代永东
- 作品数：10 被引量：47H指数：5
- 供职机构：云南大学更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金国家火炬计划云南省科技厅科研基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生化学工程更多>>
- 1株重寄生真菌粉棒束孢鉴定及系统发育分析被引量：9
- 2013年
- 报道寄生于蛹虫草子座尖端的1种真菌(No.YHIFXS-I001),通过形态和ITS测序鉴定其为粉棒束孢。研究发现,该粉棒束孢菌株具有长锥形,基部膨大、尖端变细的两型分生孢子梗,长链以及单孢两型分生孢子连结方式,拓宽了对粉棒束孢寄生式样和显微特征的认识。另外,对该菌株开展ITS测序分析,通过与GenBank中粉棒束孢ITS序列的整理和比较,确定NCBI数据库中粉棒束孢9条ITS序列为错误鉴定,同时解析了粉棒束孢种内ITS序列较低的遗传丰富度(单倍型多样性Hd为0.590,核苷酸多样性P i为0.00378)。利用ITS对粉棒束孢及其近缘物种分子系统学分析,发现粉棒束孢与其它棒束孢物种形成多系关系,这一结果揭示了棒束孢属3系分支的系统分类格局,暗示粉棒束孢与其他棒束物种进化差异,对其系统学研究将有启示作用。
- 代永东虞泓杨坤
- 关键词：重寄生蛹虫草分子鉴定ITS序列
- 白马蝠蛾与云南蝠蛾微生物群落多样性与功能预测比较分析
- 2021年
- 【目的】研究并比较冬虫夏草Ophiocordyceps sinensis (Berk.) Sung et al.寄主白马蝠蛾Hepialus baimaensis Liang和云南蝠蛾Hepialus yunnanensis Yang, Li et Shen体内微生物群落组成及其功能差异,初步分析蝠蛾体内微生物群落对冬虫夏草菌侵染蝠蛾的影响。【方法】对白马蝠蛾(Hb)和云南蝠蛾(Hy)4-5龄期幼虫内微生物进行Ion S5TMXL高通量测序,并利用生物信息学软件对细菌和真菌群落分别进行群落组成、LefSe(LDA Effect Size)、功能预测分析和比较分析。【结果】Hb组细菌共鉴定17门145属;Hy组细菌共鉴定23门202属。Hb组细菌中肉杆菌属Carnobacterium相对丰度占比最高,为95.55%;Hy组细菌中沃尔巴克氏体Wolbachia占主要比例(85.28%)。Hb组真菌共鉴定4门114属;Hy组真菌共鉴定5门113属。Hb组真菌中假裸囊菌属Pseudogymnoascus为最优势属(46.23%),Hy组真菌中菌刺孢属Mycocentrospora为最优势属(37.87%)。LefSe分析Hb组中有5个细菌分类单元和12个真菌分类单元与Hy组具有显著差异,而Hy组中有7个细菌分类单元和9个真菌分类单元与Hb组具有显著差异。两组样本细菌群落进行COG功能预测,Hb组更偏向氨基酸转运与代谢功能,而Hy组更偏向翻译、线粒体的结构与发生功能。两组样本细菌群落进行KEGG功能预测,Hb组中DNA解旋酶、ATP结合区和ABC转运蛋白丰度较高,Hy组中辅酶Q还原酶、推定转座酶和核糖体丰度较高。真菌群落FUNGuild分析,Hb组中46.26%的真菌属于动物病原菌-土壤腐生真菌类别;而Hy组占比最高真菌类别为植物病原菌(38.31%)。两组真菌样本进行KEGG和MetaCyc pathway功能预测,两组样本中真菌功能丰度较高的类别均与基础代谢或生理功能相关。【结论】白马蝠蛾和云南蝠蛾4-5龄期幼虫体内细菌和真菌组成及其功能存在一定差异,而与其它寄主蝠蛾相比,白马蝠蛾4-5龄期幼虫内细菌和真菌组成存在相同的类群。本研究发现,白马蝠�
- 孙涛汤德相代永东代永东张灿明虞泓
- 关键词：冬虫夏草微生物群落高通量测序
- 三七中高产人参皂苷Rd真菌的鉴定被引量：4
- 2012年
- 从云南文山三七根茎上分离得到具有转化人参皂苷活性的真菌。采用的方法是:利用平板划线分离法,从三七根茎中分离纯化得到2株真菌,用该菌株对三七进行液态发酵。通过HPLC检测,对发酵前后皂苷变化进行分析,对两株真菌进行形态显微鉴定及ITS序列分析。结果表明,菌株形态及显微特征和产孢结构与木霉属一致,利用ITS序列与相关类群构建聚类树,确定实验2菌株ITS总长度为550bp,与长枝木霉Trichodermalongibrachiatum Rifai株菌(ATCC18648T、ATCC208859、DAOM167674、DAOM231259)仅在全ITS第134位点上发生间或缺失突变,鉴定2株真菌均为长枝木霉T.longibrachiatum。HPLC分析显示,菌株能够将三七中量多的大极性皂苷转化为小极性皂苷,并高产人参皂苷Rd。结论由此可以证明长枝木霉具有转化三七中皂苷的活性。
