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姚鋆: 作品数：12 被引量：14H指数：2; 供职机构：复旦大学医学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家重大科学仪器设备开发专项国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：医药卫生生物学理学电子电信更多>>

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肝癌细胞分泌蛋白质的多种提取方法比较被引量：2: 2010年; 由于分泌蛋白在重大生理和病理过程中的重要角色和功能,使得分泌蛋白质组的研究备受人们关注.高效提取分泌蛋白质是分泌蛋白质组学研究的第一步,也是关键的一步.本研究首次比较了3种常用的提取方法:超滤法、沉淀法和透析法.以具有高自发性转移潜能的人肝癌细胞系LM3为研究对象,采用3种方法平行提取分泌蛋白,发现超滤法的提取效率最高;蛋白质经过溶液酶解,在线的一维反相高效液相色谱分离和ESI-MS/MS质谱鉴定,共鉴定了360个非冗余蛋白,其中有34,110和29个蛋白分别只在超滤法、沉淀法和透析法提取的样品中被鉴定到,沉淀法占优势,3种方法互相补充.360个蛋白中,有42个分泌蛋白为首次被鉴定到,扩大了已有的人肝癌转移细胞分泌蛋白数据库.; 曹晶沈诚频张军姚鋆申华莉刘银坤陆豪杰杨芃原; 关键词：肝癌分泌蛋白蛋白提取超滤

中枢神经系统血管母细胞瘤细胞与人脑神经元细胞差异蛋白质分析被引量：2: 2009年; 以人工培养的中枢神经系统血管母细胞瘤(Central nervous system hem angioblastoma,HB)细胞为研究对象,发展了蛋白质组学分析方法,鉴定了HB细胞与人脑神经元细胞的差异蛋白质。采用在线HPLC串联LTQ-Orbitrap质谱鉴定样品的可溶性蛋白质,得到了HB细胞的蛋白质组表达谱。HB细胞鉴定得到674个蛋白质,神经元细胞鉴定获得531个蛋白质。根据基于肽段鉴定的蛋白质组半定量分析方法对质谱数据进行蛋白质的差异比较分析,发现了波形蛋白(Vimentin),14-3-3epsilon蛋白和碳酸酐酶Ⅱ(Carbonic anhydraseⅡ,CAⅡ)等在HB细胞中表达量发生明显变化的蛋白质,并对其进行了免疫组织化学染色分析。结果显示,波形蛋白(Vimentin)、14-3-3epsilon蛋白以及碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ)等蛋白质表达量的改变与HB的发病密切相关,对探索HB的起源有重要意义。; 刘杭谢嵘姚鋆樊惠芝朱剑虹杨芃原; 关键词：中枢神经系统血管母细胞瘤蛋白质组学高效液相色谱-质谱半定量分析

高通量蛋白质组学技术现况和展望: 尽管对人类蛋白质组的最终完成目标存在不同的意见,但第一步要绘制完整人类基因组所表达的全部蛋白质谱,似乎没有太多的争议。人类蛋白质组的表达谱绘制遇到了在93和94年人类基因组测序计划同样的问题,科学家们在注重最后能达到的成...; 许雪娇樊惠芝于雁灵水雯箐申华莉陆豪杰张婕刘春丽李程豪毛煜贾韦韬徐国宾姚鋆陈先张祥民杨芃原; 文献传递

液相等电聚焦技术结合液相色谱-质谱联用技术分析鼠肝全蛋白被引量：2: 2015年; 利用液相等电聚焦预分离技术结合液相色谱-质谱(LTQ-Orbitrap)联用技术,研究了C57小鼠肝脏的蛋白质表达谱.质谱分析结果采用Max Quant1.4.1.2软件搜索数据库,共鉴定出3474个蛋白(2个以上唯一肽段).用DAVID在线工具、GO分类工具和IPA软件对鉴定蛋白进行生物信息学分析,单独发现832个新蛋白.研究结果表明,通过基于等电点和亲疏水性的两维分离,提高了质谱鉴定蛋白数,可以鉴定出更多低丰度蛋白.; 李颖姚鋆杨芃原樊惠芝; 关键词：蛋白质组学液相色谱-质谱联用

激光加工PMMA芯片-质谱ESI喷头性质研究: ＜正＞随着分子生物学以及生物化学研究的发展,人们对于高灵敏,小型化的仪器需求也是越来越高。而近十几年来发展迅速的微流控芯片技术正是基于上述几点的考虑逐步发展起来的。它凭借着高通量,快速,高效等诸多优点被越来越多的研究人员...; 黄懿姚鋆陈涛杨芃原; 文献传递

