孔祥军
- 作品数：12 被引量：22H指数：3
- 供职机构：广西大学农学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 红麻种子发芽期对NaCl的耐性鉴定被引量：1
- 2013年
- 以25份红麻种质资源为材料,比较分析了250mmol·L-1的NaCl处理与空白对照的种子发芽率、发芽指数、活力指数、芽长等指标的差异,并据此对不同材料的耐盐性进行隶属函数分析,以评价不同材料的耐盐性。分析结果表明,所有供试材料中,以N10-76的隶属函数值最高,达0.95,表明其耐盐性最强;其次为09-43-1和N10-66,其隶属函数值分别为0.88和0.87;R1的耐盐性最差,其隶属函数值仅为0.02。发芽相关指标与隶属函数值的相关性分析结果表明,相对发芽率和相对活力指数与隶属函数的相关系数最高,均达到0.96;其次为相对发芽指数,相关系数为0.94;最低为相对芽长,其相关系数为0.84。在所有供试材料中,隶属函数值(综合耐盐能力)达到0.8的材料有8个,占供试材料的32%;小于0.2的材料仅为3个,占整体材料的12%。
- 杨健孔祥军周不进廖小芳周瑞阳
- 关键词：红麻发芽期耐盐性
- 红麻不育系与保持系基因组DNA甲基化比较分析被引量：5
- 2017年
- 为分析红麻不育系中甲基化模式,以红麻不育系UG93A和保持系UG93B为试验材料,分别提取2个材料的苗期叶片、四分体时期和双核期花药的基因组DNA(gDNA),采用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析比较其不同生长发育时期基因组DNA甲基化的变化规律,并研究甲基化变化基因的表达模式。结果表明:1)红麻生长发育过程中基因组DNA甲基化呈现一定的时空动态变化规律,不育系UG93A和保持系UG93B苗期叶片的甲基化率分别为56.79%(全甲基化率为44.25%,下同)和58.89%(43.24%);花药发育的四分体时期的甲基化率分别为48.08%(36.24%)和44.25%(33.22%);花药发育的双核期的甲基化率分别为45.30%(34.15%)和48.78%(37.98%);2)不育系UG93A基因组DNA的甲基化率在苗期最高、花药败育发生前的四分体期次之、败育后的双核期最低,在整个生长发育过程中呈现先高后低的趋势;保持系UG93B基因组DNA的甲基化率在苗期最高、花药发育的四分体期最低、双核期次之,在整个生长发育过程中呈现先高后低、再缓慢上升的趋势。保持系UG93B基因组DNA的甲基化水平总体上高于不育系UG93A,但在花药败育发生前的四分体时期,不育系的甲基化水平明显高于保持系;3)ATP8、SCL13、SRF6和植物磺肽素受体2等基因在不育系UG93A与保持系UG93B中存在甲基化差异。qRT-PCR分析结果表明,甲基化发生变化的基因在不育系和保持系之间的表达差异显著,推测这些基因的甲基化变化在红麻细胞质雄性不育(CMS)中发挥重要的作用。
- 李增强史奇奇孔祥军孔祥军廖小芳汤丹峰何冰廖小芳周瑞阳陈鹏
- 关键词：红麻CMSMSAPQRT-PCR
- 红麻线粒体基因NAD3和COB的RNA编辑与表达分析被引量：2
- 2016年
- 以红麻细胞质线粒体近等基因系UG93A(不育系)、UG93B(保持系)及UG93A×福红992(恢复系)的F1代为材料,研究花药线粒体基因NAD3和COB的转录与表达。结果发现,在3种供试材料中,基因NAD3的CDS区在DNA水平和RNA编辑水平上均无差异;不育系与保持系的COB基因DNA编码序列无差异,但在RNA水平上发生了编辑,8个位点的编辑均发生于密码子的第一或第二位碱基,且导致氨基酸种类变化,主要为亲水性氨基酸转变为疏水性氨基酸;COB基因在UG93A中的RNA编辑频率低于UG93B;NAD3和COB基因在3种材料中的转录本大小基本相同,但在表达水平上表现为不育系显著低于保持系和F1代。由此推测NAD3和COB基因在红麻花药发育过程中有着重要的作用。
