陈开
- 作品数：20 被引量：54H指数：4
- 供职机构：同济大学理学院化学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学环境科学与工程医药卫生更多>>
- 基于知识编码的剪切位点预测被引量：3
- 2007年
- 在现有生物统计中,对脱氧核糖核酸中碱基的编码表达主要限于腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶和胸腺嘧啶4种.但这种编码方式的变量太少,同时没有考虑碱基在脱氧核糖核酸中的位置信息,在剪切位点预测中,准确率不会超过90%.据此采用基于知识的编码方式,即真剪切位点与假剪切位点的统计差表,结合支持向量机方法,大大提高了剪切位点识别的准确率,并进一步采用碱基的统计特征的多变量编码方式使真给体位点和假给体位点的预报率分别达到96.4%和93.0%,真受体位点和假受体位点的预报率分别达到94.4%和93.0%.
- 黄金艳李通化陈开
- 关键词：基因识别支持向量机编码方法
- 化学化工本科生“轮流蹲组”创新型培养模式被引量：2
- 2008年
- 我校建立了本科生"轮流蹲组"创新型人才培养模式,提出了"学士前教育"的理念,本文介绍了此模式的内涵和特色,探讨了其在培养化学、化工专业(乃至理工科各个专业)本科生的人生观、价值观、拓宽知识面、提高综合素质和实验技能等方面所取得的效果。
- 吴庆生王晓岗姚天明陈伟陈开母朝静
- 关键词：本科生
- 多重序列比对对蛋白质二级结构预测的改进
- 本文论述一定氨基酸序列排列的多肽链是如何形成有一定空间结构的蛋白质分子的问题仍是分子生物学中心法则中到目前为止还悬而未决的问题.所以预测蛋白质的三级结构是分子生物学迫切需要解决的问题之一.一般认为蛋白质的结构是由其氨基酸...
- 胡俊彦李通化陈开黄涛
- 关键词：蛋白质
- 基于峭度的重叠峰解析新方法被引量：12
- 2004年
- 峭度是表征曲线陡峭程度的物理量。本实验提出了基于峭度的组分分析 (componentanalysisbasedonkurtosis,CABK)方法来解析重叠峰 ,从中分离出纯组分信息。这种新方法的优点在于半盲源分离 ,即只要判断出重叠峰所含组分的数目 ,就可从混合谱中分离出各组分的纯谱信息。将它用来解析模拟两组分重叠峰体系和酒样的GC MS混合谱 。
- 高洪涛李通化陈开毕贤林淑芳
- 关键词：峭度
- Tribe-PSO Dock在禽流感药物研究中的应用
- 分子对接是实现合理药物设计的重要方法之一.利用Chemscore作为能量函数,以及将一种新的优化算法一部落粒子群算法作为搜索算法,得到一种新的对接程序:Tribe-PSO Dock;利用Tribe-PSO Dock考察两...
- 茅冬华李通化陈开
- 关键词：分子对接神经氨酸酶
- Kernel PLS用于多氯联苯气相色谱保留行为的预测
- 多氯联苯是对人类健康和自然环境特别有害的持久性有机污染物之一,根据氯原子取代数目及位置的不同,由209个同系物所组成。对多氯联苯的检测和分析一直是环境分析的研究热点, 其中,对多氯联苯所有同系物在不同色谱条件下保留行为的...
- 陈开李通化唐凯临
- 关键词：多氯联苯气相色谱
- 核方法在SELDI-TOF蛋白质组学数据分类中的应用(英文)被引量：1
- 2007年
- 高解析质谱目前应用于疾病分类和治疗,然而海量数据的分析却遇到相当大的挑战。本文使用结合预处理的Kernel-PLS方法,可用于SELDI-TOF蛋白质组学数据分类。留一法交叉验证得到了敏感性0．9833和特异性1．0000的结果。
- 唐凯临李通化陈开黄金艳
- 辣根过氧化物酶反应的化学动力学分析被引量：11
- 2002年
- 用辣根过氧化物酶来处理废水中的苯酚和氯酚为许多人所关注。采用停流快速混合技术 ,利用快速扫描紫外可见分光光度计得到辣根过氧化物酶催化过氧化氢氧化苯酚聚合过程的瞬态光谱数据。对此测量数据矩阵用正交投影及遗传算法解析后 ,确定体系中产生紫外吸收的物种数 ,及辣根过氧化物酶中间体形式的纯光谱信息 。
- 陈海明李通化陈开
- 关键词：酶反应化学动力学辣根过氧化物酶化学计量学正交投影酚类污染物
- tPSODock:基于化学得分函数和两层粒子群算法的计算机分子对接程序被引量：3
- 2005年
- 药物分子对接是计算机辅助药物设计的主要方法之一。利用化学得分函数(Chemscore)作为能量函数,以及将一种新的优化算法一两层粒子群算法作为搜索算法,得到了一种新的计算机分子对接程序:tPSODock。利用tPSODock计算了100个蛋白质-配体的复合物,并且与Consdock和Autodock 3.0计算结果进行了对比,结果显示88%的计算结果RMSD小于2.0A, 优于Consdock以及Autodock的计算结果。说明tPSODock在是一种高效的分子对接软件,可以用于大规模数据库的筛选工作,适合新药的开发和研制。
- 曹同成陈开李通化
- 关键词：分子对接粒子群算法
- 分子对接方法应用于双头Bowman-Birk绿豆胰蛋白酶抑制剂
- 计算机模拟生物分子的相互作用与识别,己经受到了相当大的关注,尤其分子对接方法目前已经成为研究分子间相互关系的重要方法.一直以来,Bowman-Birk类绿豆胰蛋白酶抑制剂以其独特的双头结构和生物性能都是人们的关注的重点,...
- 刘东亮李通化陈开
- 关键词：分子对接AUTODOCK
