张翠彩 作品数:22 被引量:54 H指数:6 供职机构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 贵州省优秀科技教育人才省长资金项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
2011年贵州省钩端螺旋体病疫区鼠类动物带菌监测与菌株分型 被引量:6 2013年 由致病性钩端螺旋体(简称钩体)感染引起的钩体病是全世界流行的人兽共患传染病。由于钩体病通过疫水迅速传播,因而是洪涝、地震等自然灾害发生时重点检测的传染病。中国自然灾害频发,且不少地区是钩体病流行疫区。中国疾病预防控制信息系统数据显示,贵州省近年来钩体病发病率虽然有所下降,但病死率却呈上升趋势。 李世军 张翠彩 唐光鹏 王定明 田克诚 刘英 韦小瑜 蒋秀高 李秀文 杨会棉 姚光海 周敬祝 曾正关键词:钩端螺旋体病 中国疾病预防控制信息系统 疫区 人兽共患传染病 环介导等温扩增技术检测钩端螺旋体的研究 被引量:3 2015年 目的利用环介导等温扩增技术,建立检测钩端螺旋体的方法。方法选取钩体LipL32基因,设计了LAMP引物。对27株钩体、25株非钩体样本予以检测,然后进行灵敏度和模拟样本的研究。结果扩增27株钩体结果为阳性,扩增25株非钩体结果为阴性。灵敏度为200拷贝/μL,模拟样本检测下限为200条钩体/μL(煮沸法)和20条钩体/μL(试剂盒提取法)。结论 LAMP实验操作简单,对设备要求不高,可以作为钩体的快速检测方法。 曹志强 张翠彩 李秀文 蒋秀高关键词:环介导等温扩增 核酸扩增 致病性钩端螺旋体TaqMan Real-timePCR检测技术的建立及其应用 被引量:5 2011年 目的建立致病性钩端螺旋体(钩体)TaqManReal-timePCR检测技术。方法以钩体16SrRNA基因的部分片段rrs基因作为靶基因,设计引物、TaqMan探针,PCR产物克隆到pMDl9-T载体,制作标准曲线,建立定量分析质控标准。利用中国15群15型致病性钩体参考菌株、16群21型非致病性钩体参考菌株、50株不同血清群致病性分离株及伯氏疏螺旋体、嗜肺军团菌、肺炎链球菌、脑膜炎奈瑟菌等27株其他常见致病菌检验引物、探针的灵敏性、特异性。将Real-timePCR、普通PCR同时应用于倍比稀释致病性钩体染色体DNA及25份现场鼠肾标本的检测。结果建立、优化致病性钩体Real-time PCR技术,致病性钩体扩增荧光信号阳性,非致病性钩体及其他非钩体菌均无扩增。对于倍比稀释的质粒标准品,Real-timePCR和普通PCR的最低检测下限分别是10copy/μl和10。copy/μl。对于倍比稀释的钩体染色体DNA,两者的最低检测下限分别为:100fg/μl和1ng/μl。25份现场鼠肾标本检测显示,两种方法的检测结果一致。结论以rrs为靶基因建立的Real-timePCR技术,具有较高的灵敏度和特异度,可用于致病性钩体的病原学检测。 张翠彩 李秀文 聂一新 杨会棉 蒋秀高关键词:钩端螺旋体 TAQMAN REAL-TIME PCR 钩端螺旋体快速质谱检测试剂盒 本发明提供一种钩端螺旋体致病性(毒性)快速质谱检测试剂盒,涉及蛋白质指纹图谱检测技术领域。本发明基于质谱技术,构建了针对钩端螺旋体进行快速致病性鉴定的特异性多肽质谱模型,以及使用质谱技术进行致病性检测的试剂盒。本发明试剂... 肖迪 张翠彩 张建中 蒋秀高 张慧芳 李秀文文献传递 2020-2022年湖南省鼠类钩端螺旋体病监测与菌株分型 2024年 目的初步了解湖南省钩端螺旋体病主要宿主动物鼠类的流行病学概况及分离菌株血清学和MLST基因型特征。方法2020-2022年在湖南省湘潭、涟源、双峰及浏阳4个钩体病监测点,开展鼠种构成调查、钩体分离培养、菌株鉴定工作。