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王乐珩

作品数：27 被引量：25H指数：3
供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
发文基金：国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
相关领域：自动化与计算机技术生物学理学医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 17篇专利
  • 5篇期刊文章
  • 4篇会议论文
  • 1篇科技成果

领域

  • 10篇自动化与计算...
  • 2篇生物学
  • 2篇医药卫生
  • 2篇理学
  • 1篇建筑科学
  • 1篇交通运输工程
  • 1篇文化科学

主题

  • 21篇蛋白
  • 21篇蛋白质
  • 21篇白质
  • 16篇蛋白质鉴定
  • 11篇索引
  • 10篇蛋白质序列
  • 9篇肽谱
  • 7篇质谱
  • 7篇索引文件
  • 7篇分布式
  • 6篇分布式并行
  • 3篇蛋白质组
  • 3篇预处理
  • 3篇酶切
  • 3篇查询
  • 3篇串联质谱
  • 2篇蛋白质谱
  • 2篇蛋白质数据库
  • 2篇蛋白质组学
  • 2篇质谱技术

机构

  • 27篇中国科学院
  • 2篇中国科学院研...
  • 1篇宁波大学
  • 1篇上海生物信息...
  • 1篇中国科学院大...

作者

  • 27篇王乐珩
  • 22篇贺思敏
  • 22篇迟浩
  • 21篇孙瑞祥
  • 17篇付岩
  • 9篇王文平
  • 9篇周郴
  • 7篇吴妍洁
  • 6篇李由
  • 6篇袁作飞
  • 5篇王海鹏
  • 4篇张文力
  • 4篇秀丽蕴
  • 4篇刘超
  • 3篇董梦秋
  • 3篇杨兵
  • 2篇赵晓芳
  • 2篇宋春青
  • 2篇吴研洁
  • 2篇李德泉

传媒

  • 4篇2010年全...
  • 2篇生物化学与生...
  • 1篇微电子学与计...
  • 1篇色谱
  • 1篇计算机工程与...

年份

  • 2篇2016
  • 7篇2014
  • 1篇2013
  • 5篇2012
  • 2篇2011
  • 8篇2010
  • 2篇2007
共 27 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统，该方法包括：步骤1，用并行处理方法，对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列，对肽序列进行排序、去冗余处理，以创建肽索引文件块；步骤2，用并行处理方法，对质谱谱图进...
王乐珩王文平迟浩吴妍洁周郴付岩孙瑞祥贺思敏
一种开放式蛋白质鉴定的分布式加速方法及其系统
本发明公开了一种开放式蛋白质鉴定的分布式加速方法及其系统，其中开放式蛋白质鉴定的分布式加速系统包括：蛋白库索引建立模块、谱图数据准备模块、查询打分模块、结果汇总输出模块。本发明提供的一种开放式蛋白质鉴定的分布式加速方法和...
张文力迟浩路远征王乐珩赵晓芳贺思敏
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列，对肽序列进行排序、去冗余处理，以创建肽索引文件块；步骤2，用并行处理方法，对质谱谱图进行排序，并将...
王乐珩王文平迟浩吴妍洁周郴付岩孙瑞祥贺思敏
开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统
本发明有关于一种开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，输入蛋白质序列，模拟切分每一条蛋白质序列，并将所有生成的子序列按照质量排序，生成肽序列数据表，并根据该肽序列数据表建立索引文件；步骤2，输...
迟浩孙瑞祥王乐珩张文力贺思敏
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，用并行处理方法，对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列，对肽序列进行排序、去冗余处理，以创建肽索引文件块；步骤2，对质谱谱图进行排序，并将...
王乐珩王文平迟浩吴妍洁周郴付岩孙瑞祥贺思敏
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一种用后缀数组加速大规模蛋白质鉴定的方法及其系统
本发明公开了一种用后缀数组加速大规模蛋白质鉴定的方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，根据数据库中的蛋白质序列创建相应的后缀数组，并根据所述后缀数组推断与所述蛋白质序列相应的最长公共前缀；步骤2，基于最长公共前缀和酶切规...
周郴迟浩王乐珩李由吴研洁付岩孙瑞祥贺思敏
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pPre_ITMS:基于机器学习方法的串联质谱数据预处理系统
2007年
串联质谱技术被广泛应用于高通量的蛋白质鉴定。质谱中噪音峰和同位素峰的存在会降低蛋白质鉴定的准确性,同时增加计算负担。pPre_ITMS系统是针对离子阱数据,利用机器学习中的最大期望方法和决策树方法分别识别出质谱中的噪音基线和同位素峰的预处理系统。此外,pPre_ITMS系统采用三层独立模型增强系统鲁棒性,并提供了手动调节功能。利用pPre_ITMS系统可以简单、快速且可视化地对离子阱数据进行预处理。
邹翠付岩孙瑞祥王乐珩赵德斌
关键词：串联质谱预处理
一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法及相应的系统
本发明提供一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法，包括：为肽序列设定质量区间；为计数窗口设定大小，并结合质量区间设定计数窗口的数目以及各个计数窗口的范围；对蛋白质数据库做模拟酶切，根据模拟酶切所得到的肽序列的质量计算肽序列...
李由李德泉王乐珩迟浩王海鹏付岩孙瑞祥贺思敏刘超袁作飞王文平秀丽蕴
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通过理论候选肽生成改进肽谱匹配中E-Value的计算
吴妍洁王乐珩迟浩贺思敏
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开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统
本发明有关于一种开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，输入蛋白质序列，模拟切分每一条蛋白质序列，并将所有生成的子序列按照质量排序，生成肽序列数据表，并根据该肽序列数据表建立索引文件；步骤2，输...
迟浩孙瑞祥王乐珩张文力贺思敏
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