周永明
- 作品数：35 被引量：132H指数：7
- 供职机构：云南省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项中美新发和再发传染病合作项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 云南省四株霍乱弧菌全基因组测序分析
- 2016年
- 目的选取云南省具有代表性的霍乱弧菌四株,进行了全基因组测序分析,为云南省霍乱弧菌的基因组学研究提供资料。方法根据对云南省历年霍乱菌株资料的分析,结合菌株特征和脉冲场凝胶电泳带型特点等,选取了四株代表性霍乱弧菌,采用WGS Illumina Hi Seq2500进行paired-end测序。对测序结果进行拼接、组装以及注释等。结果基因预测和功能注释结果显示,所有四株霍乱弧菌(YN2011004、YN98296、YN97083和YN89004)均显示携带有2个染色体,同时YN2011004,YN98296和YN89004各自携带有一个质粒。YN2011004的1号染色体具有2 727个基因,2号染色体具有958个基因;YN98296 1号染色体具有2 825个基因,2号染色体具有969个基因;YN97083 1号染色体具有1 948个基因,2号染色体具有955个基因;YN89004 1号染色体具有2 653个基因,2号染色体具有907个基因。所有预测的基因功能主要涉及细菌生理代谢、信号储存和处理以及信号转导等各个方面。结论云南省的四株代表性霍乱菌株均具有两个染色体,其中三个菌株还各自含有1个质粒。
- 廖凤尹杰尹建雯周永明徐闻伏晓庆赵世文古文鹏
- 关键词：霍乱弧菌全基因组序列
- 2014-2015年昆明市杯状病毒分子流行特征研究被引量：1
- 2017年
- 目的 通过分析云南省昆明市＜5岁腹泻儿童杯状病毒（Human Calicivirus,HuCV）的分子流行特征,为HuCV相关腹泻的防治提供科学参考.方法 收集云南省昆明市4个哨点医院＜5岁腹泻儿童（n =850）和非腹泻儿童（n=170）的粪便样本,提取病毒RNA,采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测杯状病毒,通过测序确定是否为阳性及亚型和基因型.结果HuCV的阳性率在腹泻儿童中高于非腹泻儿童（11.5％,98/850;4.7％,8/170,x2=7.083,P=0.008）,其中诺如病毒（Norovirus,NoVs） GⅡ阳性率在腹泻儿童中高于非腹泻儿童（11.1％,94/850;4.7％,8/170,x2=6.353,P=0.012）.而NoVs GⅠ（0.1％,1/850;0.0％,0/170,P=0.833）和扎如病毒（0.4％,3/850;0.0％,0/170,P=0.578）在腹泻人群和非腹泻人群中差异没有统计学意义.在腹泻人群和非腹泻人群中检出的102株NoVs GⅡ中,GⅡ.P4（10％,n=102）是最主要的基因型.NoVs GⅡ的阳性率在腹泻儿童中性别和年龄差异无统计学意义（x2=0.038,P=0.846;x2=0.620,P=0.733）,但存在明显的季节性差异（x2=9.867,P=0.020）,其流行高峰为秋季（15.6％）,以GⅡ.P4和GⅡ.P12株型尤其显著（x2=8.881,P=0.031;x2=7.917,P=0.039）.结论 昆明市腹泻儿童中NoVs GⅡ的流行程度较高,多个基因型均可引起感染,以GⅡ.P4为优势,同时出现了新的基因型GⅡ.P17.
