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基于多平台基因表达数据的水稻干旱和盐胁迫相关基因预测被引量：4: 2021年; 基于多平台基因表达数据挖掘水稻胁迫相关基因,可增加关键基因预测的可靠性,获得更具普适意义的结果。本研究从NCBI数据库中收集了与水稻非生物胁迫相关的94份affymetrix基因芯片数据和42份RNA-seq转录组数据。首先对同一类型同一胁迫相关的多个数据集以数据转换法融合,得到干旱胁迫相关的affymetrix数据集D_affy和RNA-seq数据集D_rnaseq,盐胁迫相关的affymetrix数据集S_affy和RNA-seq数据集S_rnaseq;接着对4个数据集分别基于Pearson线性相关系数的经典WGCNA法和基于MIC非线性相关系数的改进WGCNA法进行基因共表达网络分析,共获取胁迫相关的8个Hub基因集;进一步,对同一胁迫相关的Hub基因进行整合分析,得到最终的水稻干旱胁迫相关Hub基因1936个、盐胁迫相关的Hub基因1504个。最后,从预测性能、富集分析、文献报道、STRING在线互作分析和Cytoscape可视化分析等多角度解析Hub基因的生物学意义。结果显示:Hub基因整体预测性能较优,且大多富集到了与干旱/盐胁迫相关的通路上,其中有文献已报道的干旱胁迫响应基因31个和盐胁迫响应基因22个。此外,通过对Hub基因的互作分析,预测得到11个干旱胁迫候选基因和5个盐胁迫候选基因。本研究为“高维度、小样本”的农作物基因测序数据的有效分析提供了新思路,实验结果为抗逆水稻品种研究提供了参考。; 刘亚文张红燕曹丹李兰芝; 关键词：水稻多平台干旱胁迫盐胁迫

一种基于多源数据的动物营养状况监管系统: 本发明公开了一种基于多源数据的动物营养状况监管系统，具体涉及大数据技术领域，包括数据采集模块、数据融合模块、数据分析模块、营养状况评估模块、营养状况分析模块，以及报告输出模块；通过营养状况评估模块，根据动物个体全面营养状...; 肖毅刘莹莹张红燕蒋桂韬陈义明

肿瘤信息基因选择与分类方法研究: 肿瘤是多基因与环境共同作用的结果,大规模基因表达谱技术的出现及其飞速发展为肿瘤研究提供了一种全新的技术平台。基于基因表达谱的数据挖掘对致病基因发现、肿瘤临床诊断、药物疗效判断和发病机理阐明等意义重大。肿瘤基因表达谱数据多...; 张红燕; 关键词：肿瘤基因表达谱支持向量机; 文献传递

一种基于音频检索的有线电视网信息审核系统: 2005年; 目前有线电视网节目内容的审核大多基于人工,不仅费时费力,且与先进的现代电视技术极不相匹配。本文实现了一种基于音频检索的有线电视网节目内容审核系统,以对暴力内容进行识别为实例,通过提取音频特征与定义好的特征库相匹配,监控包含不良信息的视频。; 张红燕姚建华喻飞; 关键词：有线电视网音频检索音频特征特征库

基于科研能力培养的研究生课程教学改革——以“农业信息获取与处理”课程为例被引量：2: 2019年; 研究生的科研能力是衡量研究生培养质量的重要指标。以研究生课程"农业信息获取与处理"为例,进行一系列的教学方法和教学手段的改革。通过优化课程教学内容、引入科研案例教学、设计实验教学环节和构建网络教学互动平台等措施,课程教学在兼顾专业知识传授的同时,突出研究生的主体地位,渗透创新思维和科研能力的培养。; 张红燕; 关键词：课程教学

机器学习在农作物品种识别中的应用研究进展被引量：9: 2020年; 机器学习在图像识别领域的成功应用,为农作物品种的自动识别提供了一种新的思路。为了全面了解机器学习在农作物品种识别中的应用现状,把握农作物品种识别的发展趋势和研究方向,本文归纳了农作物图像的常用获取方法,分析了光谱图像和RGB图像结合机器学习方法识别农作物品种的研究现状。基于RGB图像进行农作物品种识别研究起步较早,图像获取成本较低,识别率一般;基于高光谱图像进行农作物品种识别研究近年来发展迅速,识别精度较高,但图像获取成本较高,且易受环境因素影响。通过总结,指出了农作物品种识别研究中存在的问题,认为深度学习在农作物品种自动识别上具有广泛的应用前景.; 阳灵燕张红燕陈玉峰刘亚文; 关键词：光谱图像 RGB图像图像分类

有监督学习关键问题算法创新与应用: 袁哲明周玮张红燕代志军王立峰陈渊; 信息与大数据时代并不缺乏数据，缺少的是对数据深入分析、获取知识的有效算法。有监督学习广泛见于生物信息学、模式识别与预测等多个领域。对单因变量、多自变量非纵向数据集(y<,i>，x<,i,j>)，i=1,2，…，n；j=1...; 关键词：; 关键词：生物信息学有监督学习

基于支持向量机的算法创新及生物信息数据挖掘: 袁哲明周玮李兰芝张红燕; 数据不等于知识，信息时代特别是大数据时代，课题组并不缺少数据，缺乏的是对数据深入分析、挖掘、获取知识的能力。人类复杂疾病和动植物诸多重要性状皆为数量性状，数据呈现高度的复杂性，传统的统计分析方法已无能为力。支持向量机（...; 关键词：; 关键词：支持向量机

基于文献计量的农业信息化研究特征阐释与热点分析被引量：3: 2020年; 对国内外农业信息化领域的研究特征与研究热点进行归纳和分析,为我国农业信息化的后续研究提供参考。采用文献计量法和共词聚类法,借助R语言编程工具,针对CNKI和Web of Science数据库中与农业信息化相关文献,分别从时间分布、核心作者、来源期刊、研究热点和研究趋势进行定量统计和定性分析。结果表明,国内研究更关注农业信息服务、农村信息化建设与现代农业发展等,而国际研究更关注与农业生产和管理相关的气候变化监测、土地利用管理、生态服务等。因此,我国农业信息化的研究应更加深入,并更多关注现代信息技术在具体农业生产实践中的应用。; 毛先才张红燕刘亚文阳灵燕; 关键词：农业信息化核心著者 R语言

共词分析国内外生物信息学领域研究态势被引量：8: 2020年; 生物信息学作为自然科学领域中多学科交叉的新兴学科,其发展研究得到了众多学者的关注。为了解生物信息学在国内外的研究态势,以CNKI中文数据库和Web of science外文数据库中生物信息学领域期刊论文为研究对象,利用R语言编程工具,文献计量和共词分析归纳了国内外生物信息学领域的研究现状、热点及趋势。结果表明:国内外生物信息学研究均处于高速发展期,文献量呈逐年增长趋势,研究领域也在不断拓宽;国内外研究热点均聚焦在基因挖掘、蛋白质结构与功能预测、miRNA分析等,但国内偏向于理论研究,而国际更注重其在疾病治疗、药物设计等方面的应用研究。; 刘亚文张红燕阳灵燕; 关键词：生物信息学共词分析 R语言

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张红燕

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