郭琪
- 作品数：41 被引量：53H指数：4
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- 相关领域：农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 基于重测序鉴定SbHKT基因在陆地棉基因组中的插入位点被引量：1
- 2021年
- 【目的】明确SbHKT基因棉花HKT-1株系的插入位点序列特征。【方法】对HKT-1株系重测序,本地BlastN比对获得插入位点处的侧翼序列,设计聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)特异引物验证插入位点的准确性。【结果】获得SbHKT基因插入位点处107 bp的左边界(Left border,LB)端侧翼序列HKT1_LSEQ,122 bp的右边界(Right border,RB)端侧翼序列HKT1_RSEQ;锚定基因组后显示SbHKT基因的插入引发了陆地棉染色体结构变异。分别根据LB和RB端侧翼序列设计PCR特异引物扩增HKT-1株系T-DNA全长,目的条带含有完整的T-DNA骨架序列以及SbHKT基因序列,证实HKT1_LSEQ和HKT1_RSEQ是同一个插入位点的左右侧翼序列。【结论】基于重测序技术获得了SbHKT基因在陆地棉基因组中的侧翼序列,建立了SbHKT基因转化体特异性检测方法。
- 徐鹏郭琪徐珍珍孟珊陈天子沈新莲
- 关键词：陆地棉插入位点侧翼序列
- 与棉花纤维强度和马克隆值相关的SSR分子标记及应用
- 本发明公开了与棉花纤维强度和马克隆值相关的SSR分子标记及应用。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段，为位于异常棉11号染色体上至少含有自SSR分子标记NAU2152起至SSR分子标记JAAS4769止的片段；所述S...
- 孟珊沈新莲徐珍珍郭琪徐鹏张香桂
- 文献传递
- 江苏省现有生产条件下棉花良种繁育技术探讨
- 2015年
- 随着棉花生产管理体制的改变,棉花良种繁育工作出现了新品种选育速度快,生产用种更换频繁,育种者直接参与棉花良种生产等特点。费工费时的"三圃制"专业化棉花种子生产体系已不适应当前生产的需要。基于上述条件,本研究提出,用育种者的种子直接种植,选典型单株混收生产原种;原种去杂去劣生产良种直接用于生产的良种生产程序,简便高效。
- 张香桂沈新莲倪万潮徐鹏郭琪徐珍珍
- 关键词：棉花原种良种
- 陆地棉-异常棉异附加系抗旱耐盐性评价及关键生理生化指标测定被引量：1
- 2022年
- 【目的】筛选具有抗旱或耐盐潜力的陆地棉-异常棉异附加系,并明确体现其抗旱耐盐性的关键生理生化指标,旨在为棉花抗旱耐盐育种提供理论与材料基础。【方法】利用异常棉每条染色体特异的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记鉴定陆地棉-异常棉异附加系的基因型;通过表型观察和相关指标测定,筛选出具有抗旱或耐盐潜力的异附加系,并测定其生理生化指标,包括过氧化氢(H_(2)O_(2))、丙二醛(malondialdehyde,MDA)、脯氨酸(proline,PRO)的含量、SPAD(soil and plant analyzer development)值及过氧化物酶(peroxidase,POD)、过氧化氢酶(catalase,CAT)和超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)的活性。【结果】陆地棉-异常棉异附加系的传递率为34.66%~51.50%;MAAL_1B、MAAL_5B、MAAL_7B、MAAL_8B、MAAL_11B和MAAL_12B具有抗旱潜力,MAAL_4B、MAAL_6B、MAAL_8B、MAAL_9B和MAAL_10B具有耐盐潜力。干旱或盐胁迫下轮回亲本陆地棉苏棉8289和具有抗旱或耐盐潜力的异附加系叶片中的MDA、H_(2)O_(2)和PRO的含量与干旱前或清水对照相比均有不同程度地增加,且轮回亲本的MDA和H_(2)O_(2)含量更高。干旱处理后10 d,与轮回亲本相比,MAAL_1B中CAT和SOD的活性、MAAL_5B中CAT和SOD的活性及PRO含量、MAAL_7B中SOD的活性、MAAL_8B中POD、CAT和SOD的活性及SPAD值、MAAL_11B中POD和CAT的活性以及MAAL_12B中CAT活性及SPAD值显著或极显著提高;350 mmol·L^(-1) NaCl处理后3 d,与轮回亲本相比,MAAL_6B中POD和SOD的活性及SPAD值、MAAL_8B中CAT活性、MAAL_9B中POD和SOD的活性以及MAAL_10B中SOD活性和SPAD值均显著或极显著提高。【结论】部分陆地棉-异常棉异附加系具有抗旱或耐盐潜力,且可能通过不同的生理生化过程应答干旱或高盐胁迫。