采用暗视野显微凝集试验(Microscopic agglutination test,MAT)对分离菌株开展血清群鉴定。利用MLST(Multilocus sequence typing)方法开展基因分型分析,分别对7个位点(glmU、pntA、sucA、tpiA、pfkB、mreA和caiB)进行普通PCR扩增、测序、序列分析。结果4个湖南钩体病监测点共捕啮齿类和食虫目动物461只,平均鼠密度为2.52%,共分离菌株56株,来源于黑线姬鼠、黄胸鼠和鼩鼱3个种类,钩体分离率是12.15%。湖南省4个监测点以黑线姬鼠为优势鼠种,占88.72%。经MAT鉴定显示:56株湖南钩体分离株隶属于黄疸出血群和澳洲群两个血清群,黄疸出血群为当地主要流行血清群,占94.64%。MLST分型结果显示:56株湖南省分离株ST型别包括ST1、ST128和ST1053个基因型,其中ST1(57.14%)和ST128(37.50%)为湖南主要流行ST型。利用BioNumerics软件进行UPGMA聚类分析显示:56株菌株被分为3个不同Clades,分别对应3个不同ST型,ST型分布在不同动物种类和地域上呈现明显差异。结论黄疸出血群、ST1和ST128为湖南省主要流行型别,初步了解湖南省钩端螺旋体病鼠类动物流行病学概况及流行菌株分子分型特征,对湖南省钩体病的防控和疫苗制备提供科学依据。 邱海燕 肖明霞 张翠彩关键词:钩端螺旋体 血清群 MLST 多位点序列分型应用于致病性黄疸出血群钩端螺旋体分析 被引量:6 2015年 目的初步探讨MLST(multilocus sequence typing)分型技术在致病性钩端螺旋体中的应用。方法对我国3个省份的39株致病性钩端螺旋体黄疸出血群菌株提取DNA,采用7个位点进行PCR扩增、序列测定,应用eBURST和BioNumerics(Version5.10)软件进行分析。结果 39株菌株呈现5个ST型别,ST1为中国三省份中主要的基因型,占53.85%(21/39)。eBURST分析显示:39株菌株分为2个Clonal complexes和1个singleton,其中Group1占66.67%(26/39),Group2占20.51%(8/39),一个singleton占12.82%(5/39);BioNumerics软件聚类分析显示:39株菌株分为3个Group,与eBURST分析中的分群结构一致。MLST基因型别具有明显的地域性特征。结论 MLST方法可初步应用于致病性钩端螺旋体分子流行病学、种群结构、亲缘进化关系等研究。 张翠彩 徐建民 李秀文 曹志强 蒋秀高关键词:钩端螺旋体 基因分型 MLST 贵州省不明原因发热病例钩端螺旋体病原体分离鉴定研究 被引量:3 2020年 目的对贵州省钩端螺旋体(钩体)病疫区不明原因发热病例进行钩体分离鉴定和分子分型,了解其病原学特征,为当地钩体病的防治提供病原学依据。方法采集贵州省钩体病疫区黔东南州黎平县不明原因发热病例血液和尿液标本进行钩体分离培养,对分离的钩体疑似菌株通过致病性钩体G1/G2-PCR方法进行初步鉴定,进一步采用钩体血清群特异PCR进行分群鉴定,然后采用多位点序列分型(MLST)技术对其进行分子分型,并与国内常见血清群参考菌株进行聚类分析。结果从35例发热病例血液中分离得到3株钩体疑似菌株,分离率为8.6%,分别命名为17BX002、17BX003和17AJX008;3株菌株经钩体特异性G1/G2-PCR鉴定为致病性钩体;钩体血清群PCR鉴定显示,17BX002株为流感伤寒群钩体,其余2株菌为阴性(排除其为黄疸出血群、赛罗群、犬型、秋季群、流感伤寒群和七日热群);进一步的MLST显示,17BX002株为ST106型,与流感伤寒群聚类最近,而其余2株为ST96型,与巴达维亚群菌株一致。