- 何李英周永明古文鹏许万福张顺先张顺先艾琳卢艳
- 关键词：杯状病毒诺如病毒腹泻儿童
- 安宁市食品从业人员携带沙门氏菌血清型分布特征及耐药性分析被引量：6
- 2019年
- 目的了解云南省安宁市2016〜2018年食品从业人员门氏菌的血清型分布状况与耐药性情况。方法选取2016~2018年食品从业人员肛拭标本60533份进行血清学分型鉴定试验和药物敏感性试验。结果共检出沙门菌186株,总检出率为0.307%。沙门菌经生化和血清学鉴定分43个血清型,其中最常见的血清型依次为鼠伤寒沙门氏菌、肠炎沙门氏菌和伦敦沙门氏菌。在13种抗生素中,对11种抗生素产生不同程度的耐药性。结论食品从业人员携带的沙门菌种类多,血清型呈多样性的趋势,且耐药形势严峻,需加强从业人员的健康体检管理。
- 尹建雯杨李桃贾森泉周永明李学红张柱梁田云屏
- 关键词：沙门菌血清型耐药性
- 鼠伤寒沙门菌致幼儿腹泻的病例检测与调查分析被引量：6
- 2015年
- 腹泻是危害儿童身体健康和生命安全的重要公共卫生问题之一。据估计2011年全球约有70万儿童死于腹泻，在一些发展中国家迁延性腹泻所致死亡占儿童腹泻死亡的比例高达50％以上。国内外调查显示，沙门菌感染是5岁以下儿童急性腹泻的主要原因之一。本研究于2014年在云南昆明某综合医院儿科开展腹泻监测时，从1例迁延性腹泻患儿粪便标本中先后3次检出鼠伤寒沙门菌。本研究对患儿进行了回顾性调查、随访和实验室检测，对其发病情况、诊治经过、病原特征和转归等进行了综合分析。
- 周永明张顺先古文鹏尹建雯张京云周晓农阚飙徐闻李利
- 关键词：腹泻
- 昆明地区2018-2020年腹泻患者中艰难梭菌感染特征分析
- 2023年
- 目的对2018-2020年昆明地区腹泻患者中艰难梭菌感染特征进行分析,为后续监测和防治提供数据支持。方法收集2018-2020年云南省4家哨点医院腹泻患者粪便标本共388份,使用实时荧光定量PCR方法进行艰难梭菌粪便毒素基因检测,对结果阳性的粪便标本进行菌株的分离,用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定菌株。提取分离菌株的基因组DNA进行多位点序列分型(MLST)。分析毒素阳性和菌株分离阳性与患者的临床特征以及艰难梭菌阳性与其他病原共感染的情况。结果388份粪便标本中,艰难梭菌内参tpi基因阳性标本47份,总阳性率为12.11%。其中,非产毒艰难梭菌4份(8.51%),产毒艰难梭菌43份(91.49%)。47份阳性标本分离得到18株艰难梭菌,阳性标本的分离率为38.30%。其中tcdA、tcdB、tcdC、tcdR和tcdE基因均为阳性的菌株14株。18株艰难梭菌的二元毒素均为阴性。所有分离菌株的MLST结果共形成10种序列型(ST),其中ST37型5株(27.78%);ST129、ST3、ST54和ST2型各2株;ST35、ST532、ST48、ST27和ST39型各1株。粪便毒素基因阳性(tcdB+)结果与患者年龄、就诊前发热差异有统计学意义;菌株分离阳性仅与患者年龄差异有统计学意义。同时,部分腹泻患者存在艰难梭菌与其他腹泻病毒共感染的情况。结论昆明地区腹泻患者中艰难梭菌的感染多为产毒株,MLST结果具有高度的离散特征,应加强开展艰难梭菌的监测和预防。
- 李桂满古文鹏侯敏贾森泉王媛媛白璐璐尹建雯周永明伏晓庆卢金星吴媛
- 关键词：艰难梭菌腹泻毒素基因多位点序列分型共感染
- 一起农村中学猩红热暴发疫情调查被引量：9
- 2010年
- 周永明张旭辉
- 关键词：猩红热疾病暴发流行农村人口
- 2014-2018年云南省文山州手足口病病原学监测及柯萨奇病毒A6型的基因特征分析被引量：6
- 2021年
- 目的对2014-2018年云南省文山州手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例进行病原分析,并对其中分离的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CV-A6)进行分子流行病学分析。方法用RD细胞和Hep-2细胞从HFMD病例粪便标本中分离病毒,提取病毒RNA,先用MD91/OL68-1引物对病毒VP4/VP2结合区基因进行RT-PCR和测序,确定病毒型别,再用各型病毒的相关引物扩增肠道病毒(enterovirus,EV)VP1区全序并测序;按参考文献下载基因库中CV-A6病毒完整VP1区基因参考序列,用MEGA5.2软件构建系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析。结果5年间共从2848份标本中分离到581株EV,病毒分离率为20.40%(581/2848)。581株病毒中CV-A674份,占阳性总数的12.74%(74/581),CV-A16124份,占21.34%(124/581),EV-A71374份,占64.37%(374/581)。