吕春花
- 作品数:2 被引量:5H指数:2
- 供职机构:中国农业科学院蔬菜花卉研究所更多>>
- 发文基金:公益性行业(农业)科研专项国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 相似穿孔线虫S型半胱氨酸蛋白酶基因克隆与序列分析被引量:2
- 2008年
- 根据不同种类线虫编码半胱氨酸蛋白酶的保守序列及植物寄生性线虫的半胱氨酸蛋白酶氨基酸密码子的偏好设计简并引物,通过RACE技术,首次从相似穿孔线虫(Radopholus similis)中克隆得到一个编码S型半胱氨酸蛋白酶基因的cDNA全长,命名为Rs-CPS(GenBank登录号EU659125)。Rs-CPS基因全长为1112bp,编码314个氨基酸,分子量为34.69ku。分析结果显示:Rs-CPS氨基酸序列具有半胱氨酸蛋白酶家族典型的Cys-His-Asn三联体酶催化活性中心,而且N端有1个17个氨基酸残基组成的信号肽。
- 吕春花肖罗茆振川陈国华杨宇红谢丙炎
- 关键词:相似穿孔线虫半胱氨酸蛋白酶克隆进化分析
- 香蕉穿孔线虫β-1,4-内切葡聚糖酶基因的克隆与特征分析被引量:3
- 2008年
- 植物寄生线虫的分泌物在线虫的侵染过程中具有重要的作用,其中纤维素水解酶是研究较多的主要分泌物之一。采用RT-PCR和RACE方法,从香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)中获得编码β-1,4-内切葡聚糖酶基因的cDNA序列,命名为RS-eng-1(GenBank登录号为EU414839)。该cDNA序列全长1630bp,包含一个1404bp的开放阅读框(ORF),编码含467个氨基酸的蛋白,理论分子量与等电点分别为48.22kD和6.04。序列分析表明该酶含有糖基水解酶家族5(GHF5)的保守结构域,N端具有22个氨基酸残基组成的信号肽,C端含有细菌式样的纤维素结合域(CBDⅡ)。原位杂交结果显示此基因在香蕉穿孔线虫的食道腺部位表达,并且Southern结果显示其为多拷贝基因。cDNA与基因组DNA重叠分析表明,此基因包含6个内含子,切割点符合5′-GT...AG-3′的规律。进化分析表明该酶与细菌Bacillus subtilis和Erwina carotovora分泌的纤维素酶属于同一支,推测其来源于细菌的水平基因转移。
- 肖罗陈国华戴良英吕春花杨宇红谢丙炎
- 关键词:香蕉穿孔线虫香蕉Β-1,4-内切葡聚糖酶原位杂交