- 王艳代永东葛锋虞泓赵方允
- 关键词：生物转化ITS人参皂苷RD
- 蝉棒束孢显微形态变异式样被引量：6
- 2017年
- 【目的】揭示蝉棒束孢居群形态性状的变异式样。【方法】通过对15个居群,75个蝉棒束孢菌株17个显微形态性状的观察和测量,采用SAS 8.1软件对蝉棒束孢显微形态性状数据进行描述性、巢式方差和Q聚类分析,获得蝉棒束孢显微形态变异数据。【结果】蝉棒束孢具有大小两型分生孢子,产孢细胞的形态可分为葫芦状和瓶状2种类型;蝉棒束孢在PDA培养基中易形成数量众多的厚垣孢子,菌丝间多能形成融合菌丝,并可观察到少量的融合菌丝在厚垣孢子与菌丝间、产孢细胞间形成。描述性分析表明,蝉棒束孢居群17个形态性状的变异系数(CV)在13.07%–104.09%之间,在物种水平上表现出丰富的变异;巢式方差分析表明,蝉棒束孢显微形态性状在居群间平均方差分量占总变异的11.29%,居群内个体间平均方差分量占总变异的15.27%,菌株内观察值间平均方差分量占总变异的73.44%。【结论】蝉棒束孢菌株形态性状变异丰富,是形态性状变异的主要来源,蝉棒束孢居群显微形态性状不存在明显的地理相关性。
- 曾文波常衬心李建平王元兵代永东虞泓
- 关键词：蝉花居群菌丝体
- 青藏高原东南部冬虫夏草及其近缘种分类与谱系地理研究
- 物种演化和区系分异与物种进化机制、古地理及生态气候环境等综合因素密切相关。青藏高原及其周边地区地质变迁历史复杂,尤其在第三纪和第四纪,地质和气候发生巨大变化,这些变化必定对该区线虫草属Ophiocordyceps(Asc...
- 代永东
- 关键词：青藏高原冬虫夏草分子系统学分子钟
- 文献传递
- 云南虫生真菌粉棒束孢遗传分化研究被引量：10
- 2015年
- 对云南粉棒束孢8个当地居群和蝙蝠蛾拟青霉2个当地居群进行ITS测序和RAPD扩增分析,结合Gen Bank中相关序列,对粉棒束孢开展遗传多样性、居群遗传结构及其种内分化研究。共获得大范围内地理距离远的6个居群共97条粉棒束孢ITS序列,共有33种单倍型,单倍型多样性Hd=0.546和总核苷酸多样性Pi=0.00276,显示粉棒束孢在物种水平上遗传多样性较低。云南粉棒束孢共37条序列,有14种单倍型(10种为云南特有),具有较高单倍型多样性和核苷酸多样性(Hd=0.659,Pi=0.00274);单倍型聚类和网状分支分析表明云南粉棒束孢单倍型类型丰富,遗传多样性高,暗示云南为粉棒束孢多样性分布中心之一。ITS序列分析表明,云南当地居群间遗传分化系数Fst=51.95%;RAPD分析表明,居群间遗传分化系数Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;说明云南当地居群粉棒束孢分化剧烈。居群遗传距离与地理距离相关性研究表明,粉棒束孢居群遗传距离与地理距离无明显相关。中性检验和失配分析表明粉棒束孢经历过近期居群扩张。结合单倍型聚类和网状分支分析,表明Hap 19为扩张建群单倍型,但原始祖先单倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最优势单倍型(频率为48.45%),表明粉棒束孢并不存在明显的因地理原因造成的生殖隔离。值得重视的是,通过ITS单倍型和RAPD分析,支持将蝙蝠蛾拟青霉作为粉棒束孢异名处理。
- 代永东虞泓陈自宏杨俊媛
- 关键词：ITS序列分析单倍型
- 蝉棒束孢居群分布及生境调查被引量：6
- 2015年
