谭光明
- 作品数:148 被引量:85H指数:6
- 供职机构:中国科学院计算技术研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国科学院战略性先导科技专项国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术电子电信生物学文化科学更多>>
- 减少光器件数量的光神经网络芯片构建方法及系统
- 本发明提出一种减少光器件数量的光神经网络芯片构建方法和系统,通过芯片结构与训练方法协同的方法,通过低秩近似压缩光芯片中冗余光器件的数量,同时基于若干的优化手段,保证神经网络的识别准确率。本发明所提出的减少光器件数量的光神...
- 陆则朴臧大伟沈华戴梦溪谭光明孙凝晖
- 文献传递
- 一种应用建模及性能预测方法
- 本发明提供一种应用程序建模及性能预测方法,所述应用建模方法包括:从应用经编译得到的指令中获得计算指令和访存指令,根据运行所述应用的机器的体系结构特征建模计算指令和访存指令的执行,得出计算指令和访存指令的时间开销;以及根据...
- 孙凝晖谭光明谢震
- 文献传递
- 基于定制协处理器的基因重测序加速技术研究
- 2014年
- 自2008年1月高通量测序技术应用以来,测序的通量和成本都在不断下降.然而基因数据的爆发式增长速度已经超过了摩尔定律,对海量数据的计算处理能力成为制约基因测序应用推广的瓶颈.以基于Hash索引的重测序算法为目标,对计算和访存行为进行分析,从而提出了一个现场可编程门阵列(field programmable gate array,FPGA)作为协处理器的架构,并在Convey公司的HC-1ex平台上进行了设计与实现.其基本处理单元内部采用全流水的设计及FIFO隔离计算模块和访存模块,可以完整执行重测序算法的核心流程.通过将基本处理单元和访存端口的一对一绑定,在4块Xilinx Virtex-6LX760上实现了64路并行处理流程,总平均读内存带宽可达22.59GBps.与8核Intel Xeon处理器相比,可以提升28.5倍的性能.
- 汤文张春明谭光明张佩珩孙凝晖
- 关键词:高通量测序技术现场可编程门阵列
- 一种光神经元结构和包含该结构的神经网络处理系统
- 本发明提供一种光神经元结构和包含该结构的神经网络处理系统。该神经元结构包括突触输入调制模块、突触权值调制模块、光线聚合模块和光强度探测模块,其中,突触输入调制模块用于接收光信号并在与输入神经元关联的电信号的控制下执行光路...
- 臧大伟陈灿刘元卿沈华谭光明张佩珩孙凝晖
- 文献传递
- 边缘海静力数值预报模式并行算法研究
- 2016年
- 边缘海静力数值模式是国内针对边缘海特点自主开发的数值预报模式,但该模式因物理求解方程较多且采用不宜并行化的SOR求解算法而程序计算时间过长。针对上述问题,提出基于三维网格和海洋模式特点的SOR并行求解算法,该算法在保留三维网格数据间依赖关系的同时,有效解决了SOR迭代算法难以并行化的问题。同时,引入通信避免算法,采用MPI非阻塞通信方式,细分计算和通信过程,利用计算有效隐藏通信开销,提高了并行程序效率。实验结果表明,并行后的边缘海静力数值模式程序的性能相对串行程序提升了60.71倍,3天(25920计算时间步)预报结果的均方根误差低于0.001,满足海洋数值预报的时效性和精度要求。
- 逄仁波张云泉谭光明徐建良贾海鹏解庆春
- 关键词:非阻塞SOR
- 基于负载感知的自适应粒度纠删码编解码加速方法及系统
- 本发明提出一种基于负载感知的自适应粒度纠删码编解码加速方法及系统。通过针对当前节点的编解码负载判断当前节点的计算压力,根据计算压力,区分当前的优化方向,在面向低负载时,根据最佳切分粒度分布图进行数据切分和计算,在面向高负...
- 魏征邢晶谭光明孙凝晖
- 文献传递
- GROMACS 2020在ROCm平台上的移植与优化被引量:2
- 2021年
- GROMACS是应用广泛的开源分子动力学模拟软件,当前主要通过CUDA使用NVIDIA GPU进行加速计算。ROCm是一个开源的高性能异构计算平台。基于ROCm平台的HIP编程语言,首次实现了GROMACS 2020系列在ROCm平台上的完整移植。在MI50 GPU上,以一个复杂离子液体模拟算例为目标,使用GPU性能分析工具rocprof对移植代码进行了性能分析。针对MI50硬件特性,先后对成键力核函数、静电力的PME核函数和短程非成键力核函数进行了优化,优化后运行目标算例的性能相比初始版本整体上获得了约2.8倍的加速比,在MI50上的性能高于GROMACS原版OpenCL代码60.5%,相对纯CPU版本有约2.7倍的加速比。在另外2个具有代表性算例的单结点测试以及离子液体算例的多结点扩展性测试中,优化后的代码也达到了较好的性能提升,这表明所采用的优化操作具有一定的通用性。
- 张驭洲曹武迪卜景德谭光明吉青
- 关键词:分子动力学GROMACS
- 一种路由安全检测方法和系统
- 本发明涉及一种路由安全检测方法和系统,包括:获取路由系统的路由表,路由表包括多个路由项;将路由项的二进制哈希值作为校验值,校验值的位数为n,记校验值的前m位为分桶单元,分桶数M为2<Sup>m</Sup>,校验值的后n‑...
- 元国军许刚王展邵恩安学军谭光明张佩珩孙凝晖
- 文献传递
- 农业模拟器:用智能技术打通黑土地保护的数据流被引量:6
- 2021年
- 信息技术正在对各行各业进行深度渗透。通过海量数据的获取,并在信息空间开展建模和分析,信息技术正在成为信息社会解决现实问题的有效手段。当前,国家正在大力实施黑土地保护工程,针对复杂的系统性保护工程,更需要依靠信息技术的力量开展黑土地使用和保护过程中的问题建模和算法求解,通过模拟和仿真的方法找出最佳的保护途径。文章通过分析全球范围主要黑土地区域保护措施,从智能技术的角度提出构建基于第五范式的农业模拟器设计思想,并给出全要素农业模拟器的组织架构,以及通过智能OODA(观察—判断—决策—执行)环实现数据流的快速运转与迭代,不断优化黑土地保护的技术手段。最后,给出在黑土地保护示范区建设农业模拟器的思路和架构,提出农业模拟器在黑土地保护过程中开展应用和推广的政策建议。
- 孙凝晖张玉成王竑晟刘子辰陈海华谭光明
- 关键词:黑土地模拟器