魏大勇
- 作品数：18 被引量：27H指数：3
- 供职机构：西南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 与甘蓝叶片表皮毛有无紧密相关的分子标记及其应用
- 本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及与甘蓝叶片表皮毛有无紧密相关的分子标记及其应用。本发明的目的是为甘蓝品种选育提供一种新选择。本发明的技术方案是甘蓝叶片表皮毛有无紧密相关的分子标记Boltrichome‑caps01...
- 梅家琴钱伟魏大勇李月华
- 文献传递
- 鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记及其开发方法和应用
- 本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及一种鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记及其开发方法和应用，本发明公开一种鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome‑CAPS.02，具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，...
- 魏大勇汤青林李晟男王志敏钱伟
- 文献传递
- 一种植物离体茎杆接种鉴定菌核病抗性的方法
- 本发明涉及一种植物离体茎杆接种鉴定菌核病抗性的方法，即将植物主茎或者分枝砍下，放置在温度和湿度恒定的密闭环境，进行核盘菌接种。通过记录菌斑扩展长度，衡量材料的抗病性强弱。与传统的菌核病茎杆抗性鉴定方法相比较，本发明在可控...
- 钱伟梅家琴丁一娟魏大勇
- 用全基因组关联作图和共表达网络分析鉴定油菜种子硫苷含量的候选基因被引量：3
- 2018年
- 油菜籽饼粕是畜禽养殖中重要的蛋白原料,但饼粕中的硫苷是一种抗营养物质,食用过多会对禽畜产生毒害,因此挖掘油菜籽粒硫苷含量的候选基因对油菜种子低硫苷育种具有重要现实意义。本研究连续4年种植1个含157份材料的油菜自然群体,结合重测序数据对种子硫苷含量进行全基因组关联分析(GWAS),并对15份低硫苷和15份高硫苷材料进行种子发育早期的转录组测序,通过权重基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定种子硫苷含量的候选基因。用GWAS共检测到45个与种子硫苷含量显著相关的SNP,单个位点解释的表型变异为13.5%~23.3%,主要分布在A09、C02和C09染色体的3个区间中,覆盖5个已知的硫苷代谢基因。用WGCNA分析发现高、低硫苷材料之间的2275个差异表达基因,可分为12个基因模块,其中1个模块的基因显著富集在已知的硫苷生物合成途径,对该模块内163个基因的权重分析得到13个候选基因。经检测,GWAS和WGCNA共得到的18个候选基因中,有14个候选基因的表达量与种子硫苷含量显著相关(r=0.376~0.638,P<0.05)。用两种方法鉴定到1个共同的候选基因Bna C02g41790D(基因名MAM1),与该基因连锁的5个SNP构成5种单体型,等位基因效应分析发现,自然群体中63%的材料(99/157)为Hap 5,平均硫苷含量为50.79μmol g^(-1),与另外4种单体型(95.04~110.28μmol g^(-1))存在极显著差异(P<0.01)。本研究结合GWAS和WGCNA两种方法鉴定了油菜种子硫苷含量的候选基因,可为复杂性状候选基因的筛选提供参考。
- 魏大勇魏大勇熊清熊清汤青林李加纳梅家琴
- 关键词：甘蓝型油菜全基因组关联分析转录组测序
- 一种褪黑素在调节芥菜现蕾抽薹中的应用
- 本发明公开了一种褪黑素在调节芥菜现蕾抽薹中的应用，涉及植物培育技术领域。本发明应用方法包括：配制不同高浓度褪黑素溶液；选取饱满的芥菜种子，消毒后，放置在恒温培养箱中催芽；待芥菜种子露白后，放入春化；挑选出芽整齐的种子播种...
- 汤青林刘炼邓琴霖魏大勇王志敏
- 文献传递
- 茎瘤芥BjuDA1<Sup>R356K</Sup>基因及其编码的蛋白与应用
- 本发明涉及植物分子生物学领域，公开了一种含单突变位点的茎瘤芥(榨菜)BjuDA1基因及其克隆方法和应用。本发明通过同源克隆法得到茎瘤芥BjuDA1基因cDNA的编码区，通过将该cDNA第1067位碱基由G变为A，得到单突...
