沈红斌
- 作品数：123 被引量：193H指数：7
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点实验室开放基金江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术文化科学医药卫生生物学更多>>
- 无线传感器网络及智能环境控制被引量：1
- 2006年
- 传感器网络是信息技术中的一个新的研究领域,具有十分广阔的应用前景,引起了学术界和工业界高度重视。在环境中布置的大量的传感器,利用数据挖掘和数据融合的工具,可以对人的动作进行识别,实现对境的智能控制。
- 柳小波杨杰陈宁江沈红斌张清风陈鑫
- 关键词：传感器网络数据融合智能环境
- 基于频繁模式和机器学习双推荐制的核定位信号预测方法
- 本发明涉及蛋白质生物学领域，具体涉及一种基于频繁模式和机器学习双推荐制的核定位信号预测算法。本发明公开了两种模型，分别为基于频繁模式的NLS预测算法构建的模型和基于机器学习的NLS预测算法构建的模型。其中，第一种模型主要...
- 沈红斌郭芸
- 基于有监督上采样学习的蛋白质‑核苷酸绑定位点预测方法
- 本发明提供一种基于有监督上采样学习的蛋白质‑核苷酸绑定位点预测方法，包括以下步骤：基于训练集合中的蛋白质序列信息，从进化信息和二级结构视角抽取每个氨基酸残基的特征向量，得到正负样本集，所有绑定核苷酸的氨基酸残基提取为正样...
- 於东军胡俊何雪李阳沈红斌杨静宇
- 文献传递
- 基于图神经网络表征的蛋白质与核酸结合位点预测方法
- 一种基于图神经网络表征的蛋白质与核酸结合位点预测方法，通过构建蛋白质与核酸相互作用数据集，经样本融合处理后提取其中蛋白质中每个残基的位置和特征信息及其结构上下文，并据此构建残基结构上下文的图表示，通过层次图神经网络对待预...
- 夏莹沈红斌潘小勇夏春秋
- 关于智能医疗研究与发展的思考被引量：14
- 2017年
- 我国拓展智能医疗技术有极大潜力。通过采用深度学习算法、医学成像和组学测序技术，以及开发智能芯片，可大大提高疾病诊治的精准水平。国内外有关智能医疗的研究，代表了科学技术发展中一个引人注目的方向。
- 涂仕奎杨杰连勇黄晓霖沈红斌张丽清徐雷
- 关键词：智能诊断手术机器人医学成像智能芯片
- 基于代价敏感LSTM网络的蛋白质域检测方法及系统
- 一种基于代价敏感LSTM网络的蛋白质域检测方法，采用双向LSTM网络作为蛋白质域检测的模型；提出一个代价敏感的损失函数，为正负样本的错分赋予不同的代价；同时提出一种更新损失函数中代价权重的方法，对于任意给定的初始值，能够...
- 沈红斌陈晓
- 文献传递
- 基于图卷积自编码器的冷冻电镜单颗粒图像聚类实现方法
- 一种基于图卷积自编码器的冷冻电镜单颗粒图像聚类实现方法，通过计算冷冻电镜单颗粒图片集的图片相似性矩阵，从而生成KNN网络；采用局部线性嵌入算法对每幅冷冻电镜单颗粒图像进行降维，将KNN网络和图片特征矩阵输入图卷积自编解码...
- 蔡嘉鸣沈红斌
- 基于经验图神经网络的蛋白质-配体亲和力预测方法
- 一种基于经验图神经网络的蛋白质‑配体亲和力预测方法，从目标蛋白质与小分子配体的复合物中提取出蛋白质所有残基的β碳原子以及配体中所有重原子在三维空间中的全局坐标，然后根据全局坐标以及配体的化学键信息计算得到蛋白质图、配体图...
- 夏春秋夏莹潘小勇沈红斌
- 基于深度学习冷冻电镜三维密度图的局部质量评估方法
- 一种基于深度学习的三维密度图局部质量评估方法，通过构建基于VisionTransformer为骨干网络的DeepQs深度学习模型，并以重采样得到的冷冻电镜三维密度图的局部密度图为输入，以对应的原子结构与相匹配的重采样后的...
- 冯明峰沈红斌
- 基于分类器集成的跨膜蛋白两亲螺旋区域位置预测被引量：4
- 2016年
- 为提高跨膜蛋白两亲螺旋区域(Amphipathic helices,AHs)预测的精度,基于蛋白质位置特异性得分矩阵、二级结构以及疏水矩,提出了一种新的衡量两亲性的螺旋周期性(Helix periodicity,HP)特征;利用Mem Brain预测器滤除跨膜区域片段并使用下采样的方法,降低了AHs的搜索空间;在此基础上训练基于支持向量机(Support vector machine,SVM)的集成分类器用于AHs预测。为了客观评价AHs的预测性能,首次构建了领域内较为完备可用的标准数据集。在此数据集上的实验结果表明所提方法优于其他AHs预测方法。
- 郜法启於东军沈红斌
- 关键词：跨膜蛋白分类器集成
