杨鹏程
- 作品数：5 被引量：7H指数：2
- 供职机构：中国科学技术大学研究生院更多>>
- 相关领域：理学医药卫生化学工程更多>>
- 分子筛模型中非骨架离子位置的研究被引量：1
- 1998年
- 从理论上研究了非骨架阳离子可能的分布位置．计算了分子筛晶体基本结构单元在整个空间的静电势分布，找出空间中静电势的各个极小点．在静电势最低点逐个放置钠离子，优化，重新计算模型分子筛的电势分布．研究了阳离子放置过程中静电势变化的趋势．
- 杨鹏程叶学其计明娟赵柱流张卓娅侯廷军徐筱杰
- 关键词：静电势分子筛计算机模拟晶体
- 模型分子筛对水分子的吸附被引量：1
- 2000年
- 用PM3半经验量子化学方法研究了模型分子筛对水分子吸附的性质.通过模拟计算确定了两个低能吸附位点及相应的吸附热,结果与实验值非常接近.同时,从两个不同低能吸附位点可以看出,大笼内的吸附流动性比β笼内的流动性好,即对水分子的吸附有较宽的区域.
- 计明娟杨鹏程叶学其侯廷军徐筱杰
- 关键词：计算机模拟水分子
- 甲硫氨酸脑啡肽的活性位点
- 2000年
- 用AM1方法中计算静电势的PMEP子程序研究了甲硫氨酸 脑啡肽的活性位点.通过计算得到了整个分子的三维空间静电势分布和由静电势导出的各原子的电荷分布.进一步分析,确定模型分子活性位点为酪氨酸残基的叔氮原子和苯酚基、苯丙氨酸残基的苯基及部分氧原子.它们分别以静电作用、疏水作用、氢键作用提供与受体分子相识别的作用位点.所有结果分析与麻醉镇痛药物的分子药效图象和前文的分子动力学模拟结果相吻合,证明用静电势和由静电势导出的各原子的电荷来研究药物分子活性位点是一种更定量化的和更有效的方法.
- 计明娟杨鹏程
- 关键词：静电势AM1活性位点麻醉药
- 甲硫氨酸-脑啡肽的分子动力学模拟被引量：3
- 1999年
- 用高温淬火分子动力学模拟方法研究了甲硫氨酸脑啡肽(Metenkephalin)在真空中的构象性质.经聚类分析和能量优化得到了十三个低能构象,并与吗啡进行了空间拟合.模拟结果表明,Metenkephalin是一种构象柔性大的多肽分子,可具有多种构象,主要为Gly2-Gly3和Gly3-Phe4之间的β折叠型式.大多数的结构具有由氢键连接两个末端残基所形成的假大环,侧链和芳香环定位在假大环的同侧.模拟结果还表明,模型最大的特征是:酪氨酸残基中的氨基N相当于吗啡中哌啶环上的季胺N,酪氨酸残基中的酚环相当于吗啡中的酚环,苯丙氨酸残基中的芳香环相当于吗啡中环己烯环.此肽与吗啡在空间结构(药效基团)上非常相似,都满足阿片受体的要求.所以,它们可作用于同一受体.该模型也能为具有阿片效能的肽和非肽配体的药效团设计提供帮助.
- 计明娟叶学其杨鹏程
- 关键词：甲硫氨酸脑啡肽分子动力学药效团脑啡肽
- 分子筛结构框架铝取代位置的理论研究被引量：2
- 1998年
- 给出寻找分子筛铝取代位置的一种普遍的方法．编制了一程序，可以给出某硅铝比下的各不等价硅铝分布方式．用PM3方法计算了Faujasite型分子筛晶体结构模型各不等价硅锡分布方式的生成热面ΔfH.找到了生成熟和铝原子间里的倒数和之间的规律．
- 杨鹏程叶学其计明娟赵柱流张卓娅侯廷军徐筱杰
- 关键词：分子筛计算机模拟
