董园园
- 作品数:71 被引量:106H指数:6
- 供职机构:吉林农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学文化科学医药卫生更多>>
- 植物干旱诱导型合成启动子SP15及其应用
- 本发明公开了一种植物诱导型启动子SP15,它的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;一种植物表达载体,它是在载体质粒中插入了如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列;以及启动子SP15在培育抗干旱转基因植物的应用;本发...
- 李海燕李晓薇王法微王南刘伟灿周永刚董园园刘秀明姚娜刘欣高延妍
- 人参classIII几丁质酶Gchi1基因克隆及原核表达分析
- 2013年
- 几丁质(N-乙酰氨基葡萄糖线性聚物)是病原真菌细胞壁的主要成分,几丁质酶通过破坏细胞新物质的沉积,激发寄主植物的抗病反应,使病原真菌细胞壁中的几丁质降解。植物几丁质酶具有广泛的生理活性。几丁质的酶基因工程成为目前抗真菌基因工程研究热点之一。本研究通过几丁质酶基因的克隆,构建原核表达载体pET-28a(+)-GchiI,利用IPTG诱导表达,经PAGE分析表明,该基因表达的蛋白分子量为34kD左右,其表达产物主要以包涵体的形式存在。抑菌圈试验发现,IPTG浓度为0.6mmol/L时抑菌效果最佳。本研究对利用基因工程技术培育抗病作物品种,提高作物抗病性具有重要参考价值。
- 王南董园园姚娜刘秀明王法微李海燕
- 关键词:人参几丁质酶基因
- 大豆GmEPSPS1和GmEPSPS2定向突变修饰基因及其克隆方法和应用
- 大豆GmEPSPS1和GmEPSPS2定向突变修饰基因及其克隆方法和应用,属于分子生物学和生物领域。本发明中,大豆GmEPSPS1基因在植物EPSPS酶保守区发生定向单氨基酸和双氨基酸置换后的基因序列分别为SEQ ID ...
- 李海燕刘伟灿李晓薇王法微周永刚王南董园园
- 文献传递
- 大豆低温诱导人工合成启动子SP5及应用
- 本发明公开了一种大豆低温诱导启动子SP5,它是以大豆中的Glyma18g03930基因启动子区 179 bp、Glyma09g29840基因启动子区382 bp、以及35S核心启动子Core CaMV 35S连接构建而成...
- 李海燕李晓薇王法微刘伟灿王南董园园刘秀明姚娜刘欣肖洪庆侯心悦
- 红花CtWD40转录因子家族基因的生物信息学分析被引量:6
- 2020年
- WD40转录因子家族是真核生物中广泛存在的基因超家族,与植物生长及发育调控密切相关。并且在以往的研究中发现WD40转录因子参与花色苷的合成,而花色苷是红花类黄酮化合物的重要组成之一。该研究通过生物信息学手段及基因表达分析方法鉴定了红花基因组中40个CtWD40家族成员。研究根据拟南芥等植物WD40蛋白序列及系统发育特点将红花CtWD40家族归为7个亚家族,结合保守基序分析揭示每个亚家族成员特定的保守基序与基因结构,发现进化关系邻近的家族成员在保守基序与基因结构上具有一定的相似性。其次,基因启动子顺式作用元件搜索发现CtWD40特定启动子元件,揭示其可能参与的代谢途径。接下来,使用功能富集分析,分析CtWD40蛋白的功能类别和细胞定位,并通过CtWD40蛋白间相互作用,预测其潜在的调控功能。最后,根据qRT-PCR揭示了红花CtWD40亚家族19个成员在红花不同组织及花期中的差异表达。该研究为红花CtWD40基因功能验证及表达分析提供了理论依据。
- 王刚章正仁王一非洪瑛琦刘秀明姚娜董园园李海燕
- 关键词:红花生物信息分析系统发育
- 红花bHLH转录因子基因的克隆、表达分析及植物表达载体构建被引量:2
- 2019年
