姚玉华
- 作品数：14 被引量：6H指数：2
- 供职机构：浙江理工大学更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生文化科学更多>>
- 蛋白质结构类预测方法研究进展
- 2015年
- 蛋白质结构类型是蛋白质高级结构中基本原件的空间分布,是蛋白质高级结构与功能研究的基础,该研究对蛋白质组学具有重要意义。通过传统实验方法研究蛋白质结构类需要耗费大量的人力、财力、物力,也无法满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长的现实需要。目前,基于已积累数据,探索理论计算方法预测蛋白质结构类是当前生物信息学的重要研究内容之一。本文对国内外亚细胞定位预测的研究现状进行了综述。
- 陶海波马圣曹佳佳姚玉华王俊茹代琦
- 关键词：特征信息提取
- 生物信息学课程教学模式探索
- 2014年
- 生物信息学是现代生物制药技术人员需掌握的新兴技术,该技术能科学有效地去管理、处理与分析海量的序列数据与实验数据,并不断挖掘出各种可能的生物学关系,在医药开发过程中起着重要的作用。因此,生物信息学课程对处于后基因组时代的现代生物制药技术人才培养显得越来越重要。由于该门技术涉及诸多学科的交叉内容,迫切需要进行该门课程的教学模式探索,故对该课程的最佳教学模式进行了探索。
- 聂作明盛清吕正兵姚玉华王丹张文平
- 关键词：生物信息学教学模式
- 生物信息分析的数学方法及应用
- 代琦南旭莹姚玉华廖波聂作明贺平安
- 用数学方法对生物序列进行分析研究是数学和生物学的一个交叉领域，是最近十几年的新兴课题，有些模型甚至是刚刚提出，所以这方面的研究还很不成熟。总的来说，现有模型大致存在如下几个缺陷和问题：算法复杂度高；图形表示的退化性；信息...
- 关键词：
- 关键词：蛋白质序列
- 生物序列比较的几种数学方法及其应用被引量：1
- 2013年
- 在生物信息学中,传统的序列比对算法在理论基础和计算上都具有局限性,因此近二十年人们提出和发展了很多序列比较的数学方法.本文综述了较有代表性的几种:图形表示及其矩阵不变量方法;研究生物大分子二级结构的拓扑图论方法;基于字出现频率的统计学方法;Kolmogorov及Lempel-Ziv复杂度方法.
- 李玲南旭莹姚玉华
- 关键词：DNARNA二级结构
- 基于氨基酸约化和统计特征的蛋白质亚细胞定位预测被引量：2
- 2015年
- 蛋白质亚细胞定位预测对蛋白质的功能、相互作用及调控机制的研究具有重要意义。本文基于物化性质和结构性质对氨基酸的约化,描述序列局部和全局信息的"组成"、"转换"和"分布"特征,并利用氨基酸亲疏水性的数值统计特征,提出了一种新的蛋白质特征表示方法(NSBH)。分别使用三种分类器KNN、SVM及BP神经网络进行蛋白质亚细胞定位预测,比较了几种方法和特征融合方法的预测结果,显示融合特征表示及结合SVM分类器时能够达到更好的预测准确率。同时,还详细讨论了不同参数对实验结果的影响,具体的实验及比较结果显示了该方法的有效性。
- 杨红徐慧敏严寿江陈静耿丽丽姚玉华
- 关键词：蛋白质亚细胞定位支持向量机
- 家蚕30K蛋白新成员Slp的基因克隆及表达特征与亚细胞定位被引量：1
- 2013年
- 家蚕30K蛋白是家蚕生长发育的主要能源物质,具有多种生物学功能。根据已知的30K蛋白的氨基酸序列,利用NCBI在线BLAST程序在家蚕蛋白质数据库中进行氨基酸序列相似性比对分析,发现一条新的氨基酸序列,命名为Slp蛋白(GenBank登录号:NM_001126256)。该蛋白质与已知的5种家蚕30K蛋白的氨基酸序列相似度达41%以上,且具有共同的保守结构域Lipoprotein_11,三级结构也极其相似,推测Slp蛋白可能是家蚕30K蛋白家族新成员。利用NCBI在线工具查找获得了编码Slp的基因序列,然后利用RT-PCR技术从家蚕5龄幼虫脂肪体中克隆得到Slp的cDNA序列,并在大肠杆菌中诱导表达。利用获得的纯化Slp蛋白免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体,对该蛋白质进行亚细胞定位的结果显示其主要存在于BmN细胞的细胞膜上和细胞质中。Western blotting检测Slp蛋白在家蚕不同发育时期均有表达,以5龄幼虫期的表达量最高,蛹期次之,蛾期和卵期最低;在5龄幼虫不同组织均有表达,以血淋巴和脂肪体中的表达量最高,在其它组织中的表达量较低。依据Slp蛋白的序列结构与表达特征,推测其与已知的家蚕30K蛋白具有相似的多种生物学功能。
- 李擎于威姚玉华全滟平聂作明张耀洲
- 关键词：家蚕基因克隆原核表达亚细胞定位
- RNA二级结构预测及其数学描述
- 2008年
- RNA功能的实现需要借助于一定的二级结构,对RNA二级结构的研究是当今生物信息学一个非常重要的课题,该文概述了RNA二级结构的组合计数问题和研究RNA二级结构的拓扑图论方法,并对RNA二级结构的预测及其进展做了比较系统的综述.
- 李玲姚玉华南旭莹
- 关键词：RNA二级结构树图组合计数
- 生物计算中数据描述与模型构建理论方法研究
- 代琦姚玉华贺平安聂作明
- 面对海量的生物数据，如何对其进行科学的分析、处理和保存是当今生物科学发展中一个重要的问题。在生物数据处理中数学方法、计算机技术为海量数据的处理和复杂的计算问题提供了有效的解决手段，从而成为信息科学领域中的研究重点。数学描...
- 关键词：
- 关键词：信息科学蛋白质结构生物序列分析
- 一种高危肿瘤测试盒
- 本实用新型公开了一种高危肿瘤测试盒，包括壳体、安装在壳体内的输入选择插座和单片机。壳体前端开口，后端设置有信号输出接口，信号输出接口和单片机相连。输入选择插座呈六棱柱结构，六个侧面分别设置有USB A型接口、micro‑...
- 代琦武嘉琦陶津周涛姚玉华
- 文献传递
- 蛋白质亚细胞定位预测研究进展
- 2014年
- 蛋白质的功能与其亚细胞位置有着密切的联系,对于确定一个未知特性蛋白质的功能,亚细胞定位研究能够提供重要的参考信息。采用传统实验的方法研究亚细胞定位需要耗费大量的人力、财力、物力,已经不能满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长的现实需要。从已积累的知识和数据出发,利用智能算法、机器学习等工具开发蛋白质亚细胞定位预测的方法成为了当前的重要研究内容。本文对国内外亚细胞定位预测的研究现状进行了综述。
- 郑珊珊石卓兴代琦姚玉华
- 关键词：亚细胞定位特征信息提取