- 魏大勇赵飒吴杰管婧汝汤青林王志敏
- 甘蓝型油菜polCMS育性恢复位点的全基因组关联分析被引量：9
- 2017年
- 【目的】甘蓝型油菜波里马细胞质雄性不育(pol CMS)在中国已被广泛应用于杂交种育种,其育性恢复程度表现出受1对主效基因的控制,并受微效修饰基因的影响。通过全基因组关联分析方法挖掘育性恢复位点,并对候选基因进行比较分析。【方法】通过芸薹属60K SNP芯片对308份甘蓝型油菜自然群体进行基因型分型,并用pol CMS系301A作母本,与上述材料分别进行杂交得到308份F1,每份F-_1分别于2013年和2014年进行种植,每年2次重复,于始花期根据花粉育性和花蕊发育情况调查F1植株的育性等级,同时对测交父本自然群体进行群体结构分析和亲缘关系评估,并结合测交父本的基因型分型结果和F_1的育性等级进行全基因组关联分析(GWAS)。从GWAS分析中显著的SNP左右100 kb区间或与显著SNP处于同一单体型块(R^2>0.5)的区间内预测候选基因,并对候选基因进行QTL比较分析和单体型或等位基因的效应分析。【结果】方差分析结果显示,两年F_1的育性等级存在显著差异(P<0.01),但相关分析发现,两年的育性等级存在显著的正相关(r=0.52,P<0.001)。群体结构分析显示,所有测交父本被分为3个亚群(冬性、春性和半冬性),亲缘关系分析发现,任何2个材料之间平均亲缘关系值为0.072,73%的任意材料间亲缘关系值小于0.1,其中,约53%的材料亲缘关系值为0。GWAS分析共检测到13个与育性恢复程度显著关联的SNP,构成了6个候选区间,分别位于A01、A09、C03、C06和C08 5条染色体上,单个SNP解释的表型变异介于2.53%—9.96%。从中共预测到6个与育性恢复位点相关的候选基因,其中4个编码的蛋白含有恢复基因特有的PPR保守基序。共线性分析发现,4个候选基因中的2个(Bna A09g46700D和Bna C08g40710D)位于A09和C08染色体部分同源区间,且与已克隆的pol CMS育性恢复位点ORF2同源。另外2个新鉴定到的候选基因(Bna C03g45840D和Bna C06g13000D)连�
- 魏大勇谭传东崔艺馨吴道明李加纳梅家琴钱伟
- 关键词：甘蓝型油菜育性恢复基因全基因组关联分析SNP
- 一种与油菜粒重及角果长度紧密相关的分子标记及应用
- 本发明涉及油菜育种及分子生物学领域，具体涉及一种与油菜粒重及角果长度紧密相关的分子标记及应用。一种与油菜粒重及角果长度紧密相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记对基因BnaA.ARF18a的分子标记，核苷酸序列如SEQ...
- 钱伟董红利梅家琴贺亚军傅鹰魏大勇贺艳李玉震
- 紫外线诱导甘蓝型油菜变异研究初探被引量：1
- 2013年
- 通过调查经紫外线（uv—C）处理后甘蓝型油菜种子的萌发、幼苗生长、后代突变等情况，初步探索了UV-C诱导甘蓝型油菜变异的处理方法和诱变效果。结果表明，UV—C照射甘蓝型油菜种子0～5h对种子发芽率和第3d的发芽势无显著影响，但种子的根系活力指数和胚根长度均随着照射时间的延长而显著降低；M2中获得花瓣畸形、植株矮化、多雄蕊、浅色花瓣、雄性不育及开花早和晚的突变体．诱变率平均为3．86％。
- 刘川毕晶磊魏大勇王瑞
- 关键词：甘蓝型油菜紫外线诱变种子萌发
- 油菜种子含油量GWAS分析及位点整合系统构建被引量：6
- 2018年
- 含油量是油菜最重要的性状之一,目前已有较多的油菜种子含油量定位研究,然而各研究系统相对独立,群体与标记的差别使得难以比较不同研究结果。本研究连续4年种植了一个含308份材料的油菜自然群体,结合60K SNP芯片数据对种子含油量进行了全基因组关联分析(GWAS),并将所鉴定的显著位点与早前2个自然群体及10个分离群体鉴定到的位点进行全基因组比较与整合。结果显示,通过GWAS共检测到8个与种子含油量显著关联的位点,单个位点解释的表型变异度为3.22%~5.13%;结合其他12个群体的定位结果,共获得193个油菜含油量整合位点,分布于油菜的所有19条染色体,A亚基因组平均每条染色体有13个位点,显著高于C亚基因组(7个)。对不同群体鉴定结果的比较发现,7个整合区间能在至少3个群体中被检测到,均位于A亚基因组染色体(A01、A02、A03、A06、A08、A09和A10)上,其中有3个与C亚基因组上的区间存在同源性,在这3个区间中共鉴定到26个已知的油脂代谢相关基因。本研究将193个位点锚定到法国公布的甘蓝型油菜参考基因组,构建了一个可视的油菜种子含油量位点全基因组整合系统,可为油菜种子含油量重要位点的确定提供帮助,并为制定提高油菜种子含油量的育种方案提供参考。
- 魏大勇魏大勇梅家琴梅家琴汤青林钱伟
- 关键词：种子含油量全基因组关联分析QTL
