王宏鹏
- 作品数：11 被引量：36H指数：4
- 供职机构：南开大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：环境科学与工程生物学农业科学医药卫生更多>>
- 大黄堡湿地自然保护区浮游动物研究与水环境评价被引量：9
- 2008年
- 对天津市武清区大黄堡湿地自然保护区的水域进行浮游动物种类区系组成、现存量(密度、生物量)及分布进行了调查研究.两次调查共采集到16种浮游动物,其中轮虫7种、枝角类5种、桡足类4种.结合相似水体研究结果比较并辅以生物多样性指数分析,对调查水域进行了水生态环境质量评价.结果表明,目前大黄堡湿地自然保护区的水质可初步划定为中-富营养型.同时提出了大黄堡湿地自然保护区环境管理和改善水质的措施建议.
- 王新华王宏鹏纪炳纯
- 关键词：浮游动物水质评价生物指数
- 西藏大花红景天EST-SSR开发及通用性分析
- 2021年
- 以西藏大花红景天为研究对象,用MISA软件筛选转录组测序获得的48 790条unigene,开发EST-SSR(表达序列标签-微卫星序列)并对其通用性进行分析,以期为红景天属物种的遗传多样性研究和分子标记辅助育种奠定基础。结果表明,共检测出10 761个SSR位点,分布于8 973条unigene中,分布频率为22.06%,平均分布距离为4.725 kb。优势重复基序以单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸为主,其中单核苷酸重复单元以基序A/T为主,共7 167个,二核苷酸重复单元以AG/CT为主,共1 008个。随机合成280对引物,其中248对表现出有效扩增,54对具有多态性。此外,SSR引物在长鞭红景天、狭叶红景天、菊叶红景天、圣地红景天、柴胡红景天、高山红景天中具有较高的通用性,扩增效率分别为75.0%、73.75%、72.5%、62.5%、70.0%、72.5%。
- 张力鹏滕彦娇王宏鹏李天宇宋文芹陈成彬
- 关键词：大花红景天转录组SSR
- 天津市团泊水库浮游动物研究与水环境评价
- 2006年对团泊水库进行浮游动物种类区系组成、现存量(密度、生物量)及分布的调查研究。结合相似水体研究结果比较并辅以生物多样性指数分析,对调查水域进行了水生态环境质量评价.结果表明,目前团泊水库和独流减河的水质均可初步划...
- 王新华王宏鹏纪炳纯
- 关键词：独流减河生物指数
- 文献传递
- 天津市团泊水库浮游动物研究与水环境评价被引量：16
- 2008年
- 2006年对团泊水库进行浮游动物种类区系组成、现存量(密度、生物量)及分布的调查研究。结合相似水体研究结果比较并辅以生物多样性指数分析,对调查水域进行了水生态环境质量评价。结果表明,目前团泊水库和独流减河的水质均可初步划定为富营养型。同时提出了关于团泊水库环境管理和改善水质的措施和建议。
- 王新华王宏鹏纪炳纯
- 关键词：独流减河生物指数
- 天津市团泊水库底栖动物研究与水环境评价被引量：4
- 2008年
- 2006年10月对天津市团泊水库进行底栖动物种类区系组成、现存量(密度、生物量)及分布进行了调查研究。结合相似水体研究结果比较并辅以生物指数分析,对调查水域进行了水生态环境质量评价。结果表明,目前该水体明显受到有机污染,水质可初步划定为富营养型。文中同时提出了对该水域环境管理和改善水质的措施和建议。
- 王新华纪炳纯王宏鹏
- 关键词：底栖动物水质评价生物指数
- 西藏大花红景天RcUDPGTs基因克隆与表达分析被引量：2
- 2021年
- 以西藏大花红景天为研究材料,利用生物信息学和实时荧光定量PCR技术对RcUDPGTs基因家族中18个成员的序列和表达模式进行分析,并构建RcUDPGT(JX228125.1)的诱饵载体以筛选拟南芥酵母文库中互作蛋白。结果表明,RcUDPGTs基因核苷酸序列长度为1400 bp左右,编码452~498个氨基酸。一级结构中N端序列保守性较低,C端的保守性较高,均含有尿苷二磷酸葡萄糖结合结构域(PSPG盒)。蛋白质三级结构均呈现一定相似性,具有UDP糖供体识别中心,且含有多个可磷酸化位点。qRT-PCR结果显示RcUDPGTs基因在根、茎、叶三个器官中均有表达,且其表达量能够受到低温/紫外和多种植物激素(脱落酸、生长素、茉莉酸甲酯)的调控,但表达模式差异较大。与阴性对照相比,RcUDPGT基因没有自激活活性和细胞毒性,并筛选到两个互作明显的拟南芥基因AtKCR1(AT1G67730.1)与AtSNL4(AT1G70060)。以上结果丰富了RcUDPGTs基因的研究成果,为了解大花红景天与高原环境的适应性机制,同时为深入研究根部次生代谢产物的合成和积累提供一定理论基础。
- 王宏鹏成璐路滕彦娇陈成彬张力鹏
- 关键词：大花红景天生物信息学
- 大花红景天内参基因筛选与POD基因表达分析被引量：3
- 2021年
- 目的:筛选适合研究大花红景天的内参基因,并进行过氧化物酶(POD)基因的表达分析验证。方法:扩增常见内参基因,利用Bestkeeper,geNorm和NormFinder分析软件对其稳定性进行评估;用合适的内参基因作为参考,研究POD基因在大花红景天中的表达模式。结果:软件分析得到CyP和GAPDH稳定性好。以GAPDH为内参,检测到POD基因在叶中大量表达,RcPOD42在茎中表达最低。低温胁迫后RcPOD21和RcPOD1上调表达,其他成员下调表达。脱落酸(ABA)胁迫下RcPOD和RcPOD1持续诱导表达,其余基因表达先下调再上调。结论:筛选得到适于研究大花红景天的内参基因GAPDH,可以将其应用于分析POD基因在大花红景天不同部位和不同环境中的表达。
- 滕彦娇王宏鹏王菁宋文芹陈成彬张力鹏
- 关键词：大花红景天内参基因GAPDH基因表达分析
- 天津市团泊水库底栖动物研究与水环境评价
- 2006年10月对天津市团泊水库进行底栖动物种类区系组成、现存量(密度、生物量)及分布进行了调查研究。结合相似水体研究结果比较并辅以生物指数分析,对调查水域进行了水生态环境质量评价.结果表明,目前该水体明显受到有机污染,...
