李宏博
- 作品数：32 被引量：213H指数：9
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- 基于高效SNP芯片的小麦产量相关性状全基因组关联分析
- 2023年
- 挖掘小麦产量相关性状的稳定关联位点,为相关基因克隆和分子标记辅助选择提供理论依据。本研究以248个中国北部冬麦区育成品种为材料,利用自主研发的Affymetrix BAAFS Wheat 90K SNP芯片对株高、穗长、小穗数、穗粒数、有效分蘖数、粒长、粒宽和千粒重共8个产量相关性状进行全基因组关联分析。共检测到158个与8个性状显著关联(P≤0.00001)的SNP位点,其中45个位点至少在两个环境中稳定表达,解释平均表型变异的3.60%~10.51%。在这45个位点中,有8个稳定关联位点与以往的研究结果一致;37个为新发现稳定位点,其中3个与株高稳定关联的位点,分布在7D染色体上,解释表型变异的3.60%~4.39%;9个与穗长稳定关联的位点,分别分布在1D、3A、5B和7D染色体上,解释表型变异的5.61%~8.42%;1个与穗粒数稳定关联的位点,分布在7D染色体上,解释表型变异的6.06%~7.22%;8个与有效分蘖数稳定关联的位点,分布在1B染色体上,解释表型变异的6.33%~8.73%;6个与粒长稳定关联的位点,分别分布在2A和5B染色体上,解释表型变异的5.45%~6.62%;7个与粒宽稳定关联的位点,分别分布在4B和5A染色体上,解释表型变异的6.90%~10.51%;3个与千粒重稳定关联的位点,分布在3A染色体上,解释表型变异的7.05%~7.69%;对稳定位点进行候选基因分析,筛选到45个候选基因,其中有功能注释的基因41个,其中4个位于基因内。
- 刘丽华刘阳娜周悦李宏博张明明屈平平赵昌平庞斌双
- 关键词：小麦产量相关性状
- 分子标记在我国区域试验小麦品种DUS检测中的应用
- 植物新品种必须具备特异性、一致性和稳定性(DUS)，根据国家标准《植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南普通小麦》(GB/T 19557.2—2004)，小麦品种的DUS测试需要对测试品种全生育期25～56个重要表型和...
- 王立新常利芳李宏博季伟刘丽华赵昌平
- 关键词：冬小麦分子标记
- 文献传递
- 高通量SSR标记技术在小麦品种检测中的应用研究
- 本研究通过对PCR热循环条件、特征峰值识别、等位变异赋值以及多重电泳体系构建等进行探索，以检测结果准确、稳定、快速为原则，建立基于SSR荧光标记的小麦品种高通量检测技术，并应用于2014年区域试验品种的特异性、一致性、稳...
- 李宏博
- 关键词：小麦荧光标记
- 文献传递
- 2009-2015年北京市冬小麦区域试验品系的DNA指纹分析被引量：1
- 2016年
- 以2009-2015年参加北京区域试验的小麦品系为材料,利用SSR标记进行指纹分析,旨在为小麦品种管理和品种改良提供参考。在130个参试品系中,共检测出一致性和稳定性较差的品系30个、疑似品系28个、两年度间更换样品的品系2个,其中2013-2015年检测出的有问题品系相对较少。遗传多样性分析结果显示,参试品系间存在着一定的遗传差异,但骨干亲本的高频率使用降低了群体的遗传多样性;不同年度间的遗传多样性无明显变化。在今后小麦育种工作中,应尝试在育种资源、育种模式以及育种方向上进行改变,提高北京市小麦品种的遗传多样性,拓宽品种的遗传基础。
- 刘丽华庞斌双李宏博刘阳娜福德平王娜赵昌平
- 关键词：冬小麦SSR标记品系
- 小麦F型雄性不育系和恢复系SSR指纹图谱构建及遗传差异分析被引量：3
- 2017年
- 基于荧光毛细管电泳检测系统和SSR指纹数据库管理系统,采用21对SSR核心引物对小麦F型不育系和恢复系进行SSR指纹图谱构建和遗传差异分析,以保护其品种权,同时为杂交组合的选配提供参考。结果显示21对核心SSR引物在F型不育系和442个恢复系中共检测到214个等位变异,不同位点等位变异数的变幅为6~16,平均等位变异数为10.76个;平均多态性信息含量(PIC)与基因多样性分别为0.70和0.73,21对核心SSR引物的分辨率达100%;获得了每份材料独特的DNA指纹图谱报告,为品种权保护提供了技术支撑;恢复系间的遗传距离为0.014~0.952,平均遗传距离为0.723,遗传距离大于0.500的占95%,说明恢复系间遗传多样性比较丰富;不育系与恢复系材料间的遗传距离为0.300~0.952,平均遗传距离为0.681,遗传距离大于0.500的占93%,说明不育系材料与恢复系材料间遗传差异较大,可以从中选择遗传距离大的配制组合。
- 刘丽华苑少华冯树英庞斌双李宏博刘阳娜张立平赵昌平
- 关键词：小麦恢复系SSR标记
- 玉米锌铁调控转运体ZmZIPs基因及其应用
- 本发明公开了玉米锌铁调控转运体ZmZIPs基因及其应用。本发明从玉米中分离得到5个锌铁调控转运体ZmZIPs基因，其cDNA序列分别选自SEQ ID No.1、SEQ ID No.3、SEQ ID No.5、SEQ ID...
