邱显钦
- 作品数：94 被引量：372H指数：14
- 供职机构：云南省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学建筑科学轻工技术与工程更多>>
- 云南峨眉蔷薇天然群体的表型多样性被引量：16
- 2009年
- 为了从数量上分析峨眉蔷薇(Rosa omeiensis Rolfe)天然居群表型性状在居群间和居群内的变异,对分布在云南的9个峨眉蔷薇天然居群的11个表型性状进行了测量和比较分析。结果表明,11个性状群体间和群体内的F值均达到极显著水平,说明峨眉蔷薇表型性状在群体间和群体内存在着极其丰富的变异。11个性状群体平均表型分化系数为73.55%,群体间变异(50.65%)大于群体内变异(17.81%),说明群体间变异是峨眉蔷薇表型性状的主要变异来源。利用群体间欧氏距离进行的UPGMA聚类分析结果表明,9个天然群体可以划分为3类,群体间的遗传距离关系与群体采种点的生态地理位关系基本上一致。
- 周宁宁唐开学邱显钦蹇洪英李树发王其刚张颢
- 关键词：表型多样性
- DNA分子标记在月季中的应用被引量：7
- 2006年
- 遗传标记的发展促进了植物遗传育种的研究,DNA分子标记是继形态标记、细胞学标记、生化标记之后发展起来的一种新的更为理想的遗传标记,它在月季遗传育种研究方面发挥了重要作用。DNA分子标记包括限制性片断长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片断长度多态性(AFLP)、简单重复序列(SSR)、单核苷酸多态性(SNP)等。对DNA分子标记的分类、原理、特点及其在月季亲缘关系分析、基因定位、品种鉴定和遗传图谱的构建等方面的研究进行概述。
- 邱显钦鄢波唐开学张颢李树发
- 关键词：月季分子标记RFLPRAPDAFLP基因定位
- 云南悬钩子蔷薇NBS-LRR类抗病基因同源克隆与分析被引量：6
- 2012年
- 为研究云南野生蔷薇属中的NBS类抗病基因,根据已知抗病基因NBS-LRR序列中的保守区域设计简并引物,利用RT-PCR技术从云南悬钩子蔷薇中进行体外扩增,获得了对应区域的cDNA片段,回收、克隆这些特异片段,测序分析,共得到4个含有NBS-LRR保守结构域的抗病基因同源序列(RGAs),分别命名为AC9、AC39、AC50和AC68。它们与已报道的11个NBS类抗病基因相应区段的氨基酸序列相似性为5.4%～79.2%,其中这4个RGAs片段与Mi、RPS2、Pib和RPM1基因聚为一类。表明这4条RGAs序列可进一步用作悬钩子蔷薇抗病候选基因的分子筛选及遗传图谱的构建。
- 陈玲张颢邱显钦晏慧君王其刚蹇洪英唐开学
- 关键词：抗病基因同源序列
- 大花香水月季天然群体表型多样性研究被引量：15
- 2010年
- 以大花香水月季的8个天然群体为研究对象,进行了其表型多样性的分析。结果表明：大花香水月季表型性状存在着丰富的群体间、群体内变异,8个群体的11个表型性状差异显著,变异系数为15.44%~56.00%;平均表型分化系数为37.28%,总变异中群体内的变异为62.72%,大于群体间变异（37.28%）,说明群体内的变异是该地区大花香水月季的主要变异来源。花瓣长与东经及果径与北纬呈显著负相关,其他性状与地理因子的相关性均不显著。利用群体间欧式距离进行的UPGMA聚类分析表明,8个大花香水月季天然群体可以明显划分为3类,说明性状的表型特征并没有依地理距离而聚类。
- 邵珠华李名扬邱显钦唐开学蹇洪英李树发王其刚张颢
- 关键词：表型多样性
- 月季丁香酚合成酶基因RhEGS1的克隆及表达分析被引量：6
- 2012年
