陶洁
- 作品数:75 被引量:180H指数:7
- 供职机构:上海市农业科学院更多>>
- 发文基金:上海市科技兴农重点攻关项目引进国际先进农业科技计划江苏高校优势学科建设工程资助项目更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 上海地区猪星状病毒流行监测及病原生物学特性研究
- 李本强陶洁程靖华马玉飞刘雷刘惠莉
- 猪7种腹泻相关病毒的临床检测及猪嵴病毒的遗传进化分析被引量:21
- 2017年
- 为了解引起猪腹泻疫病的病毒性病原种类及感染现状,本研究首先针对7种报道较少但可引起猪腹泻的病毒性病原建立了多重RT-PCR检测方法,包括猪捷申病毒(PTV)、猪萨佩罗病毒(PSV)、猪丁型冠状病毒(PDCo V)、猪嵴病毒(PKV)、猪札幌病毒(PSa V)、猪星状病毒(PAst V)和猪环曲病毒(PTo V)。利用该方法对419份临床腹泻粪便样品进行筛检,结果显示PKV检出率最高,阳性率达26.98%–45.79%;PKV和其他病原混合感染率达9.52%–18.54%。基于PKV的高检出率及其可能在猪腹泻疾病中发挥的作用,本试验进一步选取3个PKV阳性样品进行全基因组序列测定及遗传进化分析。结果表明,这3个阳性样品PKV均归属于猪嵴病毒属,且与其他动物嵴病毒遗传距离较远,分别标记为CM-PKV、JS-PKV和PD-PKV;它们的全基因组同源性为88.1%–89.1%;CM-PKV与2013年报道的中国株JS-02a-CHN/2013同源性最高,而JS-PKV和PD-PKV则与2008年报道的匈牙利株K-30-HUN/2008/HUN同源性最高。表明上海不同地区猪群中存在的PKV有明显的遗传差异,但毒株遗传特性的差异与其致病力的相关性需进一步研究。本研究为深入了解PKV的流行现状及探讨其在猪腹泻疫情中的作用提供了参考。
- 孟丽陶洁李本强马玉飞程靖华张春玲刘惠莉
- 关键词:多重RT-PCR全基因组序列遗传进化分析
- 猪流行性腹泻病毒S2蛋白间接ELISA检测方法的建立与应用被引量:3
- 2021年
- 本研究基于猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)S2截短蛋白,建立了特异性Ig G抗体的间接ELISA检测方法,用于临床PEDV特异性抗体水平的监测。前期筛选了富含中和表位的S2截短基因,体外表达后作为ELISA包被抗原,用于捕获PEDV Ig G抗体,以山羊抗猪HRP-Ig G作为二抗,通过条件优化,建立了检测猪血清中PEDV Ig G抗体的间接ELISA方法。最佳反应条件为:S2抗原蛋白的最佳包被浓度为2μg/m L,临床血清样品和酶标二抗的最佳稀释倍数分别为1∶400和1∶20000。该方法的批内和批间重复变异系数(CV)分别为1.81%~8.52%和1.18%~7.41%,重复性较好;该方法检测猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪瘟病毒(CSFV)及牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的阳性血清时结果均为阴性,特异性较强。该方法与商品化PEDV抗体检测试剂盒相比较,阳性符合率为95.18%,阴性符合率为91.43%,说明该方法可用于临床血清抗体筛查。进一步利用此方法对324份猪的临床血清样品进行检测,发现PEDV抗体阳性血清占62.96%,与临床现状基本吻合。上述结果表明,该方法适用于临床猪群中PEDV Ig G抗体水平普查,为PEDV的疫病防控及灭活疫苗评价提供了有效的技术支持。
- 王亚涛王亚涛陶洁程靖华李本强刘惠莉
- 关键词:猪流行性腹泻病毒间接ELISAIGG
- 犬流感病毒、犬冠状病毒和犬呼肠孤病毒的三重PCR检测方法
- 一种犬流感病毒、犬冠状病毒和犬呼肠孤病毒的三重PCR检测方法,包括:1)查找犬流感病毒CIV、犬冠状病毒CCOV和犬呼肠孤病毒CRV的保守区序列;2)根据GenBank上公布的CIV病毒的M基因、CCOV病毒的L1基因和...
- 刘惠莉石迎陶洁李本强程靖华
- 一种猪萨佩罗病毒细胞株、其培养方法及应用
- 一种猪萨佩罗病毒毒株、其培养方法及应用,名称为PSV2019CM,于2021年11月1日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCCNO.V202175,全长为7,567bp,具有一个长度为6,996bp的ORF,该...
