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尹辉

作品数：3 被引量：2H指数：1
供职机构：四川大学化学工程学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学自动化与计算机技术轻工技术与工程化学工程更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇化学工程
  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇轻工技术与工...

主题

  • 2篇支持向量
  • 2篇向量
  • 2篇B因子
  • 1篇支持向量回归
  • 1篇支持向量机
  • 1篇生物化学
  • 1篇生物化学反应
  • 1篇网络
  • 1篇向量机
  • 1篇酶结构
  • 1篇核函数
  • 1篇氨基酸残基
  • 1篇SVM
  • 1篇FVM
  • 1篇残基

机构

  • 3篇四川大学

作者

  • 3篇李梦龙
  • 3篇尹辉
  • 2篇敬闰宇
  • 2篇文志宁
  • 2篇李益洲
  • 1篇胡美
  • 1篇孙婧

传媒

  • 1篇分析化学
  • 1篇计算机与应用...
  • 1篇第十一届全国...

年份

  • 2篇2011
  • 1篇2009
共 3 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
Lasso与支持向量机在预测B因子中的应用
生物信息学是一门利用计算机技术研究生命系统规律的新兴学科。蛋白质组学作为生物信息学中的一部分,对于研究疾病发生、细胞代谢等过程起着很重要的作用。B因子(B factor)是由X晶体衍射得到的用于反应构象稳定程度的因子,对...
敬闰宇尹辉李梦龙孙婧
关键词：支持向量机SVM核函数FVM
支持向量回归预测蛋白质残基的B因子被引量：2
2011年
蛋白质分子的柔性在各种生物进程中如酶催化、蛋白质分子绑定和识别等发挥着重要的作用。研究蛋白质分子柔性有助于更好地理解蛋白质的功能,研究证明从X射线晶体衍射结构而来的B因子能够较好的衡量蛋白质分子的柔性。从蛋白质序列出发,以保守信息、预测的二级结构、预测的相对溶剂可及性和氨基酸4种物理化学性质作为特征向量,利用支持向量回归方法对蛋白质的B因子进行预测。考察了邻近残基的影响,采用滑动窗口方法对所有特征变量进行了处理。通过对位置特异得分矩阵的平滑窗口处理,提高了预测精度。以皮尔逊相关系数为算法评价指标,最终得到独立测试集的皮尔逊相关系数为0.56,表明该方法有效提高预测精度。
尹辉敬闰宇李益洲文志宁李梦龙
关键词：B因子支持向量回归
酶结构的网络表征及催化位点的预测
2009年
酶是生物体内的一种活性催化剂，通过绑定反应底物降低反应活化能从而高效催化各种生物化学反应。酶催化活性中心由少数氨基酸残基组成，它们直接参与酶反应，包括质子交换、结构的稳定和底物绑定等。尽管越来越多的酶结构已被测定，但现在从结构仍难以确定催化位点。大量文献报道了酶催化残基预测相关的工作，并提出了对催化位点的各种描述。
李益洲胡美尹辉李梦龙文志宁
关键词：酶结构生物化学反应氨基酸残基网络
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