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张凯: 作品数：21 被引量：34H指数：2; 供职机构：中国科学院生物物理研究所更多>>; 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金中国科学院知识创新工程更多>>; 相关领域：生物学农业科学自然科学总论自动化与计算机技术更多>>

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分离富集含脂滴的肠道菌的方法: 本发明公开了分离富集含脂滴的肠道菌的方法。实验证明，使用不连续的Percoll密度梯度溶液或单一密度的80％Percoll溶液可以从肠道中分离富集含脂滴的肠道菌，使用不连续的Percoll密度梯度溶液可以从粪便中分离富集...; 刘平生张凯周畅张淑妍程林佳

线虫β-氧化循环的结构生物学研究: 2009年; β-氧化循环是生物体脂肪酸的氧化分解的主要途径。在真核细胞内脂肪酸经过活化生成脂酰CoA,而后在线粒体基质中进入β氧化循环被逐步氧化分解。; 李志杰欧阳朱清徐颖之周强军张凯马军房俊男鲁彬庞效云翟宇佳孙飞

结构生物学研究在中国被引量：9: 2014年; 1970年代初期,中国科学工作者测定了亚洲地区第一个蛋白质晶体结构——猪胰岛素三方二锌晶体结构,成为中国结构生物学历史发展的起点.进入新世纪,该学科领域已进入国际前沿,展现出快速发展态势,正在迎来发展新时期.本篇评述包含"历史发展","现代化实验设施建设"和"深入生命世界,走进国际前沿——近年代表性研究成果集萃"三个主题节段,以较全视野反映结构生物学研究在中国的发展历程.; 王大成秦文明李娜姚德强叶盛张荣光张荣光朱平施蕴渝施一公柳振峰张凯杨娜许瑞明秦燕王艳丽江涛李雪梅王祥喜高福施一刘迎芳邵峰吴蓓丽; 关键词：结构生物学

基于GPU平台的联合迭代重构算法加速: 2012年; 电子断层三维重构技术(Electron Tomography,ET)是在纳米尺度下研究不具有全同性的细胞或大分子三维结构的重要方法。迭代重构法是ET中重构效果最好的方法,但是其性能较差,重构大尺寸图像时需要数天的时间甚至更长,使其应用受到限制。迭代重构法中经典的方法是代数重构法(Algebraic Reconstruction Technique,ART)和联合迭代重构法(Simultaneous Iterative Reconstruction Technique,SIRT),SIRT算法总是收敛的并且比ART重构的效果更好。利用CUDA语言设计和实现了基于Tesla C1060GPU平台上的并行SIRT重构算法,并利用存储器合并访问、常量存储器、共享存储器等优化技术对并行算法进行优化,优化后的SIRT并行算法在Tesla C1060GPU平台上的最大加速比是Intel i7 920CPU上的串行算法的47倍,并且重构的质量没有任何下降。; 张广勇卢晓伟沈铂张凯储琪赵开勇; 关键词：并行计算 GPU CUDA ATOM

猪动脉内皮细胞胞膜窖的电子断层三维结构分析: 胞膜窖是细胞膜特殊的功能区,位于细胞质膜表面,细胞膜内陷形成烧瓶状或倒Ω状,颈部狭窄,直径50～100 nm,具有由窖蛋白(caveolin)和胆固醇等构成的膜覆层; 孙书锋张凯徐伟王刚陈建军孙飞; 文献传递

膜蛋白结晶方法论述被引量：1: 2011年; 膜蛋白在细胞生命活动中承担各种重要功能,其基因数目约占整个基因组编码基因的30%,但已知的膜蛋白结构数目却只占整个蛋白质结构数据库的1%左右。近年来,膜蛋白逐渐成为结构生物学的研究热点,膜蛋白结构研究在重组蛋白表达、纯化和结晶等方向也出现了各种技术上的进步。本文简要论述了目前各种与膜蛋白结构研究相关的X-射线晶体学实验方法,主要包括膜蛋白样品制备、结晶方法等。膜蛋白结构研究是机遇与挑战并存的领域,随着经验的积累和技术的发展,这一领域正在吸引着越来越多的结构生物学工作者。; 范俊萍张凯; 关键词：膜蛋白

物质运输再循环相关衔接蛋白ACAP1的N端晶体结构研究: ADP核糖基化因子ARF6的GTP酶激活蛋白ACAP1,是新型网格蛋白包被复合体的组成部分,该复合体由ARF6调节,参与多种重要的生理途径,如转铁蛋白受体的组成性再循环,整合素蛋白和4型葡萄糖转运体的刺激依赖性再循环等。...; 庞效云张凯周强军马军Ming BaiVictor W.Hsu孙飞

线粒体呼吸链复合物Ⅱ醌结合位点抑制剂新型结合模式: 线粒体呼吸链复合物Ⅱ即琥珀酸泛醌氧化还原酶(SQR)是一个跨膜蛋白复合物,在三羧酸循环和有氧呼吸链两个系统中起着积极的传递作用。我们从四种农药化合物中筛选出两种对猪心线粒体呼吸链复合物Ⅱ醌还原活性有明显抑制作用的化合物分...; 周强军张凯孙飞

蛋白质突变库高通量表达筛选方法的研究被引量：1: 2012年; 人工进化方法被越来越多地应用于重组蛋白的表达筛选及其结构功能的研究,在适当的选择压力下,它可以有效地改善野生型蛋白固有的低表达和低稳定性等问题。本研究就如何进行快速、有效的蛋白质人工进化以提高重组蛋白表达量,进行了方法学探索,通过建立以绿色荧光蛋白为报告基因、结合流式细胞仪分选和96孔板等高通量筛选方法,成功地进行了一例高通量蛋白质点突变库重组表达株的筛选。; 黄治中Nancy Wakeham段红英张来幸黄博张凯; 关键词：绿色荧光蛋白流式细胞术高通量筛选重组蛋白表达