结论高发季节贵州省疫区不明原因发热病例中存在钩体感染病例,流感伤寒群和巴达维亚群为贵州省新发现钩体菌群。 刘英 黄荷 张翠彩 姚光海 徐飞 马青 王月 唐光鹏 王定明 李世军关键词:钩端螺旋体 发热病例 聚合酶链式反应 多位点序列分型 霍乱弧菌流行菌株整合子区结构特征及其应对不同环境的转录分析 霍乱是由霍乱弧菌(Vibrio cholerae)引起的一种急性肠道传染病,是《中华人民共和国传染病防治法》中规定的甲类传染病,也是国际上检验检疫的传染病之一。根据细菌O抗原的不同,霍乱弧菌可分为200多个血清群,其中O... 张翠彩关键词:霍乱弧菌 整合子 基因盒 转录 QRT-PCR 文献传递 2016-2018年江西省钩端螺旋体病鼠类动物流行病学调查与分离菌株鉴定 被引量:18 2019年 目的初步了解江西省钩端螺旋体病主要宿主动物鼠类种类构成、带菌率及血清学和分子流行病学特征,为钩体病的防控提供科学依据。方法2016-2018年选取江西省钩体病4个国家级监测点上饶、上高、上犹及浮梁县作为现场监测地点,开展鼠类种类调查、钩体分离培养工作。利用暗视野显微镜凝集试验和MLST技术对分离菌株进行血清学鉴定和MLST基因分型。结果共计捕鼠14387只,平均鼠密度为9.76%,分离菌株64株,鼠类钩体分离率为4.56%。鼠种构成包括黑线姬鼠、褐家鼠、黄毛鼠、黄胸鼠及社鼠5个种类。4个监测点优势鼠种均以黑线姬鼠和黄毛鼠为主。血清群鉴定结果显示:64株菌株隶属于3个血清群,其中黄疸出血群为主要优势血清群,占81.25%,其次是爪哇群和致热群。MLST研究显示:64株菌株隶属于6个ST型别,分别为ST1、ST17、ST92、ST143、ST216和ST224,其中ST1为主要基因型,占76.56%。BioNumerics软件分析显示:64株菌株隶属于6个Clusters,分别对应6个ST型,血清学、MLST基因型分布具有明显地域差异。结论江西省以黑线姬鼠和黄毛鼠为优势鼠种,黄疸出血群和ST1为江西省钩体病主要流行型别,充分了解江西省钩体病可能的宿主动物以及血清学和分子流行病学特征,对钩体病的预防控制有一定的指导意义。 张翠彩 张汀兰 徐建民 蒋秀高 邱海燕关键词:钩端螺旋体 宿主动物 血清群 MLST 贵州省3株钩端螺旋体分离株PFGE分型与基因种鉴定 被引量:7 2011年 目的应用脉冲场电泳(PFGE)分型技术和16S rRNA基因测序分析技术分别对贵州省3株动物宿主钩端螺旋体分离菌株进行分子分型和基因种鉴定,了解贵州省钩端螺旋体的分子流行病学特征。方法应用DNA限制性内切酶NotI对钩端螺旋体染色体DNA酶切后,用PFGE将DNA片段分离,采用BionumericsV4.0将3株钩体菌株PFGE图谱与中国15群15型参考菌株进行聚类分析;同时,应用PCR扩增几乎全长的钩体16S rRNA基因片段,并将扩增产物进行双向序列测定,并与GenBank数据库已注册的核酸序列进行同源性比对、确定基因种、分析亲缘进化关系。结果来自贵州省的3株动物宿主分离钩体菌株PFGE带型命名为LepNot I 002和LepNot I 003,经聚类分析,3株菌株与黄疸出血群黄疸出血型赖株的相似性大于95%。16S rRNA基因测序和分析表明,3株贵州分离钩体菌株之间的同源性为100%,与致病性钩体问号钩端螺旋体种(L.interrogans)不同血清型参考菌株的同源性达100%。结论 3株贵州动物分离钩体菌株经PFGE分型鉴定与黄疸出血群赖型赖株的相似性大于95%,经16S rRNA基因测序分析鉴定为L.interrogans种,上述两种方法对贵州省钩体分离菌株的鉴定结果一致,有助于贵州省钩端螺旋体病的主动监测、暴发调查和传染源追踪。 李世军 张翠彩 李秀文 唐光鹏 田克成 刘英 蔡星和 于春 聂一新 蒋秀高关键词:钩端螺旋体 PFGE RRNA 同源性