丁银环
- 作品数:31 被引量:49H指数:4
- 供职机构:泸州医学院附属医院更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划四川省卫生厅科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学生物学更多>>
- 食管癌血清蛋白质谱揩纹图分析及人工神经网络诊断模型研究
- 2010年
- 目的利用高通量和高灵敏的表面激光解析电离飞行时间质涪技术(SELDI—TOF—MS)寻找食管癌患者血清中微量的标志性差异蛋白质组,为探索食管癌发生与基因转录的蛋白调控机制,基因治疗以及早期诊断提供参考数据,方法用SELDI—TOF—MS检测食管癌及其相关人群的血清蛋白质谱指纹图,用Biomarkex Wizaid Software软件筛选出差异蛋白,选择具有标志性的差异蛋白质组建立人工神经网络诊断模型,使用SPSS分析其诊断效能。结果在食管癌患者血清中发现89个差异蛋白(P〈0.05)。其中有显著差异(P〈0.001)的蛋白质如下:在食管癌患者血清中表达增高的蛋白(5017.6Da,7458、5Da,7908,1Da,8111.9Da,8577,8Da)和表达降低的蛋白(4215.8Da,5890.9Da,7749.3Da)。利用筛选出8个有明显表达差并的蛋白质组建立食管癌人工神经网络筛查模型和诊断模型,其灵敏度达到93.2%和96.3%,特异度分别为95.6%和97.2%,经大样本盲法验证的灵敏度为75.4%和75.8%,特异度分别为84.8%和86.7%,经蛋白组数据库检索发现两种蛋白分别为血清淀粉样蛋白A和子宫球蛋白。结论血清蛋白质谱指纹图结合人工神经网络技术进行蛋白组学数据挖掘对食管癌的筛查和诊断以及探索其基因和蛋白调控机制具有重要的临床意义。
- 任兴军谭小林杨成虎王开正冯峰胡球英丁银环戴天阳
- 关键词:食管癌血清蛋白质组人工神经网络
- 精神分裂症患者血清特征多肽及其鉴定的研究被引量:3
- 2014年
- 目的验证筛选出的具有特异性的血清蛋白标志物,为精神分裂症寻找客观的临床诊断依据。方法利用酶联免疫吸附试验(ELISA)技术和自动酶标仪分别测出血清特征多肽在精神疾病组和健康对照组中的吸光度值,再通过SPSS17.0对数据进行单因素方差分析,以此验证血清多肽的特异性。结果在单因素方差分析中,神经肽2在精神分裂症组与健康对照组比较,显著性水平为0.040,其他精神疾病对照组与健康对照组比较,显著性水平为0.008,说明神经肽2在这两组比较中差异有统计学意义(P<0.05);在多独立样本检验中,神经肽2的渐近显著性水平为0.031,神经肽2在各组之间的表达差异有统计学意义(P<0.05)。结论神经肽2在精神分裂症患者与健康人之间存在明显特异性,对该病诊断、治疗和基因的研究具有重要意义。
- 程松郭婧澜丁银环王开正
- 关键词:精神分裂症
- 非霍奇金淋巴瘤血清蛋白质质谱分析
- 2011年
- 目的:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术检测血清蛋白指纹图,通过差异蛋白组学筛选非霍奇金淋巴瘤(non-hodgkin’s lymphoma,NHL)特有的蛋白标记物,找出最佳的标志蛋白组合模式建立非霍奇金淋巴瘤诊断模型。方法:用Ciphergen公司生产的PBSⅡ/C型蛋白质指纹图谱仪和Au-Chpi金芯片采集50例NHL患者(NHL组)、50例淋巴结炎患者(淋巴结炎组)、50例健康志愿者(对照组)血清蛋白质指纹图谱,采用Biomaker Wizard3.1版分析软件筛选差异蛋白,建立NHL诊断模型。结果:NHL患者、淋巴结炎患者、健康志愿者血清蛋白质指纹图谱之间有4个标志蛋白在NHL患者血清中高表达,3个标志蛋白在NHL血清中低表达。分析系统筛选出质荷比(M/Z)4966、9278、6633、4222、9216、9237和7714标志蛋白建立NHL诊断模型,该模型对NHL的诊断灵敏度和特异性分别为92%和98%。结论:NHL与淋巴结炎组、对照组比较血清蛋白质表达具有显著差异,筛选其中差异蛋白质可用于建立NHL预测模型。
- 张志白寒松丁银环程小柯周靖泳韩丽英
- 关键词:非霍奇金淋巴瘤表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白组学
- 铜绿假单胞菌氨基糖苷类耐药基因及多基因分型研究
- 目的探讨铜绿假单胞菌氨基糖苷类耐药基因及多基因分型。方法收集本院2011年9月至2012年6月分离的多药耐药铜绿假单胞菌,采用全自动微生物鉴定/药敏测试系统鉴定菌株并获得药敏结果。利用PCR技术检测氨基糖类耐药铜绿假单胞...
