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真核生物基因启动子识别: 对生物学家得到的海量数据进行有效的分析和利用是后基因组时代人们所面临的巨大挑战.其中,对DNA序列的分析具有着举足轻重的地位,它对于人们了解遗传信息的传递机制和认识复杂的基因调控网络,从而进一步探索各种遗传疾病的基因治疗...; 马小土; 关键词：真核生物基因启动子转录因子结合位点语言学

隐半马氏模型在 3′剪接位点识别中的应用(英文)被引量：2: 2004年; 新近的基因识别软件比先前的软件有着显著的提高 ,但是在外显子水平上的敏感性和特异性仍然不十分令人满意 .这是因为已有软件对于剪接位点 ,翻译起始等生物信号位点的识别还不够有效 .如果能够分别提高这些生物信号位点的识别效果 ,就能够提高整体的基因识别效率 .隐半马氏模型能够很好地刻画 3′剪接位点 (acceptor)的结构 .据此开发的一套对acceptor进行识别的算法在Burset/Guigo的数据集上经过检验 ,获得了比已有算法更好的识别率 .该模型的成功还使得我们对剪接点上游的分支位点和嘧啶富含区的概貌有了一定的认识。; 冯秀程钱敏平邓明华马小土严熙婷; 关键词：剪接 EM算法

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马小土