- 刘惠莉李本强李娜娜陶洁程靖华石迎乔长涛
- 猪瘟疫苗中牛病毒性腹泻病毒2型的检测被引量:7
- 2012年
- 为对上海某猪场送检的一份猪瘟疫苗进行牛病毒性腹泻病毒(BVDV)检测,本研究将猪瘟疫苗样品接种于MDBK细胞,盲传15代后仍无致细胞病变效应,但间接免疫荧光试验表明接种该疫苗后的MDBK细胞能够被单克隆抗体BZ-53(BVDV-2)识别。采用BVDV-1和BVDV-2的5'-UTR的通用检测引物和针对BVDV E2的引物,对样品RNA进行RT-PCR检测,结果显示,样品能够扩增出约288 bp的BVDV特异性片段;此外,5'-UTR和E2基因片段的测序分析结果表明分离株属于BVDV-2,并且其E2基因与牛源XJ-04株(BVDV-2)的E2基因同源性最高(92.3%),而与猪源ZM-95株(BVDV-1)的E2基因同源性较低(64.5%)。由此证明,该猪瘟疫苗中的确污染有一株BVDV-2株。
- 陶洁王银王娟周虹李艳莉朱国强
- 关键词:猪瘟疫苗RT-PCR
- 一种猪瘟口服弱毒冻干疫苗、其制备方法及冻干保护剂
- 本发明公开了一种猪瘟口服弱毒冻干疫苗、其制备方法及冻干保护剂,所述猪瘟口服弱毒冻干疫苗包括抗原猪瘟病毒、黏膜佐剂和冻干保护剂,其中,冻干保护剂包括:1~3%明胶,1~3%甘氨酸,余量为水;该猪瘟口服弱毒冻干疫苗能较好的保...
- 刘惠莉陶洁饶柏钟
- 文献传递
- 猪德尔塔冠状病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用被引量:3
- 2022年
- 猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)作为一种新型的猪肠道腹泻病毒,建立快速有效的检测手段十分必要。本研究根据PDCoV N基因中的保守序列设计了1对特异性引物,PCR扩增后克隆至pEASY-Blunt Zero载体,构建了阳性质粒pEASY-PDCoV/N。以阳性质粒pEASY-PDCoV/N为模板,建立了检测PDCoV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法,并对其敏感性、特异性和重复性等进行了优化与验证。结果显示,C_(1)值与标准模板在5.83×10^(7)~5.83×10^(1)copies/μL范围内呈良好的线性关系,相关系数(R^(2))为0.999,线性方程的斜率为-3.323,最低检测限度为5.83×10^(1)copies/μL。该方法特异性和重复性均较好,对PEDV、PRV、TGEV等病毒均未出现检测信号,批内和批间变异系数分别小于1%和2%。利用建立的PDCoV荧光定量PCR检测方法对60份猪腹泻样品进行核酸检测,阳性率为18.3%,比普通PCR检出率高6.7%。结果表明,该方法可适用于临床快速检测PDCoV,为该病的预防和控制提供技术支持。
- 张景连李本强陶洁石迎程靖华乔长涛刘惠莉
- 关键词:N基因荧光定量PCR
- 肉鸽肠道微生物菌群差异分析和抗生素耐药基因预测
- 2023年
- 本研究旨在利用宏基因组学深入分析上海某鸽场青年鸽(RP)和产鸽(LP)粪便样品的微生物菌群差异。结果显示,肉鸽肠道菌群的优势菌门为厚壁菌(Firmicutes)、变形菌(Proteobacteria)和放线菌(Actinobacteria)。RP组中双歧杆菌(Bifidobacterium)、棒状杆菌(Corynebacteriun)、嗜冷杆菌(Psychrobacter)、链球菌属(Streptococcus)含量显著高于LP组,而LP组金黄色葡萄球菌属(Staphyloccus)、短状杆菌属(Brachybacterium)、库特氏菌属(Kurthia)和埃希氏菌属(Escherichia)含量显著高于RP组。LEfSe分析显示,LP和RP组的差异表达基因主要富集于5个KEGG通路。抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)鉴定显示,肉鸽体内存在198种ARGs,其中多重耐药类ARGs流行率40%以上,说明该场肉鸽抗生素耐药情况较严重。本研究为后续深入研究肠道菌群与健康养殖、抗生素耐药机制等提供了科学数据。
- 陶洁李本强李本强石迎程靖华刘惠莉
- 关键词:肉鸽宏基因组学肠道菌群
- 猪流感病毒NS1蛋白关键磷酸化位点对其拮抗干扰素的影响
- 程靖华陶洁李本强张春玲刘惠莉