- 【目的】克隆月季丁香酚合成酶基因RhEGS1的全长cDNA序列,分析其序列及表达特征,并对该基因编码的蛋白进行原核表达分析,为深入探讨丁香酚合成酶的生化特性奠定基础。【方法】根据已发表的其它植物EGS基因序列的保守结构域设计简并引物,结合RACE技术,获得RhEGS1的全长cDNA序列,并进行生物信息学分析;利用半定量RT-PCR对不同组织及不同花发育时期RhEGS1进行表达分析。采用Gateway克隆技术,构建原核表达载体,并进行原核蛋白表达。【结果】月季RhEGS1的cDNA全长为1 207 bp,包含一个927 bp的ORF,编码309个氨基酸。同源序列比对发现RhEGS1与仙女扇的CbEGS2有83.87%的同源性,与矮牵牛PhEGS1具有81.55%同源性。表达谱分析表明,RhEGS1主要在雄蕊中表达,且在花盛开期表达最强,而在花蕾期及凋谢期表达较弱。原核表达分析发现,在37℃、0.5 mmol.L-1IPTG诱导4 h后,携带RhEGS1 ORF的原核表达载体在大肠杆菌中生成了大量的分子量约为35 kD的蛋白质,其分子量大小与预测的理论值相一致。【结论】从月季雄蕊中克隆到丁香酚合成酶基因RhEGS1,具有EGS基因的结构特征和完整的编码框,且在盛开期雄蕊中表达量最高。
- 晏慧君张颢蹇洪英王其刚邱显钦张婷唐开学
- 关键词：月季RT-PCR原核表达
- 月季抗白粉病基因RhMLO的亚细胞定位及功能分析被引量：5
- 2017年
- MLO是一类新发现的抗病基因,一些双子叶植物隐性突变的mlo基因使其获得了广谱高抗的抗病性。通过生物信息学分析结合亚细胞定位试验,对前期克隆获得的月季MLO进行亚细胞定位,结果表明,RhMLO1和RhMLO2均为主要分布于细胞质膜、液泡膜和细胞核的跨膜蛋白,与预测结果相符。构建了RhMLO1的正义表达载体,通过农杆菌介导法对月季‘白玉’植株体细胞胚进行遗传转化。利用PCR法和荧光定量PCR法对转基因植株进行分子检测,表明基因已经整合到转基因植株中。分别利用离体鉴定法和显微镜观察法对转基因植株和对照植株进行对白粉病菌(Podosphera pannosa)抗性鉴定,结果一致显示:正义载体的导入降低了转基因植株对白粉病的抗性。
- 邱显钦王其刚蹇洪英晏慧君李淑斌陈敏周宁宁唐开学张颢
- 关键词：月季白粉病MLO亚细胞定位功能分析
- 月月粉TGAs基因结构及RcTGA2抗灰葡萄孢菌功能分析被引量：1
- 2021年
- TGA(TGACG motif-binding factor)转录因子是bZIP转录因子家族中重要的一组,对植物病原菌侵染具有广谱抗性。本研究鉴定了月月粉月季(Rosa chinensis Jacq.Old Blush)TGA家族成员,并对其理化性质、亚细胞定位、进化特征和表达模式进行分析。鉴定获得7个RcTGAs,均包含bZIP1(cl21462)和DOG1(pfam14144)的保守结构域,氨基酸大小为324-545aa,分子量在36.68-60.17KD之间,等电点在5.52-8.96之间,二级结构主要为α-螺旋,均为亲水性蛋白,主要位于细胞核内。进化分析将来自月月粉月季、拟南芥(Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.)、野草莓(Fragaria vesca L.)、水蜜桃(Prunus persica(L.)Batsch)、苹果(Malus domestica(Suckow)Borkh.)的TGAs分为6个亚组。qPCR实验表明,灰葡萄孢菌侵染月季花瓣RcTGA4表达量无显著变化,RcTGA6随侵染时间的延长表达量呈下降趋势。RcTGA1/2表达呈显著上升的趋势,RcTGA5/7呈现先上升后下降的趋势,表明RcTGA1/2/3/5/7可能在月季-灰霉菌互作过程中发挥了重要作用,这5个基因可作为进一步抗病研究和功能分析的候选基因。通过VIGS沉默RcTGA2基因,灰葡萄孢菌侵染48 h后,月季花瓣病斑直径显著增大,表明RcTGA2与月季对灰葡萄孢菌的抗性有关。
