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李琳琳: 作品数：13 被引量：340H指数：6; 供职机构：深圳市疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：湖北省科技攻关计划国家高技术研究发展计划更多>>; 相关领域：医药卫生生物学更多>>

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中国柯萨奇病毒A组16型部分VP1区序列测定及系统进化分析被引量：19: 2005年; 利用1999～2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同源性均较高,相互间核苷酸同源性为94.5%～98.0%,氨基酸同源性为97.8%～100%.6株中国分离株与Cox.A16国际参考株相比,部分VP1区核苷酸同源性高于78.2%,氨基酸同源性高于为93.3%.基因系统进化分析表明,中国大陆分离的6株Cox.A16与中国台湾流行株Tainan-5079-98(AF177911),与4株日本分离株、瑞典株及美国株GA95-2095(AF081613)、PA94-5753(AF081628)的关系均较近,核苷酸同源性大于93.3%.了解我国Cox.A16流行株的遗传学背景和种系进化关系,对有效地预防和控制Cox.A16流行有重要意义.; 卫灿东李琳琳何雅晴徐星晔薛颖金奇; 关键词：柯萨奇病毒A组16型手足口病系统进化分析 VP1区中国分离株儿童

深圳市一起肠道病毒71型引发手足口病流行的基因型别分析被引量：2: 2008年; 目的对2004年深圳市一起肠道病毒71型（EV71）引发手足口病流行的基因型别分析。方法用EV71型特异性引物进行RT—PCR，并对EV71的VP1和VP4基因进行克隆，所得的序列与EV71型A、B、c基因型代表株的核苷酸序列用TreeView和PHYLIP软件（3．6b）进行系统进化分析。结果4株病毒与c基因型代表株比较接近，VP1区核苷酸同源性在87．8％～92．0％之间，VP4区核苷酸同源性在85．9％～87．4％之间；与A、B基因型代表株比较差异较大，VP1区核苷酸同源性为81．9％～84．2％，VP4区为80．6％～85．0％；4株病毒VP1核苷酸同源性为94．1％～99．8％，VP4同源性为100％，组成一个独立的小分支。结论对EV71的VPl和VP4区进行基因进化分析，可得出类似的结果，4株EV71深圳流行株可命名为C4亚型。; 何雅青杨洪李琳琳谭洁周丽毛丽莎阳帆刘建军吕星; 关键词：肠道病毒71型手足口病基因型分析

肠道病毒71型感染前后宿主细胞蛋白质组的二维液相色谱分离和比较被引量：6: 2005年; 以肠道病毒71型及其宿主细胞为研究主体,建立了一种二维液相色谱分离和分析比较病毒感染前后细胞蛋白表达谱的方法.该方法以高效液相色谱(HPLC)为技术平台,对细胞裂解物先后进行一维色谱聚焦分离和二维反相色谱分离.利用ProteoVue软件将二维色谱数据转换成模拟胶图,再利用DeltaVue软件对感染前后的宿主蛋白表达谱进行比较和分析,找出差异蛋白.二维液相色谱分离法能够根据蛋白的等电点和疏水性建立精确的细胞蛋白表达图谱,每0.2个pH为一个收集区段,在pH8.5～3.9的范围内可见蛋白条带约1 200条.该方法良好的重现性、自动化以及结果分析的简易化,使之在细胞表达谱差异显示中的应用潜力巨大,并且为研究病毒与宿主相互作用提供了新的方法和思路.; 朱俊萍孙立连卫灿东李琳琳金奇; 关键词：蛋白质组肠道病毒71型宿主细胞

深圳地区2001-2004年肠道病毒71型部分VP1区基因分析被引量：19: 2006年; 20 enteroviruses type 71(EV71)were isolated from 410 patients with hand-foot-and-mouth disease in Shenzhen from 2001 to 2004.All of the 20 enteroviruses had been tested by RT-PCR using EV71 VP1 gene specific primers,the positive isolation rate was 4.88%.The amplicons of 341bp segment were cloned into pGEM-T and sequenced.A phylogenetic tree was constructed for comparison of these sequences with those of EV71 genotypes A,B and C using TreeView and PHYLIP software(3.6b).The sequence analysis showed that 20 EV71 strains of Shenzhen shared 81.2%-85.3% nucleotide identity with genotypes A and B.The nucleotide identities among 20 strains were 92.0%-100%.They shared 92.0%-97.9% nucleotide identity with EV71 genotype C4,and can be denominated as EV71 subgenotype C4.This research shows that part of the VP1 gene(341bp) can be used for phylogenetic analysis and pathogen surveillance.; 何雅青杨洪李琳琳谭洁毛丽莎阳帆刘建军吕星周丽; 关键词：肠道病毒71型同源性系统进化分析