- 宋敏向成玉丁银环吴泽才杨葵景翠源刘靳波
- 关键词:铜绿假单胞菌氨基糖苷类修饰酶
- 文献传递
- 胃癌血清蛋白指纹人工神经网络诊断模型的研究被引量:1
- 2012年
- 目的建立胃癌人工神经网络蛋白分子诊断模型,寻找胃癌早期诊断的新方法。方法采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及配套芯片CM10和Biomarker Wizard 3.1软件筛选胃癌差异表达蛋白,通过人工神经网络(ANN)建立并验证胃癌的SELDI分子诊断模型。结果共建立3个胃癌诊断模型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),分别为胃癌的诊断、筛查、鉴别诊断模型。选其中由5个差异表达蛋白(质荷比为2502、2544、3085、8574、8740)组成的胃癌人工神经网络诊断模型Ⅰ作为胃癌人工神经网络诊断模型,对胃癌的诊断灵敏度为95.0%,特异度为98.33%,阳性预测值为95.0%,阴性预测值为98.33%,诊断准确度为97.5%。结论 SELDI-TOF-MS技术对胃癌的早期诊断具有一定的价值,值得进一步的研究。
- 吕连华勾宗蓉王开正丁银环李圃
- 关键词:胃肿瘤神经网络模型
- 血清低分子量差异蛋白质组在食管癌诊断和分期中的作用研究
- 2011年
- 目的:研究食管癌癌变过程中血清低分子量蛋白的细微变化,探索食管癌发生的机制、寻找食管癌早期诊断的生物标志物和方法。方法:应用表面激光解析电离飞行时间质谱技术对食管癌患者和健康对照血清进行蛋白质谱指纹图谱检测,通过Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,使用人工神经网络软件建立食管癌早期诊断模型并用盲法验证其诊断效果;将食管癌早期和中晚期食管癌患者血清质谱图进行比对分析,寻找各期差异蛋白,并建立分期诊断模型。结果:发现食管癌和正常人差异蛋白5种,早期食管癌和中晚期食管癌差异蛋白3种。通过早期食管癌组和健康对照组建立早期诊断模型的灵敏度87.88%,特异度91.43%,准确度89.71%,经过盲法验证结果为灵敏度95.83%,特异度89.13%,准确度91.43%。建立的分期诊断模型中,早期食管癌和中晚期筛选的差异蛋白建立的分期诊断模型灵敏度75.76%,特异度79.17%,准确度77.19%。结论:表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)联合人工神经网络技术操作较为简便,在食管癌的诊断和分期上具有可行性。
- 任兴军谭小林杨成虎李小琼冯峰胡琼英丁银环戴天阳王开正
- 关键词:食管癌蛋白组学SELDI-TOF-MS
- 原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究被引量:6
- 2011年
- 目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及其配套的金芯片(Gold Chip)检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋白标志物并建立ANN诊断模型,验证集用于模型诊断效度的盲法验证。结果共发现7个有明显表达差异的标志蛋白。用其建立ANN诊断模型对原发性肝癌进行盲法验证,诊断的灵敏度和特异度分别为84.00%和81.25%,受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积(AUC)为0.847,阴性预测值94.20%,阳性预测值58.33%,准确度为81.90%。结论原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,据其建立的人工神经网络模型可为原发性肝癌的诊断提供新方法,有重要的参考价值。
- 胡琼英王开正谭小林李小琼丁银环严莉
- 关键词:表面增强激光解析电离飞行时间质谱人工神经网络蛋白标志物受试者工作特征曲线
- 特发性血小板减少性紫癜血小板差异蛋白质组诊断模型的实验研究
- 2013年
- 本研究旨在建立一种简便快速、灵敏度高、特异性好的特发性血小板减少性紫癜(ITP)的实验诊断方法。应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测60例ITP、60例白血病、60例再生障碍贫血及60例健康成人血小板裂解液,各疾病组及正常组均随机分为训练集(120例)和验证集(120例),筛选出有明显表达差异的标志蛋白,利用人工神经网络建立ITP诊断模型,并用SPSS 17.0进行盲法验证。结果表明,m/z为2234.30、3476.36、7526.29的蛋白在ITP患者高表达,m/z为4990.02、5152.39的蛋白低表达。诊断模型的灵敏度和特异度分别为80.6%和77.3%,盲法验证工作特征曲线下面积为0.837。结论:基于血小板蛋白质谱图建立的人工神经网络诊断模型对ITP的临床诊断和分子病理研究具有重要的参考价值。
- 周攀丁银环何鹏吴鹏强刘文军王开正
- 关键词:特发性血小板减少性紫癜SELDI-TOF-MS血小板蛋白质组学人工神经网络
- 临床检验染色通风柜
- 本实用新型公开了临床检验染色通风柜,包括柜体(1)、排风筒(2)、试剂架(4)、染色架(5)及废液收集桶(6),其中,柜体(1)前侧开口,试剂架(4)、染色架(5)及废液收集桶(6)三者由上至下依次设置且均设于柜体(1)...
- 丁银环王开正
- 文献传递
- SELDI-TOF-MS技术早期诊断乳腺癌的价值评估
- 目的乳腺癌是导致35至55岁的女性死亡的首要原因做到早期诊断对降低死亡率提高生存质量有重要意义。目前尚无理想的肿瘤标志物应用于乳腺癌早期诊断与筛查。SELDI-TOF-M S技术使大规模、超微量、高通量、全自动筛选肿瘤标...
- 丁银环王开正
- 关键词:乳腺癌META分析SELDI-TOF-MS蛋白组学
- 文献传递