夏至 作品数:37 被引量:178 H指数:8 供职机构: 河南农业大学农学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家级星火计划 博士科研启动基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 文化科学 更多>>
基于ISSR的地黄栽培品种与野生群体遗传多样性研究 被引量:8 2020年 目的基于ISSR分子标记研究地黄Rehmannia glutinosa栽培品种与野生群体遗传多样性,比较它们的遗传多样性差异,构建它们之间亲缘关系,为地黄种质资源保护及新品种选育提供参考。方法应用ISSR分子标记技术对地黄栽培品种,野生群体及其近缘种106个样品进行分析,利用POPGEN软件分析Nei’s基因多样性指数(H)等遗传信息参数,应用NTSYS软件构建亲缘关系UPGMA聚类图。结果 7条引物在所有取样群体中,共检测到85个位点,其中多态性位点83个,多态位点百分率(PPB)为97.65%。地黄栽培品种与野生群体及其近缘种的种群间H值为0.265 9,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.412 5。地黄栽培品种的多态性位点26个,PPB为30.59%。河南省地黄野生群体多态性位点71个,PPB为83.53%。ISSR聚类分析结果显示地黄栽培品种,野生群体及其近缘种共分成7个组。结论 ISSR分子标记揭示地黄野生群体比栽培品种具有更高的遗传多样性,河南分布的野生地黄群体的遗传多性高于其他地区,与其作为栽培地黄的道地产区,具有一定的相关性。地黄野生群体间亲缘关系与其地理分布格局并无明显相关性。 李翠翠 胡赛文 夏至关键词:地黄 栽培 野生群体 ISSR 白花蛇舌草居群AFLP分析 被引量:1 2010年 采用AFLP分子标记技术,利用筛选出6对多态性较强的引物组合,构建了白花蛇舌草25份种质的AFLP指纹图谱.6对引物组合共扩增出888条谱带,其中多态带661条,占73%.聚类分析结果表明,来源地相同的白花蛇舌草居群多表现出较为密切的亲缘关系,不同来源地的白花蛇舌草居群间遗传差异相对较大,其中海南白花蛇舌草独自呈类,与其它省份的亲缘关系较远. 李贺敏 夏至 李潮海关键词:白花蛇舌草 种质资源 聚类分析 洋金花与木本曼陀罗叶绿体基因组特征与系统进化分析 2022年 目的以洋金花Datura metel和木本曼陀罗Brugmansia arborea为材料,分析其叶绿体基因组结构和特征,基于叶绿体组数据探讨洋金花和木本曼陀罗及茄科其他物种的系统发育关系。方法利用华大MGISEQ-2000PE150测序平台,双末端测序策略对基因组DNA建库测序,用NOVOPlasty组装叶绿体基因组,采用最大似然法(maximum likelihood,ML)构建系统进化树。结果洋金花和木本曼陀罗的叶绿体基因组全长为155934bp和155939bp,分别包含131和130个基因,GC值32.3%,具有典型的四分区域结构,包括1个大单拷贝区(large single copy,LSC)、1对反向重复区(inverted repeats,IR)和1个小单拷贝区(small single copy,SSC),各区域序列长度分别为86354、86278、25609、25720、18362、18221 bp。系统发育分析表明,洋金花与曼陀罗属的曼陀罗构成1单系分支,具有100%支持率,而木本曼陀罗属与曼陀罗属构成单系分支,具有100%支持率。结论结果支持洋金花隶属于曼陀罗属,与曼陀罗亲缘关系较近,木本的木曼陀罗属从曼陀罗属分出,独立为一个属。洋金花和木本曼陀罗叶绿体基因组信息为后期分子鉴定和群体遗传研究奠定基础。 