 2017年
- 通过生物信息学分析、量化计算优化、CAVER和MDpocket预测、随机加速分子动力学及伞状抽样动力学模拟等方法,对喹啉加氧酶(HOD)中的氧气扩散途径进行了计算预测.结果表明,氧气在HOD中的反应位点包埋在蛋白内部,而HOD中有数条可能的通道供氧气进出,其中长度最短的通道具有最高的优先度,不仅在随机加速动力学模拟中具有最高的氧气逸出概率,而且伞状抽样方法计算得到的自由能也最低.此通道的内端位于底物Re面的氧气结合位点,较好地解释了HOD的相关实验数据.
- 周超石婷赵一雷王晓雷
- 细菌DNA硫修饰生物学功能:体内、体外和理论计算方法探索硫代磷酸脱氧核苷酸的抗氧化作用
- 细菌DNA硫修饰是不久前发现的一种普遍存在于细菌的表观遗传修饰现象。链霉菌等细菌运用dndA-E功能基因簇转运半胱氨酸的硫原子,以置换鸟苷附近磷酸基团非桥键氧[1]。细菌的硫修饰核苷酸位点具有特殊的分子识别和抗氧化功能,...
- 黄强吴婷婷赵一雷
- 关键词:ROS
- 文献传递
- 计算化学在-氧化氮化学和生物化学中的应用
- 赵一雷
- 漆酶降解木质素类化合物反应机制研究
- 木质素是芳香醇聚合而成的、支撑植物细胞壁的生物大分子,在木本植物中约占重25%,它的生物降解在环境和能源科学中具有重要的意义。漆酶是木质素降解酶系中的一个重要成员,它是一种环保型铜多酚氧化酶,通常从木质素中汲取电子把空气...
- 赵一雷李佳琪
- 关键词:漆酶木质素反应机理
- 文献传递
- 酶分子催化机制:预反应态决定底物选择性?
- 随着基因编辑技术的快速发展,在抗生素工业合成上微生物生物合成已经与传统的有机化学合成方法并驾齐驱。通过定性进化等现代酶工程方法能够快速突变关键基因的特定碱基及其编码功能蛋白,从而高效地提高生物合成中目标代谢产物的产量和纯...
- 赵一雷
- 关键词:生物合成过渡态
- 金表面二硫基自组装膜的理论研究
- <正>金属表面自组装单分子膜在有机电导体领域一直被广泛地研究。特别是在OLED、OTFT和OPV装置的效率与表面电导性质直接相关。利用理论计算,我们研究了金[111]表面的二硫基单分子膜的
- 赵一雷
- 关键词:自组装膜UPS
- 文献传递
- 多元变量方法在纳米-蛋白质-小分子互作光谱分析中的应用
- 蛋白质与其他物质的互作在生物医学中扮演非常重要的角色,特别是它与纳米材料的动态结合在生物传感器领域具有广泛的应用前景。我们收集了不同浓度蛋白与金纳米材料相互作用的时间分辨等离子表面共振光谱,并用多元变量的方法对二维数据进...
- 赵一雷任玺黄强
- 蛋白质酪氨酸硝化位点网络结构特征分析
- <正>蛋白质中每10000个酪氨酸位点大约有1-5个在活性氮作用下会发生硝化反应[1];这种蛋白质化学修饰是多种人类衰老退化疾病如心血管硬化、老年痴呆症、帕金森病的分子标记物[2]。现代蛋白质组学实验已经报道了相当数量活...
- 赵一雷成尚利
- 关键词:酪氨酸硝化反应
- 文献传递
- 非辅酶依赖型加氧酶HOD的氧气活化机制及底物选择性研究
- 氧气的活化是生物体进行有氧呼吸等重要生命活动所必需的过程。目前发现了少量不依赖辅酶就能够实现氧气活化的酶,其中HOD就是一种能够直接利用氧气氧化喹啉类底物开环并释放出一氧化碳的双加氧酶,其间位加氧方式也不同于其它大部分双...
- 王晓雷赵一雷
- 关键词:反应机理
- 文献传递