滕莉
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 供职机构：复旦大学信息科学与工程学院计算机科学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 一种基于主集分割的基因芯片聚类算法被引量：1
- 2005年
- 聚类算法广泛应用于生物芯片数据分析中,用于寻找表达相似的基因或样本.大多数已有算法都需要人为地给出一些参数,然而在没有先验知识的情况下,人为地确定这些参数是十分困难的.为了解决这一难题,提出了一种迭代的聚类算法.首先用主集方法对原有基因进行重新排序,使高度相似的基因排列在特定区域.类的分割界线通常难于确定.提出一种标准,根据类内元素间的距离远小于类外元素间的距离的性质,从排序后的数据集中划分出一个类.将找到的类从当前数据集中排除以后,对剩下的数据重复以上处理,直到满足所提出的循环停止条件为止.从多方面分析了该算法的性能,并将该算法应用于酵母细胞周期的芯片表达谱数据聚类.理论分析和应用结果都表明,该算法是实用、有效的,并且有很好的抗噪性能.
- 滕莉付旭平李宏宇李瑶陈文斌李荣宇沈一帆
- 关键词：基因芯片聚类排序
- cDNA芯片应用在急性白血病研究中的初步探索被引量：2
- 2004年
- 基因芯片技术对肿瘤基因组学的研究提供了一种高效的手段 .采用基因芯片技术观察了 14例初发急性髓系白血病患者 12 80 0条基因的表达谱 ,找到了一些和白血病发生有密切关系的基因 .用表达谱的聚类方法分析难治性白血病的基因表达特征 ,发现一些与耐药相关的基因在难治性白血病人和易治性白血病人中表达有明显不同 ,证明难治性白血病与耐药有一定关系 .
- 魏庆刘敏陈莉付旭平沈卫文孙美倩王玉滕莉王健民李瑶
- 关键词：CDNA芯片急性髓性白血病
- 基于数据挖掘聚类算法的基因芯片数据分析
- 本论文探讨了基因芯片数据分析目的和困难、分析了数据处理的步骤、从理论和应用上对多种常用算法进行了比较，并在以往研究的基础上给出了方法和理论上的创新。
第一章首先介绍了课题研究的背景知识;第二章介绍和分析了基因芯片数...
- 滕莉
- 关键词：基因芯片数据分析数据挖掘聚类算法生物信息学
- 文献传递