- 李素贞陈景堂李宏博赵永锋郭晋杰
- 文献传递
- 小麦种子纯度的分子标记检测方法被引量：31
- 2009年
- 为了探索一种准确评价小麦品种种子纯度的技术体系,在比对了400个小麦品种的SSR、EST-SSR和AFLP-SCAR指纹以及对上千份种子进行纯度检测的基础上,提出了检测种子纯度的策略:(1)联合使用SSR、EST-SSR和AFLP-SCAR标记检测种子纯度,并推荐了7对SSR引物、5对EST-SSR引物和3对AFLP-SCAR引物为检测种子纯度的核心引物;(2)在待测品种的种子之间比对核心分子标记位点的带型,当某(些)个体与多数个体之间≥3位点的带型不同时,方可判定为杂株。此外,本文还就如何提高种子纯度检测的工作效率、降低检测成本,提出了合理利用核心引物和合理混合DNA样品的方法。
- 王立新常利芳李宏博葛玲玲信爱华高世庆季伟孙辉赵昌平
- 关键词：普通小麦种子纯度分子标记
- 2009-2014年国家冬小麦区域试验品系的遗传多样性及群体结构分析被引量：25
- 2016年
- 为了解我国小麦的育种水平、发展趋势及存在的问题,利用21对核心SSR标记对2009-2014年参加国家冬小麦区域试验的430个品系进行遗传多样性和群体结构分析。结果显示,21个SSR位点共检测到236个等位变异,平均每个位点11.24个,平均基因多样性和多态性信息量(PIC)分别为0.73和0.70;从不同年份分析,参试品系的遗传多样性从2012年开始略有下降;从不同生态种植区域分析,参试品系的遗传多样性自北向南(北部冬麦区组至长江流域冬麦区组)呈明显下降趋势;UPGMA聚类、主坐标和群体结构分析均表明,长江上游和长江中下游组的参试品系与其他区组的参试品系明显分开,且分别归属于不同亚类,显示出独特的生态区域类型;此外,群体结构分析结果还揭示,71.9%的参试品系群体结构比较单一,其中长江流域组的参试品系最为单一。
- 刘丽华庞斌双刘阳娜邱军李宏博张欣王娜赵昌平
- 关键词：小麦SSR标记
- 小麦种子规模化DNA提取及检测体系的优化被引量：1
- 2019年
- 以小麦种子分子检测农业行业标准(NY/T 2859-2015)为基础,开发小麦种子快速、规模化提取DNA方法,优化反应体系中各组分含量,为小麦真实性快速执法提供技术支撑。通过对SDS、CTAB、高盐低pH、快速提取和试剂盒5种方法提取的DNA质量、浓度和PCR扩增效果进行比较,发现改进的高盐低p H方法提取种子的DNA质量、浓度能够满足小麦真实性鉴定中42对SSR引物重复鉴定的需求,是利用96孔深孔板和自动化移液工作站规模化、高通量提取DNA的较优方法。进一步优化结果显示该方法在65℃温浴条件下比室温的浓度高出25%,但两种温度条件下提取的DNA质量及浓度均能够满足品种鉴定的需求;沉淀时用0.5倍提取液体积的预冷异丙醇沉淀浓度最高,用室温的异丙醇沉淀的最佳体积是提取液体积的0.6倍。对标准中42对引物的最佳引物浓度和模板浓度均进行了优化,综合所有42对引物的优化结果发现,反应体系为20μL时,引物终浓度为0.437 5μmol/L,模板终浓度为10 ng/μL时扩增效率相对较高,扩增产物稳定,能够满足多重电泳的需求。
- 张明明刘丽华赵建宗张力科刘阳娜李宏博张风廷姚骥庞斌双赵昌平
- 关键词：小麦种子DNA提取PCR反应体系
- 基于SNP标记的小麦高通量身份鉴定模式被引量：15
- 2018年
- 为探索小麦品种高通量SNP身份鉴定模式,利用wheat 90K SNP芯片对380份小麦品种进行了全基因组扫描、分析和评价,从中筛选出高质量、高分辨率、单拷贝和均匀分布的候选SNP标记384个,能将除近等基因系以外的所有品种区分开;基于组合最优化算法,获得小麦品种高通量鉴定最少SNP位点组合一套,包含14个SNP标记,区分能力与384个SNP标记相同。将14个SNP位点转化成KASP标记,分析选取的95份样品,结果显示,芯片平台和KASP平台上的基因分型结果一致。考虑品种实际鉴定过程中存在样本量大、高度近似品种少等情况,权衡准确、经济、灵活、快速、通量高等检测需求,建议品种高通量身份鉴定可采取"核心位点+扩展位点"的模式进行。本研究为小麦等农作物品种SNP高通量身份鉴定技术体系的建立和指纹数据库的构建提供了有利的参考。
- 刘丽华庞斌双刘阳娜李宏博王娜王拯赵昌平
- 关键词：小麦SNP高通量
