白大章
- 作品数:8 被引量:6H指数:2
- 供职机构:石河子大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国际科技合作与交流专项项目国家重点基础研究发展计划更多>>
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- 中国美利奴绵羊MHC ClassⅡb区段349Ⅰ12 BAC克隆基因组成与结构分析
- 旦的:用插有中国美利奴绵羊(新疆军垦型)MHC ClassⅡb区genomic DNA的349I12 BAC克隆制备32P标记的放射性探针,进行噬菌体原位杂交筛选由中国美利奴绵羊(新疆军垦型)外周免疫器官组织构建的cDN...
- 白大章
- 关键词:CDNA表达文库生物信息学分析
- 文献传递
- 绵羊基因组MHCClassⅢ区段部分基因的分离与鉴定
- 2012年
- 绵羊基因组MHC段分为ClassⅠ、ClassⅢ和ClassⅡ(含Ⅱa和Ⅱb两个亚区)3个区段,与另外2个区段相比,ClassⅢ区的基因信息远少于ClassⅠ和ClassⅡ区.为丰富绵羊基因组MHC ClassⅢ区段基因信息.本研究用位于中国美利奴羊基因组BAC文库中MHC ClassⅢ区段4个BAC克隆的酶切片段制备32P标记探针,继而采用噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库,并对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定及生物信息学分析.本实验共筛选出31个cDNA阳性克隆,对其序列进行了测定及分析,确定了序列在ClassⅢ区段上的位置,并通过在NCBI中的同源检索对其功能做了初步鉴定.由实验可知,利用BAC文库与cDNA文库杂交筛选法对较大区段基因的筛选和分离是有效的.同时,对分离到的表达序列结合生物信息学进行分析,这将有助于对该序列功能的深入研究.
- 杨小亮高剑峰白大章邱巍董慧芹李大全陈芳马润林Hugh T Blair
- 关键词:CDNA文库
- 中国美利奴绵羊MHC ClassⅡb区349I12 BAC克隆插入片段基因组成与结构分析被引量:1
- 2011年
- 利用已测序的中国美利奴绵羊细菌人工染色体(BAC)文库MHC区段阳性克隆插入片段制备探针,筛选中国美利奴绵羊(新疆军垦型)混合组织cDNA文库,以期获得该MHC片段的基因组成与结构信息。用中国美利奴绵羊MHC ClassⅡb区域内的349I12 BAC克隆,BsaJⅠ酶切后制备α-32P放射性探针,以噬菌斑原位杂交筛选正常中国美利奴绵羊cDNA文库,并将分离所得的cDNA阳性克隆测序后进行基因结构分析。以349I12 BAC克隆制备探针经过两轮的噬菌斑原位杂交筛选,获得19个cDNA阳性克隆,经测序、比对等进一步分析确定获得17条不同序列,其中7条序列与免疫相关。绵羊20号染色体上的MHC区段包含表达序列,且多为断裂基因,对其基因结构的分析将有助于相应基因功能及调控方面的研究。
- 白大章李桂芳董慧芹邱巍杨小亮陈芳马润林高剑峰
- 关键词:CDNA表达文库
- 中国美利奴绵羊MHC 222G18 BAC克隆的基因筛选与结构分析
- 2011年
- 绵羊主要组织相容性复合体(MHC)是与控制绵羊抗病性和易感性紧密连锁的基因簇。为了深入了解该类基因的组成与结构,利用中国美利奴绵羊细菌人工染色体(BAC)文库MHC区段克隆222G18,经BsaJⅠ酶切后制备α-32P放射性探针,通过噬菌斑原位杂交技术筛选中国美利奴绵羊cDNA文库,经过两轮杂交筛选,获得12个cDNA阳性克隆,经测序、比对等生物信息学分析确定获得7条与免疫相关的序列,其中3条具有完整的编码序列。利用SIM4软件将7条序列定位到BAC克隆上,结果显示绵羊MHC区段的表达序列多为断裂基因且跨度很大,可能是形成其基因多样性的重要原因之一。
- 邱巍董慧芹白大章陈芳马润林高剑峰
- 关键词:主要组织相容性复合体细菌人工染色体CDNA文库
- 中国美利奴绵羊MHCClassⅡb区段349I12BAC克隆基因组成与结构分析
- 目的:用插有中国美利奴绵羊(新疆军垦型)MHC ClassⅡb区genomic DNA的349I12 BAC克隆制备32P标记的放射性探针,进行噬菌体原位杂交筛选由中国美利奴绵羊(新疆军垦型)外周免疫器官组织构建的cDN...
- 白大章
- 关键词:细菌人工染色体CDNA表达文库生物信息学分析
- 文献传递
- 中国美利奴绵羊55L9 BAC克隆基因的筛选与序列的初步分析被引量:2
- 2011年
- 利用绵羊55L9 BAC(细菌人造染色体)克隆制备探针,采用噬菌斑原位杂交方法,从中国美利奴细毛羊cDNA文库中筛选与免疫相关的基因,并对筛选得到的候选基因进行测序及软件分析。初步筛出12个候选阳性克隆。经过测序和比对,推测有8个独立的序列可能与绵羊的免疫及疾病相关,其中2个基因可以在已提交的BAC序列中定位。
- 董慧芹李峰白大章杨晓亮陈芳高剑峰
- 关键词:CDNA文库
- 黑腿星翅蝗(Calliptamus barbarus)消化道组织结构观察被引量:3
- 2010年
- 应用常规石蜡切片法,H·E染色,在光学显微镜下对黑腿星翅蝗(Calliptamus barbarus)消化道组织结构进行了观察。结果表明,黑腿星翅蝗消化道壁由内向外的组织结构是:最内层为几丁质内膜或围食膜,然后依次为上皮层(肠壁细胞层)、基膜、环肌层、纵肌束和围膜。其中前肠和直肠的最内层具有非细胞结构的几丁质内膜,中肠则具有非细胞结构的围食膜,直肠部位具有6个直肠垫。消化道的组织学结构与蝗虫的一般结构相似。
- 白大章全仁哲
- 关键词:消化道石蜡切片组织学观察
- 以绵羊MHC区段BAC克隆酶切片段为探针杂交筛选绵羊混合组织cDNA文库
- 2012年
- 在已知中国美利奴羊MHC(Major histocompatibility complex)区段BAC(Bacterial artificial chromosome)克隆序列信息和预测的基因注释前提下,用位于中国美利奴羊基因组BAC文库MHC区段的6个BAC克隆酶切片段为探针,以噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库(库库杂交),对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定,并与相应的已知序列信息和基因注释的BAC克隆比对以及在NCBI Blastn数据库中序列相似性检索,旨在验证基因注释结果的准确性和对基因(序列)功能的初步分析。实验中,经过两轮杂交共筛选出27个cDNA阳性克隆(序列),并发现这些序列均可定位到相应的BAC克隆上,且25条序列处在注释基因的外显子部分;在NCBI数据库中经Blastn序列相似性检索发现,23条序列与牛基因的序列相似性最高,且与免疫功能密切相关。
- 杨小亮白大章邱巍董慧芹李大全陈芳马润林Hugh T Blair高剑峰
- 关键词:CDNA文库