- 王新华纪炳纯王宏鹏
- 关键词：底栖动物水质评价生物指数
- 文献传递
- 菊叶薯蓣DcPMK基因克隆及互作蛋白筛选
- 2022年
- 以菊叶薯蓣为研究材料,采用RT-PCR技术克隆获得DcPMK基因,进行生物信息学、组织特异性和诱导表达分析,并构建DcPMK的诱饵载体以筛选拟南芥酵母文库中互作蛋白,为深入研究菊叶薯蓣萜类物质的合成积累提供一定理论基础。结果表明:DcPMK基因开放阅读框大小为1536 bp(GenBank登录号MZ171241),编码511个氨基酸。蛋白质序列比对分析发现DcPMK与近源种基因序列一致性达88.85%,具有1个保守的ATP结合位点Gly-X-Gly-XX-Ala。N-J进化树显示DcPMK与海枣(Phoenix dactylifera)等单子叶植物的遗传距离较近。HPLC结果显示菊叶薯蓣皂素主要在根茎中积累,qRT-PCR结果表明DcPMK基因在各组织中均有表达,在老茎中表达量最高,根茎中表达量最低;水杨酸诱导后皂素含量的变化与DcPMK表达量的变化趋势吻合:随着叶片中皂素含量提高,DcPMK上调表达。与阴性对照相比,DcPMK基因没有自激活性和细胞毒性,并筛选到27个互作明显的拟南芥基因,如生长发育相关基因AtKCR1(AT1G67730)、AtRPS9M(AT3G49080)、AtASY4(AT2G33793),非生物与生物逆境相关基因AtVDAC2(AT5G67500)、AtVDAC3(AT5G15090)、AtRH8(AT4G00660)及花色素苷积累相关基因AtPHR2(AT2G47590)等。以上结果说明DcPMK能够参与菊叶薯蓣的萜类物质合成,并通过蛋白质-蛋白质相互作用的方式广泛参与其生长发育和胁迫响应等代谢途径。
- 王宏鹏李一丹汪耀谭晓宇陈成彬张力鹏
- 关键词：菊叶薯蓣PMK生物信息学
- 西藏大花红景天RcCATs与RcSODs基因克隆及功能分析被引量：1
- 2022年
- 为探究过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)基因家族成员在西藏大花红景天高原恶劣生境适应性中的作用,利用生物信息学和qRT-PCR技术对其RcCATs和RcSODs基因家族成员的序列和表达模式进行了分析,并构建RcCAT和RcSOD1的pYES2.0表达载体与pGBKT7诱饵载体,分别进行了酵母胁迫分析和拟南芥酵母文库中互作蛋白的筛选。结果显示:(1)大花红景天中共有2条RcCAT基因,3条RcSOD基因和1条Cu/Zn SOD铜伴侣基因RcCCS。生物信息学分析显示上述基因的氨基酸序列与其同源基因具有较高的相似性(66.37%~94.51%),且均没有跨膜结构域,亚细胞位置预测RcCATs位于过氧化物酶体,RcSODs和RcCCS位于细胞质或线粒体。(2)qRT-PCR结果显示6个基因在根、茎、叶三个器官中均有表达且主要在叶片中表达,低温胁迫和植物激素ABA对基因表达量的影响显著。(3)酵母胁迫结果显示异源表达RcCAT和RcSOD1基因的阳性酵母菌株在冷、热、盐、碱、重金属和H_(2)O_(2)胁迫下的细胞活力均比pYES2.0空载菌株高。(4)通过酵母双杂交共筛选到4个与RcCAT互作明显的基因AtbHLH121(AT3G19860)、AtCPCK2(AT2G23070)、AtGRP4(AT5G50750)和AtRAPTOR1B(AT3G08850),3个与RcSOD1互作明显的基因AtEMB(AT5G11890)、AtMBP2(AT1G52030)和AtRH8(AT4G00660)。综上结果表明,大花红景天能够通过RcCATs和RcSODs基因广泛参与调控其生长发育、胁迫响应等代谢途径来适应高原恶劣的环境。
- 王宏鹏李一丹滕彦娇陈成彬张力鹏
- 关键词：大花红景天过氧化氢酶超氧化物歧化酶生物信息学
