沈金城
- 作品数:5 被引量:14H指数:2
- 供职机构:清华大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生理学更多>>
- 一种基于GO分子功能信息的序列编码辅助预测亚细胞定位方法被引量:4
- 2007年
- 亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关.本研究提出了一种新的编码方式,试图根据那些与亚细胞定位相关的蛋白质分子功能信息,结合氨基酸二肽组成以提高亚细胞定位预测的性能.结果显示,在使用支持向量机和RH数据集的测试中,该方法的预测精度有了显著的提高,同时对于蛋白质序列N端的不准确性也具有一定的鲁棒性.
- 沈金城张松孙之荣
- 关键词:亚细胞定位支持向量机
- 基于序列保守性和蛋白质相互作用的真核蛋白质亚细胞定位预测被引量:9
- 2008年
- 蛋白质的亚细胞定位是进行蛋白质功能研究的重要信息.蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能.尝试了将保守序列及蛋白质相互作用数据的编码信息结合传统的氨基酸组成编码,采用支持向量机进行蛋白质亚细胞定位预测,在真核生物中5轮交叉验证精度达到91.8%,得到了显著的提高.
- 张松夏学峰沈金城孙之荣
- 关键词:亚细胞定位氨基酸组成序列保守性蛋白质相互作用支持向量机
- SARS病毒传播的分子进化模型与传染病预测分析被引量:1
- 2004年
- 本文从SARS病毒的微观侵染机制入手,以分子免疫学中的抗原.抗体的相互作用作为理论依据,将个体的发病机制、机体内抗体的应答水平与SARS病毒的数量和传染力联系起来,建立了分子进化模型(molecular evolution model)。从微观角度对SARS病毒的传播做出了预测,并与实际数据进行了比较,同时对模型未来的发展方向作了一些的展望。
- 沈金城刘扬刘旭唐云
- 关键词:SARS病毒抗体传染病分子免疫学抗原
- 蛋白质亚细胞定位与功能的相关研究
- 沈金城
- 关键词:亚细胞定位分子功能基因本体论蛋白-蛋白相互作用
- 基于序列保守性和蛋白质相互作用的真核蛋白质亚细胞定位预测
- 蛋白质的亚细胞定位是进行蛋白质功能研究的重要信息。蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能。随着蛋白质亚细胞定位信息的日渐重要,实验技术提供了一些比较精确
- 张松夏学峰沈金城孙之荣
- 文献传递