深圳地区肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16基因组特征及诊断试剂研究: 何雅青金奇杨洪李琳琳周世力张海龙杨帆肖性龙姚相杰谭洁阳帆周丽吕星; 本研究于1998-2007年连续十年对深圳地区手足口病的重要病原--肠道病毒71型（简称EV71）和柯萨奇病毒A16（简称CA16）进行监测，掌握深圳地区流行的EV71和CA16的遗传学背景和种系进化关系，病毒变异规律和...; 关键词：; 关键词：肠道病毒71型柯萨奇病毒A16 基因

肠道病毒71型SHZH03株VP1基因的进化分析被引量：4: 2005年; 构建了肠道病毒71型(EV71)中国(深圳)分离株SHZH03全基因组的8个相互重叠的克隆,对其全基因组7406bp的核苷酸进行序列测定,利用DNA-Star软件分析外壳蛋白基因VP1的遗传进化。结果表明,SHZH03和SHZH98与亚洲流行株中的台湾1998年流行株、日本1999年流行株的遗传距离较近,而与新加坡2000年和2001年流行株的遗传距离较远;SHZH03株与一些欧洲流行株有较大的差异。以上结果说明我国深圳地区流行的肠道病毒71型有可能来源于台湾1998年的EV71大规模流行时的毒株。; 周世力李琳琳田波; 关键词：肠道病毒71型 VP1基因基因分型

柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析被引量：62: 2005年; 对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。; 李琳琳何雅晴朱俊萍薛颖朱雅芳徐星晔金奇; 关键词：柯萨奇病毒A组16型手足口病同源性中国分离株

肠道病毒71型外壳蛋白VP1在大肠杆菌中的表达被引量：10: 2007年; 将扩增得到的肠道病毒71型外壳蛋白VP1基因克隆到测序载体pGEM-T,测序验证该序列为目的片段后,将目的基因克隆到原核表达载体pGEX-5x-1中,转化大肠杆菌BL21,IPTG诱导表达,产物经SDS-PAGE分析和Western blot验证。结果表明,在经IPTG诱导的BL21中检测到分子量与预期大小相符的大约60 kDa的融合蛋白。利用表达产物作为抗原,对EV71感染病人阳性血清的检测初步证实,重组蛋白VP1可以作为检测EV71感染的检测用抗原。; 周世力李琳琳何雅青; 关键词：肠道病毒71型 VP1

深圳地区肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16基因特征研究: 何雅青李琳琳金奇杨洪杨帆潭洁周丽刘建军吕星; 该研究对717例手足口病等肠道病毒疑似病例粪便标本进行RT-PCR检测，其中CA16阳性115份，阳性率为16.04%，EV71阳性25份，阳性率为3.49%，说明深圳地区手足口病的病原主要为CA16。CA16在每年的1...; 关键词：; 关键词：肠道病毒71型系统进化

深圳市肠道病毒71型血清流行病学初步调查被引量：190: 2007年; 目的探讨深圳市不同人群肠道病毒71型血清流行病学规律。方法收集1999-2003年深圳地区正常人血清584份,按年龄0～岁、1～岁、2～岁、5～岁、15～岁和>30岁分成6个组,用ELISA方法对其肠道病毒71型抗体进行检测。结果1999-2003年深圳地区正常人血清中肠道病毒71型抗体阳性率最高的年龄组为5～岁组,阳性率超过50%;15～岁和>30岁组血清阳性率分别为47.7%和39.8%;2～岁血清阳性率约为30%,其中0～岁和1～岁两个低年龄组的血清阳性率最低,不超过20%。结论5岁以下低年龄儿童是肠道病毒71型的易感人群。; 周世力李琳琳何雅青; 关键词：肠道病毒71型流行病学

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