张文娟
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 紫花苜蓿几丁质酶ClassⅠ基因cDNA全长克隆及序列分析被引量：1
- 2011年
- 依据NCBI中已登录的截形苜蓿(Medicago truncatula)几丁质酶基因的一段EST序列(GenBank登录号:AF167323)设计引物,以紫花苜蓿(Medicago sativaL.)为试验材料,利用RACE技术进行cDNA全长克隆。利用生物信息学软件对该序列进行分析得知:该基因全长1 132 bp,其中含有1个930 bp的开放阅读框,编码309个氨基酸。分子质量为33.538 ku,等电点pI为5.258,是一个酸性蛋白且分泌到胞外。将该基因命名为MsChiⅠ(GenBank登录号为HM224449)。聚类分析显示:它与其他已知植物ClassⅠ类几丁质酶基因具有高度的同源性;结构分析表明:该蛋白的二级结构中α螺旋、延伸链、β转角和无规则卷曲分别占25.89%、10.68%、4.21%、59.22%;功能分析可知:该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,属于几丁质酶第19家族。
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- 关键词：紫花苜蓿几丁质酶基因CDNA克隆
- 紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2010年
- 本文根据截叶苜蓿(Medicago truc atula)几丁质酶ClassⅢ基因(GenBank:AY294484.1)的全长序列设计引物,通过RT-PCR的方法得到紫花苜蓿(Medicago sative)几丁质酶ClassⅢ的核酸序列,命名为MsChiⅢ,在NCBI中的登录号为FJ872918。利用生物信息学软件分析MsChiⅢ,预测氨基酸序列的等电点、二级结构和三级结构,并构建系统发育树。结果显示该核酸序列全长为953bp,包括完整的开放阅读框,编码301个氨基酸,等电点为8.212。该序列所编码的蛋白属于几丁质酶18家族的内切酶,分布于细胞间隙,并含有几丁质酶18家族的特征序列——LGDVDFDIE,并预测MschiⅢ可能是一种具有几丁质酶和溶菌酶的双功能酶。
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- 关键词：紫花苜蓿几丁质酶生物信息学
