陈海峰
- 作品数:30 被引量:62H指数:5
- 供职机构:中国科学院上海有机化学研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:理学化学工程自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 红外谱图中特征峰与对应子结构相互关系的确定被引量:4
- 2000年
- 采用子结构检索、公共子结构寻找和相似指数计算的方法研究了红外特征峰与对应子结构的相互关系。说明对大量谱图信息进行统计分析确定基团的特征峰 ,是一种行之有效的方法。
- 陈海峰罗时玮姚建华袁身刚郑崇直范波涛A.PANAYEJ.P.DOUCET
- 关键词:化学结构红外谱图
- 建立三维分子结构检索系统的总体设计被引量:6
- 1999年
- 简要介绍了一个比较完备的三维分子结构检索系统,它包括三维结构数据的集成、数据更新、全结构和子结构检索、药效团检索等功能。它是分子设计的一个有力的工具。
- 袁身刚姚建华陈海峰郑崇直
- 关键词:药效团分子结构
- 化学反应的分类和知识层次模型的建立及其可视化方法
- 本发明是一种新的化学反应的分类、表示同类反应的通式反应的获取、反应知识层次模型的建立及其可视化方法。该方法分别应用两套不同的反应一级描述符和反应二级描述符对反应进行描述,然后用聚类分析方法将化学反应进行两次分类。应用本发...
- 姚建华朱倩李丰袁身刚陈海峰
- 文献传递
- 皂甙的三维定量构效关系研究被引量:7
- 2000年
- 针对目标分子柔性大的特点,在比较分子场分析(CoMFA)方法中采用交叉验证相关系数平方R^2引导的构象选择法.对12个皂甙分子的生物活性进行了三维定量构效关系研究.探讨了几种探针对构效关系结果的影响,并选择了一种较合理的“复合”探针方案.应用该复合探针构建CoMFA模型,发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为40%和4O%,其它能量项的贡献为20%.该模型交叉验证的相关系数平方R^2为0.653,非交叉验证的R^2为0.991,方差比F(4,7)值130.195(即置信度99%以上),活性预计的标准偏差与极差比(s/Δγ)为4.2%,表明模型具有较好的预测能力.根据该模型,预计在指定位置添加位阻较大的基团活性值提高将会比较明显.
- 谷妍陈敏伯董喜城陈海峰曾宝珊冯传莉俞飙惠永正
- 关键词:三维定量构效关系COMFA生物活性皂甙
- 含氟农药的比较分子场分析研究被引量:16
- 2000年
- 用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4%和39.6%,影响毒性的立体场与静电场的贡献分别为59.2%和40.8%.药效模型与毒效模型在交叉验证时的相关系数平方(R^2)分别为0.652和0.611,非交叉验证的R^2分别为0.982和0.977,方差比F(8,69)值分别为463.6及362.9,活性和毒性的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为3.6%和2.9%.,表明模型具有较好的自预测能力.对测试组34个化合物进行了活性和毒性的预测,活性与毒性预测的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为10.4%和6.4%.最后,还建立了一个由97个化合物构建的扩大的模型,各种统计量得到了进一步提高.并预计了一个活性较高且毒性很低的新化合物.
- 谷妍董喜城陈海峰陈敏伯张世相袁身刚郑崇直
- 关键词:3D-QSAR含氟农药生物活性
- 计算机辅助合成设计系统
- 姚建华朱倩李丰袁身刚陈海峰蔡伟廖泉
- 计算机辅助合成设计系统(CISOC-RetroSyn)是一个用于辅助化合物合成路线设计的软件。该系统利用反应知识,对用户提供的化合物进行分析,最终为用户提供用于合成该化合物的一组可能的合成路线,这为用户进行新化合物的合成...
- 关键词:
- 关键词:计算机辅助设计系统
- 化学反应知识获取系统
- 袁身刚朱倩姚建华李丰陈海峰蔡伟廖泉
- 化学反应知识获取系统(CISOC-ASRK)是一个用于从大量化学反应数据中获取反应知识的软件。该系统可以对用户自己收集的有机化学反应数据或商业反应数据进行分析处理,并以反应中心模式的分类规则对反应数据进行分类,用描述符对...
- 关键词:
- 关键词:数据挖掘
- 基于分子对接的苯丙素甙(PPGs)类化合物的虚拟筛选和合理设计被引量:3
- 2002年
- 采用虚拟化合物生成法对抗肿瘤的苯丙素甙 (PPGs)类化合物进行了配体受体对接研究 .以三种不同的骨架结构为基础分别生成了五十个虚拟苯丙素甙 (PPGs)类化合物 ,并将它们与端粒DNA受体进行分子对接 ,分析已知结构的对接结果 ,通过虚拟筛选的方法得到了一批与受体相互作用能较高并且复合物能量较低的新的有潜力的活性化合物 .该方法可以弥补分子对接研究中 ,只能计算药物与受体的相互作用 ,无法有效设计新化合物的不足 .
- 陈海峰高坤范波涛袁身刚贾忠建郑荣梁PANAYEADOUCETJ.P
- 关键词:分子对接抗肿瘤药物药物设计药物筛选
- 药效团检索设计新的HIV-1蛋白酶抑制剂被引量:1
- 2000年
- 通过对自建的未开发化合物三维结构库进行药效团检索,得到了4个对HIV-1蛋白酶有抑制活性的化合物,通过构象分析发现包含药效团的构象处于优势构象,而且4个结构都含有带两个邻位羟基的苯环和一个间位羰基的药效团以及公共子结构.通过计算发现它们的疏水参数都很小.在考虑满足包含药效团的结构特征和有适中的疏水参数两个因素的前提下,设计出了新的具有潜在抑制HIV-1蛋白酶活性的化合物.它们的结构都比检索得到的四个化合物更为简单。
- 陈海峰袁身刚罗时玮董喜城姚建华杨铄郑崇直
- 关键词:药效团构象分析
- 有机精细化学品的计算机辅助分子设计及软件开发
- 袁身刚郑崇直陈敏伯姚建华陈海峰董喜城张伟琪袁琼杨铄冯传莉荔建锋欧阳政罗时玮刘映晖王源张玉珍成小林谷妍
- 该项目瞄准了精细化学品分子设计的SAR/QSAR研究工具软件、三维结构数据库和组合化学模拟系统三个主攻方向,取得了一系列拥有自主知识产权的成果,为我国精细化学品工业提供了解决“生产什么”问题的技术平台。所开发的软件都吸取...
- 关键词:
- 关键词:分子设计