禹胄
- 作品数：5 被引量：7H指数：1
- 供职机构：北京大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：北京市科委基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 原核生物基因组序列装配辅助系统
- ＜正＞ 霰弹法是目前原核生物基因组全序列测定的常用方法。该方法最耗时的步骤是将经过初步装配得到的重叠连续群（简称叠连群,contig）连接起来,完成全序列测定。为此,我们开发了原核生物基因组序列装配辅助系统(prokar...
- 禹胄李涛赵进东罗静初
- 文献传递
- 原核生物基因组拼接辅助系统PGAAS和微生物基因组注释工具包MGAP
- 随着微生物全基因组序列测定速率的加快,有必要开发和集成基于PC／Linux系统并以免费数据库管理系统、免费软件和公共数据库资源为主的基因组信息注释系统.为此,我们开发了微生物基因组注释系统（Microbial Genom...
- 禹胄
- 关键词：鸟枪法基因组学基因组注释蓝细菌
- 微生物基因组注释系统MGAP被引量：7
- 2003年
- 利用生物信息学方法和工具开发了微生物基因组注释系统 (Microbialgenomeannota tionpackage ,MGAP) ,并用于蓝细菌PCC70 0 2的基因组注释。该系统由基因组注释系统和基于Web的用户接口程序两部分组成。基因组注释系统整合多个基因识别、功能预测和序列分析软件 ;以及蛋白质序列数据库、蛋白质资源信息系统和直系同源蛋白质家族数据库等。用户接口程序包括基因组环状图展示、基因和开放读码框在染色体上的分布图 ,以及注释信息检索工具。该系统基于PC微机和Linux操作系统 ,用MySQL作数据库管理系统、用Apache作Web服务器程序 ,用Perl脚本语言编写应用程序接口 ,上述软件均可免费获得。
- 禹胄李涛蔡涛赵进东罗静初
- 关键词：微生物基因组基因组注释生物信息学蓝细菌
- 钝顶螺旋藻对ＳＯ〈，２〉的吸收作用
- 禹胄施定基
- 关键词：钝顶螺旋藻二氧化硫大气污染物酸雨
