张彩云
- 作品数：23 被引量：68H指数：6
- 供职机构：福州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：福州市科技计划项目福建省科学技术厅重点项目更多>>
- 相关领域：医药卫生理学农业科学建筑科学更多>>
- 福州市手足口病病原构成及肠道病毒71型VP1基因特征分析被引量：1
- 2016年
- 目的探讨福州地区手足口病（HFMD）病原谱构成及肠道病毒71型（EV71）的基因特征。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽拭子或肛拭子标本1 235例,通过real-time PCR法确定所有标本的肠道病毒型别。获取EV71型分离株,并对VP1基因片段进行测序,利用DNAStar和Mega 5.1软件进行核苷酸、氨基酸同源性分析并构建系统发生树。结果共检测出932份肠道病毒阳性标本,其中EV71、柯萨奇A16型（Cox A16）和其他肠道病毒的阳性率分别为34.5%（426/1 235）、9.8%（121/1 235）、31.2%（385/1 235）。40株EV71型分离株的VP1基因核苷酸同源性为91.0%~100.0%,氨基酸同源性为95.0%~100.0%。40株病毒基因在系统发生树上与C4基因亚型最为相近,属于C4a基因亚型。结论 EV71是引起福州地区手足口病流行的主要病原体,EV71型病毒株均属于C4a基因亚型,与同期中国大陆EV71参考株基因型相似。
- 蒋晓虹姚栩关振华谢迺鸿张彩云张晓阳
- 关键词：手足口病肠道病毒71型VP1区
- 福州市甲型H1N1流感病毒血凝素基因遗传特性研究
- 2011年
- 目的探究福州市甲型H1N1流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的遗传变异特点及种系进化分布,为研究甲型H1N1流感病毒进化、致病性和流行规律提供科学依据。方法采用MDCK细胞培养法和real-time PCR法进行流感病毒分离、鉴定。采用逆转录-聚合酶链反应扩增流感病毒血凝素基因,扩增产物经纯化后,进行血凝素基因HA区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后用DNASTAR MegAlign序列分析软件进行基因种系进化特性分析。结果福州市甲型H1N1流感病毒与参考株A/California/04/2009相比具有高度同源性,HA蛋白有4个位点氨基酸发生了替换,与猪流感代表株A/swine/Iowa/15/1930(H1N1)存在6个HA抗原决定簇位点变异。福州市甲型H1N1流感病毒株都有8个糖基化位点,其中6个位于HA1区,分离株HA蛋白不具有多碱基裂解位点,具有低致病性流感病毒特点。与美国流感病毒A/California/04/2009(H1N1)株共聚类为一个独立的小分支,进化关系最近,甲型H1N1流感病毒的HA源于古典型猪H1N1流感病毒,与A/swine/Iowa/1/1976(H1N1)的种系关系密切。结论福州市首例甲型H1N1流感病毒株与北美流行株高度同源,相对于以往古典型猪流感代表株出现HA蛋白抗原性漂移,应进一步加强流感病原学变异监测。
- 姚栩陈智伟张彩云夏晓峰杨建娜郑能雄
- 关键词：甲型H1N1流感病毒血凝素基因
- 应用PCR-RFLP技术进行乙型流感病毒鉴别的实验研究被引量：3
- 2007年
- 目的:应用聚合酶链反应(PCR)连接的限制性片段长度多态性(RELP)技术进行乙型流感病毒及其巴拿马株与维多利亚株两大谱系的鉴别。方法:根据GenBank中登录乙型流感病毒血凝素(HA)区域的核苷酸序列,应用软件进行序列比对,根据HA基因的保守区设计、筛选引物,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增流感病毒HA基因,用限制性内切酶H indⅢ酶切扩增产物并进行琼脂糖凝胶电泳,同时对检测方法进行特异性和灵敏性实验。结果:该方法对乙型流感病毒有特异性,与甲1和甲3型流感病毒无交叉反应。维多利亚株和巴拿马株HA基因均能被特异性引物所扩增,扩增产物经H indⅢ酶切后,乙型流感病毒巴拿马株在电泳谱上出现603 bp与242 bp的两个可见片段,而维多利亚株因无H indⅢ酶切位点,仍呈872 bp的一个片段。该方法检测敏感度可达0.1 TC ID50。结论:该方法是一种灵敏度高、特异性强的乙型流感病毒维多利亚株与巴拿马株鉴别的方法。
- 姚栩张彩云陈智伟杨建娜郑能雄
- 关键词：乙型流感病毒限制性片段长度多态性聚合酶链反应
- 2016-2018年福州市诺如病毒聚集性暴发疫情的病原学特性分析被引量：8
- 2020年