- 克隆红花花瓣中bHLH(basic helix-loop-helix)基因,研究其在红花不同开花时期花瓣中的表达量并构建其植物表达载体。利用红花基因组测序结果中富集到的bHLH家族中的基因CtbHLH1的开放阅读框,设计特异性引物进行PCR扩增。利用RT-PCR法分析在红花不同开花时期花瓣中bHLH1基因的表达量,同时构建植物表达载体p BASTA-bHLH1。获得bHLH1基因全长897 bp,编码298个氨基酸。红花bHLH1与其他物种氨基酸具有一定的同源性,其与烟草的氨基酸序列相似性最高。实时荧光定量PCR分析表明,CtbHLH1基因在红花不同组织及不同开花时期的花瓣中表达水平具有显著差异,其在花瓣中表达量高,开花第3天表达量最高,末花期表达量低。另外其在根中有表达,在茎、叶中表达量极低。该研究成功地对bHLH1基因进行克隆及表达分析,并构建植物表达载体p BASTA-bHLH1。
- 姚娜刘建雨田媛媛董园园刘秀明李海燕
- 关键词:红花类黄酮植物表达载体
- 红花microRNAs靶基因的生物信息学预测
- 2012年
- miRNA是一类动、植物细胞中负责转录后调控的非编码RNA,植物的miRNA通常来源于具有茎环结构的单链RNA前体上,加工成熟后同ARGONAUTE转变成蛋白复合体结构,通过结合并沉默蛋白合成模板的方式关闭完整的基因表达网络。由于miRNA存在组织表达的特异性,且miRNA在植物中的表达高度保守。通过高通量测序获得的红花(Carthamus tinctorious L.)miRNA序列信息与红花转录EST数据库比对,通过靶基因预测筛选,对属于104个家族的173个红花miRNA进行预测,其中得到109个miRNAs对应调控的385个红花靶基因。并且通过Nr基因注释表明多数红花miRNA的靶基因编码包括调控细胞生长发育、信号转导及新陈代谢等相关的功能蛋白。
- 董园园李海燕李校堃杨树林
- 关键词:红花MICRORNA
- 红花CtWD40基因克隆及表达分析被引量:1
- 2019年
- 目的克隆红花WD40(CtWD40)转录因子,分析其在不同组织间的表达水平及与红花羟基黄色素含量的相关性。方法以红花花瓣转录组WD40候选基因为参考,克隆获得CtWD40基因序列。同时对该转录因子保守结构域、蛋白三维结构及系统发育等内容进行生物信息学分析,荧光定量PCR方法研究了该基因在红花不同组织中基因表达差异,并采用HPLC法测定红花各花期花瓣中羟基红花黄色素A含量。结果成功克隆CtWD40基因并且发现该蛋白序列中8个保守WD结构域,通过系统发育分析发现CtWD40与菊科WD40蛋白亲缘关系最近。结论 CtWD40基因在在不同花期花瓣组织中出现先升高后降低表达趋势,皮尔森相关系数分析揭示CtWD40在花瓣中基因表达水平与羟基黄花黄色素A含量具有显著相关性。
- 董园园李俊锋彭鸿远王一非王刚王丽艳姚娜刘秀明李海燕
- 关键词:红花转录因子基因克隆
- 植物microRNA调控及其应用研究进展被引量:2
- 2015年
- 作为非编码小RNA,microRNA主要在转录后水平调控基因表达和蛋白翻译。在植物中microRNAs广泛参与植物生长各个过程。该研究综述了microRNA在植物中的合成过程及靶基因鉴定,对microRNA的组织发育及逆境调控方面的最新研究进展也作了较为详细的阐述。
- 赵利旦董园园李海燕
- 关键词:MICRORNA转录后调控非生物胁迫
- 盐碱胁迫下羊草转录因子的转录组分析被引量:5
- 2017年
- 以羊草为试材,采用罗氏454二代测序方法,研究了羊草转录因子家族在逆境胁迫条件下来自38个家族的243个转录因子表达差异模式,以期揭示WRKY、C3HL、NAC等转录因子家族差异基因数量,探讨羊草的抗逆分子机制。结果表明:羊草转录组测序片段经de novo拼接共获得104 105条Unigene序列,对照含有97个转录因子基因,盐碱处理组含有213个转录因子,其中67个转录因子为2组共表达。差异基因表达分析揭示羊草主要通过WRKY、C3HL、NAC转录因子家族的差异表达调控盐碱适应性。该研究为耐盐碱型作物培育奠定了基础。
- 董园园李晓薇姚娜刘秀明陈欢李海燕
- 关键词:羊草转录因子盐碱胁迫高通量测序