用于一级相同质量二级b,y碎片离子对定量方法的数据分析方法: 本发明涉及蛋白质组学技术领域，具体为一种用于一级相同质量二级b，y碎片离子对定量方法的数据分析方法，该方法采用Matlab语言编写，在Matlab界面下运行，其基于SEQUEST搜索引擎得到的蛋白定性结果，通过提取串级质...; 聂爱英张磊晏国全姚鋆张扬贺福初杨芃原陆豪杰; 文献传递

体内终端氨基酸标记的定量蛋白质组学方法: 一种基于细胞培养和串级质谱的蛋白质组学相对定量方法。在细胞培养过程中加入相同质量增加的重同位素标记的精氨酸或赖氨酸，细胞蛋白提取液按不同比例混合，经过特异性内切酶Lys-N和Arg-C酶解后，直接2D-LC-MS/MS分...; 聂爱英张磊晏国全姚鋆张扬贺福初杨芃原陆豪杰; 文献传递

肽段固相等电聚焦结合液相色谱-质谱联用技术分析鼠肝蛋白质被引量：1: 2014年; 利用肽段固相胶条等电聚焦技术对大鼠鼠肝组织蛋白质酶解产物进行预分离,反相色谱分离所得预分离组分后,用LTQ-Orbitrap MS进行分析。共鉴定到2039个蛋白质,包括18个乙酰化蛋白,其中4个乙酰化蛋白未被报道过。对这些蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,将肽段等电聚焦与LC-MS/MS结合起来,是一种有效的蛋白质组学分析技术,适合于大规模蛋白质鉴定分析。; 刘鸿姚鋆杨芃原樊惠芝; 关键词：液相色谱-质谱联用

中枢神经系统血管母细胞瘤的蛋白质组学分析被引量：2: 2006年; 背景与目的:中枢神经系统血管母细胞(centralnervoussystemhemangioblastoma,CNSHB)的治疗较难,至今病因不明。本研究应用蛋白质组学方法分析HB与正常脑组织的蛋白质表达谱的差异,分离鉴定与HB发病的蛋白质,为研究HB的组织学起源与发病机制提供依据。方法:收集5例血管母细胞瘤与5例正常脑组织标本。提取标本的总蛋白质。通过双向凝胶电泳(2-DE)分离蛋白,确定血管母细胞瘤与正常脑组织的差异表达蛋白质点。应用基质辅助激光解离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定并对鉴定蛋白质进行生物信息学分析。结果:通过双向凝胶电泳,建立了约含600个蛋白质点的血管母细胞瘤及正常脑组织的高分辨率蛋白质表达图谱。两者相比具有较高的同源性。应用ImageMaster2D图像分析软件共发现115个差异蛋白质点。经MALDI-TOF-MS分析后成功鉴定了87个蛋白质点共计47种蛋白质。其中HB组较正常对照组表达上调46个蛋白质点,下调41个蛋白质点。鉴定蛋白质的功能涉及转运、蛋白质折叠与代谢、三羧酸循环、细胞分化、干细胞相关蛋白质等数个方面。对鉴定所得蛋白质Vimentin、14-3-3蛋白进行免疫组化染色可重复本研究的结果。结论:中枢神经系统血管母细胞瘤可能是一种起源于间叶脑组织的肿瘤。其发生是一个多因子参与、多步骤的复杂过程。多种蛋白质如Vimentin及14-3-3蛋白参与了血管母细胞瘤的发病并起到重要的作用。; 谢嵘朱剑虹刘杭樊惠芝吴惺姚鋆陈露萍沈亦雯杨芃原; 关键词：血管母细胞瘤蛋白质组学分析双向凝胶电泳

糖蛋白质组学的信息学资源和方法被引量：2: 2016年; 糖基化修饰是生物体内最常见、最重要的蛋白质翻译后修饰之一.哺乳动物体内超过50%的蛋白质都会发生糖基化修饰.糖蛋白广泛分布于各种组织的细胞膜表面,执行着重要的生物学功能.随着高通量、高灵敏度和高分辨率的蛋白质组学时代的来临,许多基于串级质谱技术解析糖链结构的生物数据库和分析软件也亦应运而生.本文综述了目前文献中最常用的糖类生物信息学资源,包括各种糖蛋白的数据库以及质谱解析糖类的相关工具和新技术、新方法.; 刘杭姚鋆杨芃原张扬; 关键词：质谱数据库

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