- 上官艺馨曹静季为陈祥龙徐鹏郭琪沈新莲徐珍珍
- 关键词：陆地棉异常棉异附加系耐盐性生理生化指标
- 陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发被引量：6
- 2016年
- 随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析。获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及In Del等分子标记;随机选择了部分SSR及In Del引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性。本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性。
- 徐鹏蔡继鸿杨阳郭琪张香桂徐珍珍沈新莲
- 关键词：陆地棉耐盐EST-SSR标记
- 一个陆地棉水通道蛋白基因的生物信息学分析(英文)
- 2014年
- [目的]对陆地棉水通道蛋白基因GhNIP5.1进行生物信息学分析,为深入研究陆地棉水通道蛋白的功能提供研究基础。[方法]利用电子克隆的方法,获得棉花GhNIP5.1基因的开放阅读框序列,并对该序列进行了生物信息学分析;利用已公布的棉花基因组测序结果,搜索获得GhNIP5.1基因的编码区序列。[结果]序列分析表明,所获得cDNA序列具有完整的897 bp的开放阅读框,编码298个氨基酸残基;该氨基酸序列具有MIP超家族典型的NPA保守序列;它同葡萄和拟南芥的NIP5.1氨基酸序列的一致性最高,分别为89.3%和83.2%,在拟南芥NIP家族9个成员中,GhNIP5.1蛋白的氨基酸序列同AtNIP5.1同源性最高;该蛋白的三维结构也同拟南芥AtNIP5.1的非常相似;GhNIP5.1基因的编码区全长2 067 bp,包含4个外显子和3个内含子,所有内含子的左右边界均为GT-AG结构。[结论]GhNIP5.1基因可能具有同拟南芥AtNIP5.1类似的生理功能。
- 倪万潮巩元勇郭书巧束红梅沈新莲徐鹏张香桂郭琪
- 关键词：陆地棉水通道蛋白生物信息学
- 棉花育种家种子的生产和保存研究
- 2015年
- 根据在现有生产条件下,棉花良种生产和使用现状,指出加强棉花基础种子生产的技术关键是加强定向选择和及时去杂去劣;高度纯合的育种家种子可一次足量繁殖,进行室内长期贮存,再逐年分次利用,以使新品种能在生产上充分发挥其增产增收作用。
- 张香桂沈新莲倪万潮徐鹏郭琪徐珍珍
- 关键词：育种家种子
- 盐胁迫下旱地棉叶片数字化基因表达谱分析
- 2016年
- 为了深入研究棉花耐盐的分子机理,利用数字化基因表达谱技术,分析了盐胁迫处理3 h和72 h时旱地棉叶片中基因表达差异,分别获得1 778(1 046个上调、732个下调)和2 873(2 065个上调、808个下调)个差异表达基因。功能注释分析结果表明,这些差异表达基因主要参与了信号转导、逆境应答、能量代谢和转录调节等方面。随机挑选10个差异表达基因进行qRT-PCR验证,结果表明,qRT-PCR结果与数字化基因表达谱分析结果基本一致。
- 翟彩娇徐鹏范昕琦郭琪张香桂徐珍珍沈新莲
- 关键词：旱地棉盐胁迫
- 棉花高衣分相关的SSR核酸序列及其应用
- 本发明公开了棉花高衣分相关的SSR核酸序列及其应用。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段，为位于异常棉5号染色体上自SSR分子标记JAAS6365起至SSR分子标记JAAS5604止的片段；所述SSR分子标记JAAS...
- 徐珍珍沈新莲徐鹏郭琪孟珊张香桂
- 棉花纤维长度近等基因系R01-40-08的背景遗传效应分析
- 2014年
- 从海岛棉Pima S-6中鉴定了一个1号染色体上稳定表达的纤维长度QTL(qFL-chr1),针对这一目标QTL,通过标记辅助选择得到近等基因系R01-40-08。近等性分析结果表明,该近等基因系其他7条染色体上仍含有Pima S-6的渐渗片段。以Tamcot 2111(轮回亲本)与R01-40-08(供体亲本)构建了1个含有1 672个单株的F2群体,分析了其他染色体上Pima S-6渐渗片段对纤维长度的遗传效应,单标记分析结果表明,位于14号染色体上的2个标记(NAU2190和NAU5465)对纤维长度有显著的影响。
- 张霞高进郭琪徐鹏张香桂沈新莲
- 关键词：纤维长度渐渗系近等基因系
