徐乐
- 作品数：5 被引量：22H指数：2
- 供职机构：厦门大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金福建省自然科学基金国家卫生部科学研究基金更多>>
- 相关领域：理学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 核磁共振代谢组学数据预处理的鲁棒归一化方法
- ＜正＞利用核磁共振（NMR）分析生物样品的代谢组分时,波谱信号的强度不可避免地受样品的浓度、实验参数（如增益系数、累加次数）、谱仪的稳定性、热噪声以及接收机灵敏度等多种因素的影响。然而,谱信号的绝对强度对于定量研究代谢物...
- 董继扬徐乐蔡聪波陈忠
- 文献传递
- 核磁共振代谢组学数据处理新方法及应用
- 代谢组学是关于定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的科学，是系统生物学的有机组成部分。以核磁共振(Nuclear MagneticResonance，NMR)为主要分析手段的代谢组学通常称为NMR...
- 徐乐
- 关键词：核磁共振代谢组学数据预处理非负矩阵分解模式识别
- 文献传递
- 核磁共振代谢组学数据预处理中的自适应分段积分方法被引量：8
- 2009年
- 提出一种用于核磁共振代谢组学数据预处理的自适应分段积分方法.通过计算各数据点统计特性,并根据相邻数据点的统计差特性进行自适应积分,克服了目前普遍采用的等间隔分段积分法可能存在的缺陷(如统计差异性相反的信号相互抵消、微弱特征信号被掩盖及谱图信噪比下降等),从而避免了对后续统计分析所产生的负面影响.为比较自适应分段积分和等间隔积分对数据预处理的效果,分别采用计算机模拟数据和饮食差异人群两种模型进行分析.研究结果表明,新方法能够有效地削弱噪声和非特异信号的影响,提高后续的主成分分析结果的可靠性,使代谢组学数据分析更具生物学意义.
- 董继扬徐乐许晶晶陈忠
- 关键词：核磁共振代谢组学数据预处理
- 代谢组学数据分析方法及在糖尿病研究中的应用被引量：14
- 2007年
- 对NMR波谱数据的统计分析是基于NMR代谢组学研究的关键问题之一.鉴于NMR波谱信号可以近似为样品中各种成分谱信号的线性叠加,本文将非负矩阵分解(NMF)方法引入基于NMR代谢组学的数据处理中,并与代谢组学中常用的统计方法——主成分分析(PCA)进行比较.通过NMF和PCA两种方法对健康志愿者与2型糖尿患者血液和尿液的NMR谱图的统计分析,对所获取的特征代谢物进行比较和验证,并探讨了PCA方法可能存在的不足之处及其原因;阐明了NMF方法是基于NMR的代谢组学研究中较理想的数据分析方法.最后,讨论了基于NMR代谢组学在糖尿病研究中的前景.
- 董继扬徐乐曹红婷戴晓侠李学军杨叔禹陈忠
- 关键词：2型糖尿病非负矩阵分解主成分分析
- 代谢组学数据预处理中的自适应分段积分方法
- 在核磁共振(NMR)代谢组学的数据预处理中,谱线的分段积分是一个重要的步骤,其目的主要有:(1)维数削减。样品的H NMR谱通常具有几千甚至几万个数据点,远大于样品的数量,为了避免后续的模式识别分析出现"维数灾难"等问题...
- 徐乐董继扬蔡聪波陈忠
- 文献传递