毕光耀 丁怡宁 王丽 胡赛文 李贺敏 雷明 张占江 夏至关键词:洋金花 木本曼陀罗 系统发育 采收期对白花蛇舌草产量和品质的影响及最佳采收期的确定 2013年 在大田试验条件下,探讨了白花蛇舌草不同采收期的农艺性状、干物质积累及各种有效成分的变化.结果表明,从08-03到10-02白花蛇舌草干物质积累量逐渐增加,由于叶的脱落,09-12后干物质积累增加缓慢;各种有效成分含量变化规律不同,齐墩果酸和熊果酸前期升高,后期下降,最高值在09-12;氨基酸和总黄酮的含量均在08-03最大,以后逐渐下降;多糖含量在9月份达到较高水平,以后逐渐下降;总蒽醌含量在前期较稳定,09-12后下降.根据各有效成分对白花蛇舌草功效的贡献计算质量指数,各采收期生物量变化计算生物量指数,二者相加得出采收指数.不同采收期的采收指数中以09-12最高,故9月中旬是白花蛇舌草的最佳采收期. 李贺敏 江新生 夏至 周艳关键词:白花蛇舌草 干物质量 采收期 基于5个基因片段的野胡麻属系统位置研究 被引量:2 2012年 对单种属野胡麻属(原隶属于广义玄参科)及其可能近缘类群广泛取样,选择合适外类群,通过对4个叶绿体基因联合数据(trnL-F、rps16、rbcL、rps2)、核基因ITS片段、叶绿体基因与核基因ITS片段联合数据,进行最大简约法和贝叶斯法分析,探讨野胡麻属在科级系统位置及其与近缘类群系统发育关系。结果表明,所有系统树都支持野胡麻属先和肉果草属构成姐妹群关系,叶绿体基因联合系统树支持率分别为97%[Bootstrap(BS)]和100%[Posterior probability(PP)];ITS系统树支持率分别为99%(BS)和100%(PP);叶绿体基因和ITS联合系统树支持率均为100%(BS和PP)。野胡麻属、肉果草属与通泉草属一起构成一单系群,叶绿体基因联合系统树、ITS系统树、叶绿体基因和ITS联合系统树的支持率均为100%(BS和PP)。形态学证据也支持野胡麻属、肉果草属和通泉草属这3个属的近缘关系。本研究结果支持单种属野胡麻属隶属于透骨草科的通泉草亚科,与肉果草属亲缘关系最近,这两个属进而与通泉草属近缘,可能隶属于通泉草属内,与岩白翠亲缘关系较近,也可能与通泉草属互为姐妹群关系。 夏至 李家美 张红瑞 李贺敏 高致明关键词:DNA序列 系统发育关系 中药材菊花和野菊花的DNA条形码鉴定研究 被引量:8 2013年 目的利用DNA条形码鉴定技术快速、准确鉴别中药材菊花和野菊花及其近缘种(易混品)。方法对药用菊花和野菊及其近缘种(易混品)ITS序列进行PCR扩增和测序,计算物种种内种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,采用相似性搜索法、最近距离法、构建邻接(NJ)分子系统树等方法进行鉴定分析。结果药用菊花与其近缘种(易混品)之间K2P遗传距离分布于0.004 71~0.006 30,大于药用菊花种内K2P遗传距离(0~0.001 56);野菊与其近缘种(易混品)之间K2P遗传距离分布于0.003 13~0.006 29,大于野菊种内的K2P遗传距离0;邻接(NJ)分子系统树上,药用菊花栽培类型的7个体单独聚为一支,支持率为82%;野菊的4个个体单独聚为一支,支持率为78%。结论三种鉴定方法结果表明ITS序列适合鉴别中药材菊花和野菊与其近缘种(易混品)。 夏至 李家美 张红瑞 李贺敏 高致明关键词:DNA条形码 ITS 菊花 野菊花 铬胁迫对丹参种子萌发及幼苗生理特性的影响 2024年 为了明确重金属铬胁迫对丹参种子萌发、幼苗生长与生理指标的影响,采用不同浓度(0、50、100、150、200、250 mg/L)K_(2)Cr_(2)O_(7)处理丹参种子,测定种子发芽率和幼苗根长、苗鲜质量、叶绿素含量及抗逆酶活性等指标。结果表明,丹参种子发芽率及幼苗根长、苗鲜质量、叶绿素含量均随着Cr^(6+)浓度增加而下降;随着Cr^(6+)浓度增加,丹参幼苗POD活性显著升高,CAT活性先升高后降低,SOD活性逐渐下降,Pro和MDA含量增加。