- 高鹏华张颢晏慧君陈宇春范元兰鄢波邱显钦
- 关键词：灰葡萄孢菌生物信息学分析实时荧光定量PCRVIGS
- 八个蔷薇属种质资源的核型分析被引量：4
- 2021年
- 以亮叶月季等8个特异性状的蔷薇属种质资源为试材,采用去壁低渗法进行了染色体数目和核型研究,以期为现代月季品种进行种质创新和遗传改良提供细胞遗传学参考依据。结果表明:1)不同资源的染色体数目差异较大,半重瓣丽江蔷薇、亮叶月季、无刺的木香花、“苦水玫瑰”、黄刺玫为二倍体(2n=2x=14);中国古老月季品种“淡黄香水月季”为三倍体(2n=3x=21);食用玫瑰“滇红”为四倍体(2n=4x=28);狗蔷薇为五倍体(2n=5x=35);2)8个资源的核不对称系数变化范围在59.1%~66.9%,均未观察到随体的存在;3)重瓣丽江蔷薇、“淡黄香水月季”“滇红”、狗蔷薇的核型均为2B;重瓣木香花和黄刺玫的核型均为2A;“苦水玫瑰”的核型为1A;亮叶月季的核型为3A。
- 曹世睿张婷王其刚邱显钦马长乐蹇洪英
- 关键词：蔷薇属染色体倍性核型
- 云南大花香水月季居群遗传多样性的SSR分析被引量：15
- 2011年
- 利用简单重复序列（simple sequence repeat，SSR）分子标记技术对云南省分布的8个大花香水月季天然居群遗传性进行了分析，结果表明：所选用的12对SSR引物，共扩增出72个位点，其中多态性位点70个，占总条带数的97．22％；在物种水平上，总居群的Nei’s基因多样性指数（He）和香农指数（I）分别为0．3012和0．4600，说明云南地区大花香水月季居群的遗传多样性较高；大花香水月季居群内遗传变异（69．49％）大于居群间遗传变异（30．51％），说明居群内变异是其居群的主要变异来源；利用Popgene计算出两两居群间的Nei＇s遗传一致度（I）和遗传距离（D），其范围分别为0．7615～O．9348和0．0674～O．2724，再依据遗传距离进行聚类分析，结果表明居群遗传距离与地理位置无显著的相关性。
- 邱显钦唐开学蹇洪英王其刚李树发邵珠华张颢
- 基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析被引量：1
- 2018年
- 在对长尖叶蔷薇和大花香水月季转录组测序的基础上,利用生物信息学方法,从其转录组数据中共获得23条MLO unigenes并对其进行了分析。结果显示它们之间的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,多数为疏水性蛋白,平均亲水系数为-0.157~0.190,富含亮氨酸和丝氨酸。亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5~9个跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋组成。其中,等电点小于7的仅有1条,2条蛋白具有信号肽。这23条MLO蛋白具有15个长度在15~50个氨基酸间的保守基序。它们的系统进化关系分析结果揭示了MLO基因在长尖叶蔷薇与大花香水月季间具有较高的同源性和保守性。将这23条unigenes与来自于月季和拟南芥的MLO基因进行聚类分析,确定了6条可能参与抗白粉病的候选基因,对这6条候选基因进一步分析发现仅有2条unigenes符合MLO型白粉病基因的典型结构特征。最后,通过q RT-PCR试验验证,结果表明:这2条候选基因的相对表达量,在受到白粉病菌侵染后呈积极上调趋势。上述研究结果表明这2条候选基因很可能参与了寄主—白粉病菌的互作过程。
- 向贵生张颢王其刚王其刚周宁宁晏慧君唐开学周宁宁
- 关键词：MLO基因抗白粉病生物信息学QRT-PCR