- 目的了解福州市2016-2018年诺如病毒(norovirus,NV)聚集性暴发疫情特点及病原学基因特性。方法将2016-2018年福州市疾病预防控制中心实验室收到的疑似NV引起的急性胃肠炎患者标本,应用实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time PCR)进行NV特异性核酸片段检测,选取部分毒株进行VP1区域基因扩增并将产物进行测序,应用分析工具进行NV的基因序列比对,绘制进化树并进行种系进化分析。结果福州市共报告NV聚集性暴发疫情46起,共采集患者标本282份,检测到阳性标本164份。其中NV GⅠ型7份,GⅡ型146份,GⅠ+GⅡ型11份。从阳性标本中选择出部分样本进行亚型分型,在21份标本中基因亚型为GⅠ.6亚型的2份,GⅡ.2亚型9份,GⅡ.3亚型4份,GⅡ.4亚型2份,GⅡ.6亚型2份,GⅡ.17亚型2份。结论2016-2018年福州市NV聚集性疫情主要由GⅡ型所致,GⅡ.2亚型为福州地区优势毒株,存在多个亚型的NV流行且具有遗传多样性。
- 姚栩蒋晓虹蒋晓虹张彩云张彩云
- 关键词：诺如病毒暴发疫情病原学基因型
- 福州市乙肝病毒基因型和基因亚型的分布及其与前C、C基因启动子变异的关系被引量：8
- 2008年
- 目的研究福州市乙肝病毒基因型和亚型分布及其与T1762/A1764、A1896变异的关系,为完善预防、诊断、治疗病毒感染的策略和方法提供科学依据。方法应用型特异性引物PCR法检测HBsAg阳性血清的基因型,应用PCR-RFLP方法检测基因亚型、T1762/A1764变异和A1896变异。结果282份HBsAg阳性血清样品中103份未能成功分型,其余179份样品中B基因型122份(68.2%),C基因型54份(30.2%),B+C型3份(1.7%),未检测到其他基因型。随机选取的100份B基因型样品中,Ba亚型71份(71.0%),Bj亚型8份(8.0%),未能分亚型者21份(21.0%)。54份C基因型样品中Ce亚型31份(57.4%),Cs亚型14份(25.9%),Ce+Cs1份(1.9%),未能分亚型者8份(14.8%)。T1762/A1764变异标本9份(8.7%),Ce亚型变异率最高(29.2%),Ba亚型次之(3.3%),Cs和Bj亚型未检测到变异株,T1762/A1764变异在不同基因型和亚型间的分布差异有统计学意义(P<0.05)。A1896变异标本10份(10.0%),Ba亚型变异率最高(14.0%),Cs亚型次之(10.0%),Ce亚型最低(4.0%),不同基因型和亚型中的变异差异无统计学意义(P>0.05)。HBeAg阳性和阴性样品中的基因型和亚型分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论福州市乙肝病毒以B、C基因型为主,Ba、Ce亚型占优势,HBV各基因型和亚型发生T1762/A1764、A1896变异的模式不同。
- 郭燕郑能雄姚栩纪惠玲陈智伟陈艳徐珊张彩云黄晓霞杨建娜卢园
- 关键词：基因型基因亚型
- 福州市人感染H7N9流感病毒基因特性分析
- 2018年
- 目的了解福州市人感染H7N9流感病毒基因特性及进化分布。方法对2013-2016年福州市流感监测网络实验室从监测哨点医院采集的不明原因肺炎病例中人感染H7N9流感病毒核酸检测阳性的标本进行病毒分离,选取部分H7N9禽流感病毒株进行基因组基因序列测定,使用DNAman.exe分析软件进行基因序列比对,并对病毒关键位点的氨基酸变异情况进行分析,绘制遗传进化树进行进化分布分析。结果血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因进化树分析结果显示福州市人感染H7N9禽流感病毒株与以上海、浙江为代表的长三角分支相近。7株毒株中均出现可导致宿主特异性改变、病毒传播力、致病力、毒力及复制能力增强的相关致病位点突变。病毒的HA蛋白受体结合区均发生G186V和Q226L这2个关键氨基酸位点的变异,HA蛋白裂解位点序列均为PEIPKGR↓GLF,含有2个碱性氨基酸。7株病毒的NA蛋白茎杆区69~73位氨基酸均出现缺失。病毒的M2蛋白均发生S31N突变。结论福州市人感染H7N9病毒株具有遗传多样性及复杂性,呈现致病力增强、对金刚烷胺类药物耐药等特点,在监测工作中应加强病原学的监测和遗传变异特性的研究。
- 姚栩蒋晓虹张彩云谢迺鸿陈玲玲
- 关键词：基因特征
- 福州市柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析被引量：2
- 2016年