- 刁勇廖小芳郑杰孔祥军陈鹏赵艳红周瑞阳
- 关键词：红麻RNA编辑COB
- 红麻MYB21基因的克隆、表达及载体构建被引量：3
- 2016年
- 克隆红麻不育系和保持系的MYB21基因,分析MYB21基因在红麻不育系和保持系各器官的表达量,并构建过表达载体和RNAi载体,旨在为进一步研究该基因在红麻中的功能奠定基础。以同源克隆的方法克隆MYB21基因;用实时荧光定量的方法分析MYB21基因在红麻不育系和保持系不同组织器官的表达模式;根据酶切-连接的方法,构建过表达载体和RNAi载体。结果显示,红麻MYB21基因在不育系和保持中的基因序列没有差异,其c DNA全长序列为922 bp,包含843 bp的开放阅读框,DNA全长序列为1 108 bp,包含3个外显子和2个内含子(NCBI序列登录号为KT898146);MYB21基因主要在花药中表达,在不育系和保持系花药之间表达量呈极显著差异;成功构建MYB21过表达载体和RNAi载体。成功克隆MYB21基因的全长序列;实时荧光定量结果表明MYB21基因主要在花药中进行表达;构建的植物过表达载体PBI121-MYB21和RNAi载体p ART27-PK-R1-F2可用于该基因的功能研究。
- 钱景华周步进孔祥军李增强史奇奇廖小芳周瑞阳陈鹏
- 关键词：红麻细胞质雄性不育实时荧光定量
- 陆地棉蛋白质二硫键异构酶基因(GhPDIL5-2a)的克隆及其在花药中的表达分析
- 2014年
- 利用电子克隆的方法设计特异引物,克隆陆地棉的1个二硫键异构酶(Protein disulphide isomerase like)基因的全长序列。序列分析表明:该基因没有内含子,开放阅读框的长度为1 293bp,编码的多肽序列含有430个氨基酸。该基因与红麻HcPDIL5-2a基因具有97%的相似性,将该基因命名为棉花GhPDIL5-2a。取单核期花药进行半定量RT-PCR分析发现:GhPDIL5-2a在陆地棉洞A不育株和可育株花药中表达无差异,在供试的其他不同品种中的表达也无差异。
- 刘冬梅金刚孔祥军周步进周瑞阳
- 关键词：陆地棉克隆
- ABT生根粉处理对水稻高节位茎段扦插繁殖的影响
- 2016年
- 以2个常规水稻品系为材料,分别用100 mg/L ABT1、ABT2和ABT6浸泡高节位茎段1 h后,进行水培试验。结果表明:(1)ABT生根粉处理后,根鲜重、总根长、根表面积、根体积、根平均直径、根鲜重均比对照显著增加,说明生根粉处理后促进了根系生长;(2)对照组的根系活力在抽穗后急剧下降,而处理组的根系活力在生长后期下降较慢,说明生根粉处理有提高根系活力的作用;(3)处理组根系中的可溶性蛋白含量显著高于对照组,与种子繁殖株的根系无显著差异,说明生根粉处理能提高根系可溶性蛋白的含量,提高根系某些酶的含量。
- 王灿灿汤丹峰孔祥军邱爱华周瑞阳
- 关键词：水稻生根粉
- 海岛棉部分引进和自选品种遗传多样性的SRAP分析被引量：9
- 2012年
- 【目的】探讨海岛棉种质遗传多样性,为海岛棉种质资源的利用和优良品种的选育提供参考。【方法】利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术对168份海岛棉材料进行遗传多态性分析,从224对引物组合中筛选出16对扩增条带清晰、多态性高的组合分析供试材料。【结果】共检测到129个多态性位点,每个引物组合扩增的位点数为3～12个,平均扩增位点8.06个。聚类分析结果表明,不同材料间的相似系数为0.27～0.89;在相似系数0.49水平上可将供试海岛棉材料分为4种类型,第1大类大部分是早期引进的国外品种,包括了埃及和中亚品种;第2大类包含了大部分新库系列和部分中亚品种,美国比马棉也聚在此类;第3大类主要包含了新海系列和部分中亚、苏联品种;第4大类仅有49(吉扎85)一个材料。【结论】海岛棉的相似系数变化幅度较大,材料差异较大,遗传多样性比较丰富。