其他病毒9份,占1.55%(9/581)。用MEGA5.2软件对74株CV-A6病毒的VP1基因完整序列(915 bp)作基因进化树,排除序列完全一样的序列后共对22株具有代表性的CV-A6病毒和52株参考株序列共74株病毒作基因进化分析,文山州所有22株均为D3a亚型,其中21株为分支1(cluster 1),1株为分支2(cluster 2)。结论2014-2018年云南省文山州HFMD流行以EV-A71(占64.37%)、CV-A16(占21.34%)和CV-A6(占12.74%)为主。基因特征分析表明,跟往年全国的情况一样,云南省文山州2014-2018年流行的CV-A6为D3a基因亚型,其中进化分支1(cluster 1)是主要的流行分支。
- 周雪花周永明姜黎黎李楠周晓芳寸建萍伏晓庆田炳均
- 关键词：手足口病病原分析VP1基因分子流行病学
- 昆明市腹泻人群中肠黏附性大肠埃希菌的流行特征被引量：6
- 2017年
- 目的了解昆明地区肠黏附性大肠埃希菌(Enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)的流行特征,为防治EAEC感染提供科学参考。方法收集云南省昆明市4家哨点医院的腹泻患者粪便标本1 121份,非腹泻者的粪便标本319份,进行细菌培养(麦康凯培养基),无菌挑选单个菌落(8-12个),采用热提取法提取细菌DNA,采用荧光定量PCR检测EAEC,同时使用结构化问卷收集研究对象的基本信息。结果 EAEC在腹泻患者和非腹泻者中的检出率分别为5.4%和1.3%,差异有统计学意义(χ2=10.104,P<0.05)。男、女腹泻患者EAEC检出率分别为5.2%和5.7%,差异无统计学意义(χ~2=0.140,P>0.05);不同年龄组腹泻患者中EAEC检出率差异无统计学意义(χ~2=10.865,P>0.05);腹泻患者EAEC检出率有明显的季节分布特征(χ~2=12.819,P<0.05),夏季检出率最高(10.5%,21/200);冬季最低(2.0%,8/394)。EAEC阳性腹泻患者水样便占26.2%(16/61),黏液样便占70.5%(43/61)。EAEC腹泻患者易出现呕吐症状(χ~2=12.819,P<0.05)。结论 EAEC是腹泻的重要细菌性病原体,开展和加强EAEC的监测,可为EAEC相关腹泻的预防和控制提供科学依据。
- 张顺先杨春利艾琳陈木新蔡玉春卢艳陈韶红徐闻古文鹏周永明夏尚陈军虎李石柱陈家旭胡薇周晓农
- 关键词：腹泻病例
- 2007-2011年云南省法定肠道传染病流行态势及特征分析被引量：7
- 2013年
- 目的分析云南省2007—2011年法定肠道传染病流行态势及特征，初步探索云南省法定肠道传染病防制工作中尚需进一步调查研究的问题，同时为制定全省肠道传染病防制策略提供依据。方法从中国疾病预防控制信息系统获取资料，按照描述性流行病学的求，利用Excel软件进行资料整理和分析。结果云南省2007—2011年法定肠道传染病报告病例数从28217例上升至62932例，累计报告238210例，年平均47642例，5年平均发病率为104．6／10万。其在39种法定传染病中的构成比呈现逐年上升趋势，其中以丙类肠道传染病和病毒性肠道传染病报告病例上升为主。手足口病、痢疾和其他感染性腹泻的季节性最为明显，手足口病和痢疾的发病高峰在5月前后，其他感染性腹泻则呈现双峰特征，分别是3～5月和11～12月。从地理分布看，病例主集中在滇中及滇东南地区，边境地区的发病率也相对较高。总体上肠道传染病病例以5岁以下儿童为主，但戊肝和伤寒副伤寒病例中儿童比例较小。结论2007—2011年云南省法定肠道传染病报告病例数呈逐年上升趋势，其中手足口病疫情明显上升，其他感染性腹泻也呈上升趋势，痢疾、伤寒副伤寒等其他法定肠道传染病相对平稳，但局部地区高度流行。
- 周永明罗春蕊徐闻阚飙
- 关键词：肠道传染病
- 健康从业人员中产ESBLs鼠伤寒沙门氏菌的研究
- 2022年
- 目的研究健康服务从业人员中鼠伤寒沙门氏菌的耐药情况。方法分离来自某区健康体检的鼠伤寒沙门氏菌,通过商品化ESBLs培养基的筛选,用微量肉汤法、PCR和PFGE分型法分析菌株耐药情况。结果从60533名健康服务从业人员肛拭标本中分离得到的68株鼠伤寒沙门氏菌,其中6株检出ESBLs酶,检测出blaCTX-M-14和blaTEM-1,6株均为多重耐药菌,且分子分型不同于病例菌株。结论健康人群中检出含β-内酰胺酶基因的鼠伤寒沙门菌,且耐药性复杂,应加强对健康服务从业人员携带鼠伤寒沙门氏菌的监测,严控饮食卫生,开展预警,防止耐药鼠伤寒沙门氏菌感染发生。
- 尹建雯贾森泉周永明古文鹏赵智娴
- 关键词：鼠伤寒沙门氏菌Β-内酰胺酶多重耐药