- 目的了解福州地区流行的柯萨奇病毒A10型（CV-A10）的VP1区基因特征及种系进化分布。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽拭子或肛拭子样本，通过real—time PCR法确定样本的肠道病毒型别。选取部分CV—A10的临床样本，利用RD细胞进行病毒分离，RT—PCR扩增肠道病毒的VPl基因片段，并进行序列测定，利用DNAStar和MEGA5.1软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析并构建亲缘进化树。结果检测出的1951份肠道病毒阳性样本中，肠道病毒71型（EV-A71）、柯萨奇病毒A16型（CV-A16）、CV-A10的阳性率分别为24．1％，16．7％，9．4％，不同肠道病毒阳性率差异有统计学意义。福州市CV-A10型各分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为94．0％～99．9％和97．7％～100．0％，与CV—A10原型株（Kowalik株）的同源性分别为76．4％～76．7％和91．9％～93．3％。亲缘进化树的分析结果显示福州地区CV-A10分离株属于D亚型。结论CV-A10是引起福州地区手足口病的常见病原体之一，本次分离到的CV—A10病毒株均属于D基因型。
- 姚栩蒋晓虹谢迺鸿张彩云关振华张晓阳
- 关键词：手足口病VP1区基因亚型
- 福州市柯萨奇A6型流行情况及VP1区基因特征分析被引量：7
- 2018年
- 目的了解福州市柯萨奇病毒A6型(Cox A6)的流行情况及VP1区基因特征及种系进化分布。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽试子或肛拭子标本,通过real-time PCR法选取部分重症患者柯萨奇病毒A6型阳性标本,采用RD细胞分离病毒,RT-PCR扩增VP1基因片段并测序,利用DNAStar和Mega 5. 1软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析并构建亲缘进化树。结果检出的3 237份肠道病毒阳性样本中,肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)、Cox A6的阳性率分别为22. 0%、14. 4%、23. 9%,不同肠道病毒阳性率差异有统计学意义(P <0. 05)。福州市CVA6型分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为96. 3%～100%和97. 4%～100%,与原型株CV-A6/Gdula的同源性分别为81. 6%～83. 5%和94. 1%～95. 7%。进化树的分析结果显示,福州市Cox A6分离株属于D基因型。结论 Cox A6是引起福州市手足口病的主要病原体之一,本次分离得到的Cox A6病毒株均属于D基因型。
- 谢迺鸿姚栩陈智伟蒋晓虹张彩云张晓阳
- 关键词：手足口病VP1区基因亚型
- 新型冠状病毒肺炎患者恢复期PBMC中SARSCoV-2中和抗体检测分析
- 2022年
- 目的分析新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者恢复期外周血单个核细胞(PBMC)中急性呼吸综合征冠状病毒-2(SARS-CoV-2)中和抗体的检测作用。方法回顾性分析40例COVID-19患者的临床资料,对其血浆进行假病毒中和实验,筛选具有中和效果患者的PBMC,再对其进行记忆B细胞筛选,并分析SARS-CoV-2中和抗体检测结果。结果此次筛选的中和抗体中获得5个中和效果较好以及亲和力高的抗体,为进一步检测阳性样本的中和作用是否为SARS-CoV-2特异性中和,对水疱性口炎病毒(VSV)、急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)进行检测。检测结果显示:编号为415、726、1151的样本阳性,于1︰30稀释度下,对于3种病毒具有微弱的抑制性,表明此中和为非特异性中和作用;编号130、642、1143的样品,对于2种病毒具有较弱的中和作用;采用1︰90、1︰270的梯度进行稀释时,所有样本检测结果均为阴性。结论COVID-19恢复期患者PBMC中SARS-CoV-2中和抗体检测结果显示,PBMC中具有特异的抗SARS-CoV-2作用,对于临床早期诊断及治疗此病可提供可靠依据。
- 陈智伟陈敏红谢迺鸿张彩云卢园姚栩
- 关键词：外周血单个核细胞中和抗体核酸检测
- 2008年福州市肠道病毒71型毒株VP1基因的进化分析
- 2009年
- 目的：对FZ06008株、FZ17408株VP1进行基因特性分析。方法：采集福州市2008年6月手足口病人的标本,接种于RD细胞进行病毒分离,采用RT-PCR方法进行核酸鉴定,将VP1基因克隆和序列测定,并利用DNA-STAR软件对VP1基因进行遗传性分析。结果：与标准株B rCr相比,FZ06008和FZ17408的VP1编码区没有出现核苷酸的缺失和插入,氨基酸同源性约为94.6%,核苷酸同源性约为79.1%;与安徽省2008年流行株703813-Fuyang-08和我国深圳2003年流行的SHZH03株相比,氨基酸同源性约为99%-99.3%。结论：FZ06008株和FZ17408株有可能来源于2003年深圳地区EV71大规模流行时的毒株,其进化途径可能与安徽阜阳的标准株703813-Fuyang-08相近。
- 陈智伟郑能雄姚栩纪惠玲张彩云
- 关键词：肠道病毒71型VP1基因氨基酸同源性