- 蝉棒束孢(Isaria cicadae)为世界性广布种,在我国秦岭-淮河以南18个省区均有分布,分布海拔10 m^2 800 m,生长期6月~10月,适宜温度18℃~30℃。蝉棒束孢在上海、浙江、福建、安徽、江苏、广东和江西等地多分布于竹林,在云南、四川、贵州、陕西、海南和广西等地则多生长于阔叶林和针阔叶混交林。通过对云南3个蝉棒束孢生境样地的调查发现,昆明野鸭湖样地YY1是元江栲(Castanopsis orthacantha)为标志的常绿阔叶林,昆明野鸭湖样地YY2是以云南松(C.orthacantha)和元江栲(Pinus yunnanensis)为标志的常绿阔叶林与云南松混交林,兰坪菊香村样地JX1是以头状四照花(Dendrobenthamia capitata)为标志的常绿阔叶林。蝉棒束孢的生境中有多种虫生真菌伴生,包括蛹虫草(Cordyceps militaris)、下垂虫草(Ophiocordyceps nutans)、细脚棒束孢(Isaria tennuipes)和粉棒束孢(I.farinosa)。
- 曾文波王元兵虞泓代永东陈自宏
- 关键词：生境调查
- 多基因联合分析棒束孢属Isaria(Ascomycota,Cordycipitaceae)系统发育关系被引量：17
- 2016年
- 对棒束孢属Isaria及近缘属物种开展5基因(nr SSU、nr LSU、tef-1α、rpb1和rpb2)测序并联合分析,结合Gen Bank相关类群序列,探讨棒束孢属系统发育关系,最终获得95个菌株、58个明确分类群的2–5基因序列。利用MEGA和Mr Bayes软件进行多基因聚类分析,结果表明棒束孢属多系起源于虫草菌科中,分3个不同分支。A支主要由Isaria cicadae、I.teniupes、I.coleopterorum、I.fumosorosea和I.cateniannulata等组成;B支包括I.poprawkii、I.locustica、I.javanica、I.amoenerosea和I.cateniobliqua;C支仅有I.farinosa。分支间被Cordyceps militaris、C.ninchukispora、C.pruinosa等隔开。棒束孢在形态上,主要以瓶梗基部膨大、尖端变细及孢子呈链状等特征与其他类群分开,但同时也发现有棒状分生孢子梗和单孢子类型。基于节点的分歧时间预测分析,推测棒束孢属首次分化于70Mya,但棒束孢属主要物种形成却在60–55Mya,且3个分支的棒束孢物种为快速同时形成,而后大多数类群表现遗传稳定。同时发现,与Isaria Clade A较近一支有粉被玛利亚霉Mariannaea pruinosa(C.pruinosa无性型)和蛹草蚧霉Lecanicillium militaris(C.militaris无性型);与粉棒束孢距离最近一支有Akanthomyces aculeatus(C.tuberculata无性型)和L.attenuatum(C.confragosa无性型),是两个不同的属征分类群,且相互间遗传距离较近。根据棒束孢属及其近缘种属形态特征的复杂性推测,棒束孢属在快速物种形成中,其近缘类群存在一定程度的丢失和选择性演化。
- 代永东虞泓曾文波杨俊媛何璐
- 关键词：多基因分歧时间系统发育
- 兰坪虫草生态学特性研究被引量：1
- 2016年
- 兰坪虫草是新近发现的冬虫夏草近缘种，具有较高药用价值，其野生资源逐年减少，有必要加强保护研究。本研究从兰坪虫草生境中的海拔、坡向、土壤、温湿度、植被、寄主食物等方面调查了兰坪虫草的生态学特性，结果表明：兰坪虫草主要分布于横断山区海拔2600~3400m的高山草丛，通常呈片状分布；生境中土壤主要为棕壤或黑褐土，土质较疏松、微酸性，含水量适中；寄主云南蝠蛾的食物多样，主要以草本植物如艾蒿、西南鸢尾、血满草、龙牙草、大理蓟等的幼嫩根茎为食，偶以枯枝落叶层的腐殖质为食；生境中分布的昆虫及病原菌是调节兰坪虫草寄主蝠蛾生态平衡的重要生物因子。本研究结果将为兰坪虫草的仿生态栽培及其资源保护提供参考。
- 陈自宏虞泓何謦成代永东王元兵曾文波
- 关键词：海拔植被温度
- 虫草HSP70基因测序技术分析
- 2014年
- 基于冬虫夏草全基因组测序,对其HSP70基因测序技术进行分析,以5种虫草样本为试材,比较冬虫夏草HSP70基因整序列PCR测序技术与近缘种HSP70基因分段PCR测序技术两种方法适用性。结果表明,前者进程较短,效率较高,但仅适用于冬虫夏草材料;而后者通用性较好,适用于虫草多物种的分析,但工作量较大。HSP70基因在冬虫夏草种内分化小于种间的分化,冬虫夏草种及其近缘种HSP70基因序列分析结果与Sung的虫草分类系统分类相吻合。
- 陈贤代永东虞泓袁峰杨德
- 关键词：热激蛋白HSP70基因PCR扩增