研究表明,Cr^(6+)对丹参种子萌发及幼苗生长有显著的胁迫和毒害作用,幼苗根的生长受Cr^(6+)胁迫最为严重。 李秋莹 于婵 周艳 李贺敏 夏至 陈欣 黄勇关键词:丹参 种子 发芽率 生理特性 药用植物萹蓄叶绿体基因组特征与系统进化分析 被引量:7 2022年 目的以药用植物萹蓄Polygonumaviculare为材料,利用高通量技术测定基因组DNA序列,对叶绿体基因组进行组装和序列分析,为进一步开展药用植物萹蓄的群体遗传学和遗传多样性研究奠定基础。方法利用华大MGISEQ-2000PE150测序平台,双末端测序策略对其全基因组DNA建库测序,测定萹蓄的基因组DNA序列,用NOVO Plasty组装叶绿体基因组,采用最大似然法(maximum likelihood,ML)构建系统进化树。结果萹蓄叶绿体基因组全长为163461 bp,GC值37.5%,具1个典型的四分区域结构,包括1个大单拷贝区(large single copy region,LSC)、1对反向重复区(inverted repeats,IR)和1个短单拷贝区(small single copy,SSC),序列长度分别为88023、31066、13306 bp。萹蓄的叶绿体基因组共有130个基因,其中编码蛋白基因、r RNA基因与t RNA基因的数量分别为83、8、37个。系统进化分析表明,萹蓄与木蓼属的额河木蓼构成一单系分支,具有100%支持率。结论萹蓄隶属于蓼科的蓼属,与木蓼属的额河木蓼亲缘关系较近。萹蓄叶绿体基因组的组装、序列特征、间隔区的筛选及系统进化分析为后续开展群体遗传学和遗传多样性研究奠定基础。 胡赛文 丁怡宁 毕光耀 李翠翠 苏春 窦利军 李贺敏 夏至关键词:萹蓄 蓼属 系统发育 联系专业实际进行药用植物学野外实习 被引量:11 2010年 为适应农业院校中药学专业课程体系中既有中药学专业的特点,又有农学专业的优势和特色,本文分析了农业院校药用植物学野外实习在中药学专业课程体系建设中的地位和作用,探索了实习各个环节,如标本采集、鉴定整理、样方调查等与药用植物资源学、中药学、中药鉴定学、药用植物栽培学等课程的联系。通过联系专业实际,提高了野外实习效果,增强了学生专业学习的兴趣,为后期的专业课学习奠定了基础。 张红瑞 夏至 李贺敏 高致明关键词:农业院校 药用植物学 野外实习 红花不同花色变异类型叶绿体基因组特征与系统进化分析 被引量:1 2023年 目的 以红花Carthamus tinctorius不同花色变异类型为材料,比较分析其叶绿体基因组结构及其与近缘类群的系统发育关系,为中药材红花种质资源鉴定和群体遗传学研究奠定基础。方法 利用华大MGISEQ-2000PE150测序平台,双末端测序策略对红花不同花色类型全基因组DNA建库测序,用NOVOPlasty组装叶绿体基因组,采用最大似然法(maximum Likelihood,ML)构建系统进化树。结果 红花3种花色变异类型叶绿体基因组全长均为153114bp,完全一致,GC值均为37.8%,具1个典型的四分区域结构,包括1个大单拷贝区(large single copy region,LSC)、1对反向重复区(inverted repeats,IR)和1个短单拷贝区(small single copy,SSC),4个区序列长度分别为84 128、25 194、18 598 bp。红花的叶绿体基因组均有130个基因,其中编码蛋白基因、r RNA基因与tRNA基因的数量均为84、8、38个。系统进化分析表明,红花3种花色变异类型聚在一支,与菜蓟族的铺散矢车菊构成一单系分支,具有100%支持率。结论 叶绿体基因组数据支持红花3种花色变异类型来源为同一种,药用植物红花(所在红花属)隶属于菊科菜蓟族的矢车菊亚族。 丁怡宁 毕光耀 胡赛文 周艳 李贺敏 夏至关键词:红花 叶绿体基因组 系统发育 近缘类群