- 武路云刘方靳明凯孔祥军王坤波周瑞阳
- 关键词：SRAP聚类分析
- 基于红麻HcPDIL5-2a基因诱导的棉花雄性不育种质创新研究进展
- 2019年
- 本项目是在前期采用花粉管通道法转红麻HcPDIL5-2a基因,创造出海岛棉雄性不育种质H276S的基础上进行的。在国家自然科学基金项目资助下,取得了如下重要进展:克隆了陆地棉GhPDIL5-2a、GhMS5及GhZIP1基因,并采用花粉管通道法成功创造出了陆地棉、水稻和红麻CMS种质资源;明确了H276S为无花粉型细胞质雄性不育种质,育性稳定,具有极高的杂种优势利用价值;开发出了雄性不育细胞质的分子标签,为雄性不育种质资源的鉴定和筛选提供了简便有效的方法:分子基尿研究表明,cox3可能是雄性不育关键基因,为阐明H276S雄性不育的分子机理奠定了基础。
- 刘冬梅孔祥军陈平李敏金刚郑杰李斌周瑞阳
- 关键词：棉花红麻雄性不育
- 陆地棉洞A不育与可育花药中激素相关基因的转录差异分析被引量：1
- 2013年
- 以陆地棉洞A为材料,取不育株和可育株小孢子单核早期花药进行转录组测序。结果表明:在获得注释的66 535个Unigene中,有51个激素相关基因差异表达,其中不育花药上调表达的有23个,可育花药上调表达的有28个。本研究首次分析了该时期激素相关基因在转录组水平上的差异,并对其中2个关键基因进行了验证,为深入研究陆地棉洞A的不育机理和挖掘关键基因奠定基础。
- 刘冬梅陈鹏周步进孔祥军周瑞阳
- 关键词：雄性不育激素
- 海岛棉H268 PPR蛋白家族基因鉴定及SNP/InDel分析被引量：2
- 2020年
- 【目的】通过对海岛棉不育系H276A及其育性恢复材料H268进行三角状五肽重复蛋白(PPR)家族基因鉴定及比对分析,获得序列存在差异的PPR基因,为后续育性恢复基因(Rf)的发掘提供理论基础。【方法】通过生物信息学分析海岛棉PPR基因,并对其进行亚细胞定位预测与功能注释分析;采用Illumina HiSeq 4000高通量测序技术对海岛棉H276A及H268对PPR蛋白家族基因进行转录组测序,将筛选获得的PPR蛋白与其他植物具有育性恢复的PPR蛋白进行氨基酸序列同源比对并构建系统发育进化树。【结果】鉴定获得912个PPR基因,其中有846个在海岛棉H276A和H268间存在序列差异,且分别存在7226个SNP差异位点和301个InDel差异位点,其中作用于线粒体的PPR基因有2143个SNP差异位点和134个InDel差异位点。转录组测序结果显示,共检测到表达基因数量为68197个,其中已知基因56311个、新基因11886个,可满足后续数据分析。GO功能注释结果显示,PPR基因主要富集于生物学过程,富集于分子功能的PPR基因最少。50.0%PPR蛋白定位于线粒体,29.0%PPR蛋白定位于叶绿体,0.9%PPR蛋白定位于细胞核,20.0%PPR蛋白定位于胞外,0.1%PPR蛋白定位于细胞质膜。xp_016708712(LOC107923023)和xp_016710013(LOC107924193)与多个具有育性恢复功能的PPR蛋白氨基酸序列相似性达33%,说明二者亲缘关系较近,且亚细胞定位于线粒体。【结论】xp_016708712和xp_016710013 2个PPR蛋白可能与海岛棉不育系H276A育性恢复相关,可用于发掘海岛棉CMS的Rf基因。
- 李枝玲孔祥军郑杰韦美玲李斌周瑞阳
- 关键词：海岛棉转录组测序SNPINDEL
